More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1558 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_1558  protein of unknown function DUF1568  100 
 
 
230 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.55731 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1556  protein of unknown function DUF1568  95.65 
 
 
230 aa  445  1.0000000000000001e-124  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.444415 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1554  protein of unknown function DUF1568  95.65 
 
 
230 aa  445  1.0000000000000001e-124  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.335003 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1552  protein of unknown function DUF1568  91.74 
 
 
230 aa  429  1e-119  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.268269 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2793  transposase-like p;rotein  66.87 
 
 
165 aa  231  1e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0477  hypothetical protein  43.36 
 
 
232 aa  190  1e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1802  protein of unknown function DUF1568  44.25 
 
 
240 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2932  hypothetical protein  42.11 
 
 
234 aa  181  1e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.56667  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3122  transposase  37.61 
 
 
231 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.299801  normal  0.623865 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3670  transposase and inactivated derivatives  37.99 
 
 
228 aa  170  1e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3295  hypothetical protein  39.21 
 
 
230 aa  169  3e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1151  protein of unknown function DUF1568  39.04 
 
 
231 aa  167  9e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4446  hypothetical protein  38.39 
 
 
236 aa  167  1e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.885807  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0682  hypothetical protein  38.5 
 
 
232 aa  165  4e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.349284  normal  0.584525 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0996  protein of unknown function DUF1568  45.54 
 
 
216 aa  162  3e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.976226  normal  0.164778 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0708  protein of unknown function DUF1568  39.04 
 
 
233 aa  156  3e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.615013  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0790  hypothetical protein  35.81 
 
 
232 aa  154  8e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.513436  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1007  hypothetical protein  38.43 
 
 
234 aa  154  8e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.849512  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0740  hypothetical protein  38.94 
 
 
255 aa  154  9e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.345588  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1484  hypothetical protein  33.91 
 
 
231 aa  153  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2394  hypothetical protein  39.04 
 
 
239 aa  150  2e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.419691  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3049  transposase and inactivated derivatives  35.96 
 
 
226 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0093  hypothetical protein  37.61 
 
 
234 aa  143  2e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150021  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0033  hypothetical protein  40.09 
 
 
235 aa  141  8e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3244  protein of unknown function DUF1568  34.96 
 
 
241 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3592  protein of unknown function DUF1568  34.51 
 
 
235 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00165115  hitchhiker  0.000000708999 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3037  protein of unknown function DUF1568  37.32 
 
 
315 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0364  transposase-like protein  34.51 
 
 
235 aa  135  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.72516  normal  0.431982 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2897  protein of unknown function DUF1568  34.07 
 
 
250 aa  136  4e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0773075 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1512  hypothetical protein  37.12 
 
 
222 aa  135  5e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.656335 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2966  hypothetical protein  34.51 
 
 
241 aa  135  8e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5559  hypothetical protein  33.62 
 
 
236 aa  134  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.316618  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2737  hypothetical protein  33.04 
 
 
237 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3719  transposase  33.04 
 
 
237 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.719861  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3749  hypothetical protein  33.04 
 
 
237 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1766  hypothetical protein  33.04 
 
 
237 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3691  hypothetical protein  33.04 
 
 
237 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0320  hypothetical protein  33.04 
 
 
237 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.396962  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2788  hypothetical protein  33.04 
 
 
237 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0329  hypothetical protein  33.04 
 
 
237 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3215  hypothetical protein  33.04 
 
 
237 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3015  hypothetical protein  33.04 
 
 
237 aa  133  3e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3498  hypothetical protein  33.04 
 
 
237 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.827202  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0917  protein of unknown function DUF1568  35.78 
 
 
221 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0401  hypothetical protein  33.04 
 
 
237 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2706  hypothetical protein  33.04 
 
 
237 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0803898  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2789  hypothetical protein  34.07 
 
 
235 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.603101  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0380  hypothetical protein  33.04 
 
 
237 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0304  hypothetical protein  33.04 
 
 
237 aa  132  6e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3871  protein of unknown function DUF1568  34.96 
 
 
236 aa  131  6.999999999999999e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1620  hypothetical protein  38.53 
 
 
313 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0770  protein of unknown function DUF1568  31.58 
 
