231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2086 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2086  hypothetical protein  100 
 
 
321 aa  661    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.464464  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3020  hypothetical protein  40.73 
 
 
316 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0793  hypothetical protein  39.63 
 
 
314 aa  230  2e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1748  hypothetical protein  41.99 
 
 
312 aa  228  8e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.994794  normal  0.0128416 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1032  protein of unknown function DUF1568  39.43 
 
 
326 aa  224  2e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3016  hypothetical protein  38.89 
 
 
312 aa  223  4e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2264  transposase and inactivated derivatives  37.42 
 
 
323 aa  190  2e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.88974  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1967  hypothetical protein  44.73 
 
 
282 aa  187  2e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.969925  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1966  hypothetical protein  44.3 
 
 
305 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.527692  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1620  hypothetical protein  39.08 
 
 
313 aa  182  6e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0770  protein of unknown function DUF1568  35.62 
 
 
316 aa  176  6e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.717082  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2878  protein of unknown function DUF1568  42.13 
 
 
287 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3037  protein of unknown function DUF1568  40.16 
 
 
315 aa  172  6.999999999999999e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1872  hypothetical protein  35.85 
 
 
277 aa  171  2e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1406  protein of unknown function DUF1568  42.55 
 
 
289 aa  171  2e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0203  hypothetical protein  34.51 
 
 
288 aa  170  3e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0201  hypothetical protein  34.15 
 
 
288 aa  170  4e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3926  hypothetical protein  34.56 
 
 
322 aa  169  5e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2771  hypothetical protein  34.86 
 
 
318 aa  167  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2265  transposase and inactivated derivatives  40.65 
 
 
241 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2878  protein of unknown function DUF1568  41.7 
 
 
289 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000473385 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0207  hypothetical protein  33.8 
 
 
288 aa  164  2.0000000000000002e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1813  protein of unknown function DUF1568  42.55 
 
 
277 aa  161  1e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00112655  hitchhiker  0.00000000103135 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3632  hypothetical protein  34.95 
 
 
316 aa  156  4e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.108416  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0950  hypothetical protein  33.12 
 
 
321 aa  154  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000190963  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1356  hypothetical protein  32.39 
 
 
319 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.895893  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0164  transposase  39.47 
 
 
287 aa  132  1.0000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0743928  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1256  protein of unknown function DUF1568  30.34 
 
 
321 aa  125  9e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0072967  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1084  transposase and inactivated derivatives  30.51 
 
 
338 aa  125  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2237  hypothetical protein  30.09 
 
 
321 aa  123  5e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2333  protein of unknown function DUF1568  28.48 
 
 
324 aa  122  6e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2233  hypothetical protein  30.09 
 
 
321 aa  121  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2246  hypothetical protein  30.09 
 
 
321 aa  121  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1356  protein of unknown function DUF1568  30.41 
 
 
321 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0875577  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1423  protein of unknown function DUF1568  30.34 
 
 
325 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.892865 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1506  protein of unknown function DUF1568  30.41 
 
 
321 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2204  hypothetical protein  30.16 
 
 
327 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2218  hypothetical protein  28.48 
 
 
327 aa  119  7e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00293328  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0682  hypothetical protein  41.61 
 
 
232 aa  119  7e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.349284  normal  0.584525 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0489  hypothetical protein  40.22 
 
 
310 aa  119  7.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.448467 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2932  hypothetical protein  41.22 
 
 
234 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.56667  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2213  hypothetical protein  29.78 
 
 
321 aa  118  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.809495  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1427  hypothetical protein  29.87 
 
 
321 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0148  transposase  38.31 
 
 
236 aa  117  3e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0526667  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2643  transposase domain-containing protein  29.01 
 
 
335 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1425  hypothetical protein  29.56 
 
 
321 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0845  hypothetical protein  29.75 
 
 
334 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1386  protein of unknown function DUF1568  28.79 
 
 
325 aa  115  6.9999999999999995e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12790  transposase  42.11 
 
 
241 aa  115  7.999999999999999e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1392  hypothetical protein  37.22 
 
 
320 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1929  protein of unknown function DUF1568  28.12 
 
 
321 aa  114  3e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2131  hypothetical protein  37.78 
 
 
333 aa  114  3e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.132605  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0722  protein of unknown function DUF1568  29.25 
 
