74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3368 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3368  transposase  100 
 
 		 171 aa  357  5e-98  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.863098  normal  0.131145 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3203  hypothetical protein  42.59 
 
 		 173 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.936957 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3353  protein of unknown function DUF1568  30.13 
 
 		 181 aa  84  9e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.231762 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4549  hypothetical protein  31.55 
 
 		 181 aa  79.7  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.86188 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2065  hypothetical protein  31.41 
 
 		 184 aa  78.6  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3712  hypothetical protein  29.49 
 
 		 177 aa  72  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013542 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1676  hypothetical protein  28.86 
 
 		 157 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0450  transposase  34.88 
 
 		 141 aa  65.1  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0885  protein of unknown function DUF1568  24.54 
 
 		 169 aa  59.3  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12790  transposase  33.02 
 
 		 241 aa  51.6  0.000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0793  hypothetical protein  28.93 
 
 		 314 aa  51.6  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4538  protein of unknown function DUF1568  29.17 
 
 		 251 aa  50.1  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0855967  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3049  transposase and inactivated derivatives  27.14 
 
 		 226 aa  50.4  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1724  hypothetical protein  30 
 
 		 248 aa  49.3  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1725  hypothetical protein  30 
 
 		 248 aa  49.3  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2213  hypothetical protein  25.45 
 
 		 321 aa  48.1  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.809495  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2563  hypothetical protein  29.37 
 
 		 176 aa  48.1  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000213064  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3020  hypothetical protein  27.07 
 
 		 316 aa  47  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1929  protein of unknown function DUF1568  26.09 
 
 		 321 aa  47  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0722  protein of unknown function DUF1568  25 
 
 		 321 aa  47  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.645218  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0595  hypothetical protein  28.23 
 
 		 258 aa  47  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.217159  hitchhiker  2.03187e-17 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2264  transposase and inactivated derivatives  29.03 
 
 		 323 aa  47  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.88974  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1425  hypothetical protein  25.86 
 
 		 321 aa  46.6  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1427  hypothetical protein  25.86 
 
 		 321 aa  46.6  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2336  protein of unknown function DUF1568  23.62 
 
 		 324 aa  46.2  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1872  hypothetical protein  29.27 
 
 		 277 aa  46.2  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1384  hypothetical protein  24.67 
 
 		 180 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.705846 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2204  hypothetical protein  24.55 
 
 		 327 aa  45.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2205  hypothetical protein  24.32 
 
 		 160 aa  45.8  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2233  hypothetical protein  24.55 
 
 		 321 aa  45.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2237  hypothetical protein  24.55 
 
 		 321 aa  45.8  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2246  hypothetical protein  24.55 
 
 		 321 aa  45.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3286  protein of unknown function DUF1568  30.43 
 
 		 214 aa  45.4  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00118326  unclonable  0.0000000135739 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0164  transposase  24.6 
 
 		 287 aa  45.4  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0743928  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01210  transposase  29.31 
 
 		 245 aa  45.4  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0682  hypothetical protein  27.42 
 
 		 232 aa  45.1  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.349284  normal  0.584525 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2333  protein of unknown function DUF1568  21.26 
 
 		 324 aa  45.1  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1356  protein of unknown function DUF1568  24.55 
 
 		 321 aa  45.1  0.0005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0875577  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3016  hypothetical protein  27.43 
 
 		 312 aa  44.3  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2620  hypothetical protein  31.15 
 
 		 254 aa  44.3  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000852823  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2607  protein of unknown function DUF1568  23.4 
 
 		 186 aa  43.5  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.407993  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0397  protein of unknown function DUF1568  28.18 
 
 		 304 aa  43.5  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000164254  normal  0.853679 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2835  hypothetical protein  25.53 
 
 		 191 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1386  protein of unknown function DUF1568  23.44 
 
 		 325 aa  43.9  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1319  protein of unknown function DUF1568  25.23 
 
 		 319 aa  43.9  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0490388  hitchhiker  0.00690567 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1356  hypothetical protein  29.46 
 
 		 319 aa  44.3  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.895893  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1506  protein of unknown function DUF1568  23.42 
 
 		 321 aa  43.5  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0179  hypothetical protein  29.86 
 
 		 254 aa  43.5  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0565655  normal  0.576766 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0925  protein of unknown function DUF1568  25.19 
 
 		 336 aa  42.7  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2265  transposase and inactivated derivatives  28.57 
 
 		 241 aa  43.5  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1512  hypothetical protein  24.79 
 
 		 222 aa  42.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.656335 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1782  protein of unknown function DUF1568  21.55 
 
 		 325 aa  43.1  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0188832 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1888  hypothetical protein  26.62 
 
 		 171 aa  43.5  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.17258  hitchhiker  0.00842787 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0033  hypothetical protein  23.44 
 
 		 235 aa  43.1  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1620  hypothetical protein  26.79 
 
 		 313 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1055  transposase  27.19 
 
 		 250 aa  43.1  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2086  hypothetical protein  29.57 
 
 		 321 aa  43.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.464464  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1967  hypothetical protein  25.38 
 
 		 226 aa  42.7  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00827335  normal  0.496503 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2530  hypothetical protein  24.84 
 
 		 179 aa  42.4  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1552  protein of unknown function DUF1568  23.48 
 
 		 230 aa  42.7  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.268269 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3485  hypothetical protein  32.26 
 
 		 260 aa  42.4  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.36702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0917  protein of unknown function DUF1568  23.7 
 
 		 221 aa  42.4  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0950  hypothetical protein  26.79 
 
 		 321 aa  42  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000190963  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3248  protein of unknown function DUF1568  28.18 
 
 		 181 aa  42  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00178625  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2192  hypothetical protein  28.95 
 
 		 253 aa  42.4  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107555  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0770  protein of unknown function DUF1568  26.79 
 
 		 316 aa  42  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.717082  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1558  protein of unknown function DUF1568  24.79 
 
 		 230 aa  41.6  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.55731 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1151  protein of unknown function DUF1568  26.61 
 
 		 231 aa  41.6  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4462  hypothetical protein  22.15 
 
 		 152 aa  41.6  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1554  protein of unknown function DUF1568  24.79 
 
 		 230 aa  41.6  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.335003 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1556  protein of unknown function DUF1568  24.79 
 
 		 230 aa  41.6  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.444415 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0243  hypothetical protein  27.78 
 
 		 178 aa  41.2  0.006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.273479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1256  protein of unknown function DUF1568  23.53 
 
 		 321 aa  41.6  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0072967  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3926  hypothetical protein  25.89 
 
 		 322 aa  40.8  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>