 
316 aa  128  7.000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.717082  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2396  hypothetical protein  34.38 
 
 
220 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2474  protein of unknown function DUF1568  34.07 
 
 
224 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000403207  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1701  hypothetical protein  42.21 
 
 
174 aa  125  5e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1967  hypothetical protein  36.97 
 
 
226 aa  123  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00827335  normal  0.496503 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2771  hypothetical protein  35.37 
 
 
318 aa  122  6e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1708  hypothetical protein  27.88 
 
 
461 aa  121  9.999999999999999e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2192  hypothetical protein  38.46 
 
 
253 aa  119  3.9999999999999996e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107555  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5382  hypothetical protein  37.1 
 
 
223 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564815  normal  0.588654 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2198  transposase  35.75 
 
 
253 aa  119  4.9999999999999996e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0950  hypothetical protein  33.02 
 
 
321 aa  118  7e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000190963  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3127  hypothetical protein  33.19 
 
 
261 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3264  hypothetical protein  32.74 
 
 
247 aa  116  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0926373  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3020  hypothetical protein  32.24 
 
 
316 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2776  hypothetical protein  33.04 
 
 
235 aa  115  6e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.721483  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3397  hypothetical protein  34.07 
 
 
237 aa  115  6e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1055  transposase  37.16 
 
 
250 aa  113  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1356  hypothetical protein  34.59 
 
 
319 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.895893  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0793  hypothetical protein  33.49 
 
 
314 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3632  hypothetical protein  33.01 
 
 
316 aa  113  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.108416  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2265  transposase and inactivated derivatives  34.74 
 
 
241 aa  113  3e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4538  protein of unknown function DUF1568  35.39 
 
 
251 aa  111  9e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0855967  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0595  hypothetical protein  29.86 
 
 
258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.217159  hitchhiker  2.03187e-17 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2264  transposase and inactivated derivatives  33.8 
 
 
323 aa  108  5e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.88974  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3926  hypothetical protein  32.69 
 
 
322 aa  108  5e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3016  hypothetical protein  34.81 
 
 
312 aa  108  6e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2153  hypothetical protein  30.53 
 
 
221 aa  107  1e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0207768  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2878  protein of unknown function DUF1568  30.84 
 
 
289 aa  106  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000473385 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0136  transposase  40.46 
 
 
236 aa  107  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01210  transposase  36.42 
 
 
245 aa  106  3e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1748  hypothetical protein  32.86 
 
 
312 aa  106  3e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.994794  normal  0.0128416 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12790  transposase  40.44 
 
 
241 aa  106  4e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0148  transposase  38.17 
 
 
236 aa  105  4e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0526667  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1725  hypothetical protein  36.55 
 
 
248 aa  105  5e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1724  hypothetical protein  36.55 
 
 
248 aa  105  6e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2086  hypothetical protein  34.44 
 
 
321 aa  105  8e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.464464  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1032  protein of unknown function DUF1568  29.39 
 
 
326 aa  104  9e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0397  protein of unknown function DUF1568  37.64 
 
 
304 aa  104  9e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000164254  normal  0.853679 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3248  protein of unknown function DUF1568  33.15 
 
 
181 aa  104  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00178625  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0203  hypothetical protein  33.33 
 
 
288 aa  103  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0207  hypothetical protein  29.55 
 
 
288 aa  103  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1406  protein of unknown function DUF1568  29.91 
 
 
289 aa  103  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1813  protein of unknown function DUF1568  35.33 
 
 
277 aa  103  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00112655  hitchhiker  0.00000000103135 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0201  hypothetical protein  32.07 
 
 
288 aa  102  4e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0859  protein of unknown function DUF1568  28.51 
 
 
238 aa  102  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.682505  normal  0.123586 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1423  protein of unknown function DUF1568  41.79 
 
 
180 aa  102  5e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.7985800000000005e-18 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3104  hypothetical protein  27.07 
 
 
233 aa  102  5e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.18817 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1967  hypothetical protein  31.16 
 
 
282 aa  102  6e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.969925  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1319  protein of unknown function DUF1568  34.36 
 
 
319 aa  101  8e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0490388  hitchhiker  0.00690567 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>