 
321 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.645218  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0324  protein of unknown function DUF1568  36.02 
 
 
252 aa  113  5e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.551772  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0136  transposase  40 
 
 
236 aa  112  6e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1725  hypothetical protein  37.59 
 
 
248 aa  112  7.000000000000001e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1724  hypothetical protein  37.59 
 
 
248 aa  112  9e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01210  transposase  36.61 
 
 
245 aa  112  1.0000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0996  protein of unknown function DUF1568  42.76 
 
 
216 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.976226  normal  0.164778 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1151  protein of unknown function DUF1568  40.27 
 
 
231 aa  111  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1811  protein of unknown function DUF1568  51.85 
 
 
138 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00808567  hitchhiker  0.000000000975496 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2336  protein of unknown function DUF1568  34.48 
 
 
324 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0033  hypothetical protein  42.66 
 
 
235 aa  109  6e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1484  hypothetical protein  34.41 
 
 
295 aa  109  6e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0790  hypothetical protein  37.16 
 
 
232 aa  109  7.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.513436  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0595  hypothetical protein  36.99 
 
 
258 aa  108  8.000000000000001e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.217159  hitchhiker  2.03187e-17 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0954  hypothetical protein  31.17 
 
 
326 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.729066  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1423  protein of unknown function DUF1568  36.31 
 
 
180 aa  107  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.7985800000000005e-18 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1319  protein of unknown function DUF1568  34.41 
 
 
319 aa  107  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0490388  hitchhiker  0.00690567 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0925  protein of unknown function DUF1568  35.48 
 
 
336 aa  107  2e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2198  transposase  33.33 
 
 
253 aa  107  3e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1007  hypothetical protein  37.5 
 
 
234 aa  106  4e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.849512  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0397  protein of unknown function DUF1568  38.85 
 
 
304 aa  106  6e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000164254  normal  0.853679 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1487  hypothetical protein  34.95 
 
 
323 aa  106  6e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3105  protein of unknown function DUF1568  33.67 
 
 
192 aa  105  8e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000625853  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1782  protein of unknown function DUF1568  32.97 
 
 
325 aa  105  9e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0188832 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2207  protein of unknown function DUF1568  27.78 
 
 
323 aa  104  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.45311e-16 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1791  transposase and inactivated derivatives  38.26 
 
 
323 aa  104  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2192  hypothetical protein  33.33 
 
 
253 aa  104  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107555  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2205  hypothetical protein  40.27 
 
 
160 aa  103  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3248  protein of unknown function DUF1568  38.41 
 
 
181 aa  103  3e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00178625  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1558  protein of unknown function DUF1568  34.67 
 
 
230 aa  104  3e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.55731 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4538  protein of unknown function DUF1568  35.62 
 
 
251 aa  103  4e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0855967  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3871  protein of unknown function DUF1568  38.73 
 
 
236 aa  103  4e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2793  transposase-like p;rotein  37.82 
 
 
165 aa  103  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1104  methionine-R-sulfoxide reductase  27.05 
 
 
506 aa  103  4e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000471642  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1554  protein of unknown function DUF1568  33.05 
 
 
230 aa  103  5e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.335003 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1556  protein of unknown function DUF1568  33.05 
 
 
230 aa  103  5e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.444415 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3078  protein of unknown function DUF1568  37.75 
 
 
190 aa  102  7e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2050  protein of unknown function DUF1568  29.15 
 
 
336 aa  102  9e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.633564  normal  0.705399 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2454  protein of unknown function DUF1568  27.22 
 
 
321 aa  102  1e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000257297  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1484  hypothetical protein  29.86 
 
 
231 aa  102  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1802  protein of unknown function DUF1568  37.93 
 
 
240 aa  100  3e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1552  protein of unknown function DUF1568  37.82 
 
 
230 aa  100  3e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.268269 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1578  hypothetical protein  26.54 
 
 
316 aa  100  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000706252  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2394  hypothetical protein  41.61 
 
 
239 aa  100  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.419691  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3122  transposase  30 
 
 
231 aa  99.4  8e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.299801  normal  0.623865 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0844  hypothetical protein  27.64 
 
 
340 aa  99  9e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1055  transposase  37.67 
 
 
250 aa  99  9e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0793  hypothetical protein  26.71 
 
 
335 aa  98.6  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000261863  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>