187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0885 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_0885  protein of unknown function DUF1568  100 
 
 
169 aa  349  8.999999999999999e-96  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3477  hypothetical protein  35.19 
 
 
188 aa  96.3  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.379705  normal  0.40189 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0996  protein of unknown function DUF1568  27.67 
 
 
216 aa  68.6  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.976226  normal  0.164778 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1384  hypothetical protein  28.31 
 
 
180 aa  68.6  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.705846 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2474  protein of unknown function DUF1568  28.12 
 
 
224 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000403207  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1689  hypothetical protein  29.89 
 
 
184 aa  66.6  0.0000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.625848  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4226  hypothetical protein  32.88 
 
 
177 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.853067  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3135  hypothetical protein  31.82 
 
 
176 aa  65.5  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.464073  normal  0.01424 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2607  protein of unknown function DUF1568  28.49 
 
 
186 aa  64.7  0.0000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.407993  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0352  hypothetical protein  27.54 
 
 
187 aa  63.5  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.642542  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1356  hypothetical protein  28.48 
 
 
319 aa  63.9  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.895893  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2771  hypothetical protein  35.59 
 
 
318 aa  62.8  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2835  hypothetical protein  30.52 
 
 
191 aa  62.4  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1151  protein of unknown function DUF1568  32.23 
 
 
231 aa  60.8  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2531  transposase  27.21 
 
 
187 aa  60.8  0.000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.719011  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0203  hypothetical protein  26.49 
 
 
288 aa  60.5  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0207  hypothetical protein  26.49 
 
 
288 aa  60.5  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4462  hypothetical protein  24.14 
 
 
152 aa  60.5  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1484  hypothetical protein  26.57 
 
 
231 aa  60.1  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3368  transposase  24.54 
 
 
171 aa  59.3  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.863098  normal  0.131145 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3871  protein of unknown function DUF1568  28.67 
 
 
236 aa  59.3  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3976  protein of unknown function DUF1568  32.06 
 
 
151 aa  59.7  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.183049  normal  0.223747 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0721b  hypothetical protein  30.43 
 
 
133 aa  59.3  0.00000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0201  hypothetical protein  25.83 
 
 
288 aa  59.3  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1855  hypothetical protein  29.82 
 
 
175 aa  58.9  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0917  protein of unknown function DUF1568  26.58 
 
 
221 aa  58.9  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2776  hypothetical protein  30.41 
 
 
235 aa  58.5  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.721483  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3122  transposase  27.95 
 
 
231 aa  58.5  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.299801  normal  0.623865 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0682  hypothetical protein  29.05 
 
 
232 aa  58.9  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.349284  normal  0.584525 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1317  protein of unknown function DUF1568  28.66 
 
 
179 aa  58.2  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.737296  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3037  protein of unknown function DUF1568  31.86 
 
 
315 aa  57  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1748  hypothetical protein  27.45 
 
 
312 aa  57  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.994794  normal  0.0128416 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2932  hypothetical protein  27.33 
 
 
234 aa  56.2  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.56667  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0731  hypothetical protein  27.11 
 
 
176 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0793  hypothetical protein  25.32 
 
 
314 aa  56.6  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3016  hypothetical protein  26.28 
 
 
312 aa  56.2  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1489  hypothetical protein  27.97 
 
 
153 aa  55.5  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2478  hypothetical protein  25.16 
 
 
161 aa  55.5  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3049  transposase and inactivated derivatives  25.68 
 
 
226 aa  55.5  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3353  protein of unknown function DUF1568  28.41 
 
 
181 aa  55.5  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.231762 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0950  hypothetical protein  28.57 
 
 
321 aa  55.5  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000190963  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3020  hypothetical protein  26.28 
 
 
316 aa  55.1  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1512  hypothetical protein  28.38 
 
 
222 aa  55.1  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.656335 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3405  hypothetical protein  27.97 
 
 
179 aa  54.7  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0242544  normal  0.205029 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2065  hypothetical protein  25.32 
 
 
184 aa  54.7  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1952  hypothetical protein  30.07 
 
 
178 aa  54.3  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0708  protein of unknown function DUF1568  25.85 
 
 
233 aa  54.3  0.0000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.615013  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1802  protein of unknown function DUF1568  27.34 
 
 
240 aa  53.9  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1962  hypothetical protein  32.2 
 
 
164 aa  53.9  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3203  hypothetical protein  26.92 
 
 
173 aa  53.5  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.936957 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33360  hypothetical protein  31.37 
 
 
176 aa  53.5  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0740  hypothetical protein  25.85 
 
 
255 aa  53.5  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.345588  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2878  protein of unknown function DUF1568  27.33 
 
 
287 aa  53.9  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2563  protein of unknown function DUF1568  22.6 
 
 
248 aa  53.1  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2264  transposase and inactivated derivatives  24.7 
 
 
323 aa  53.1  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.88974  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0477  hypothetical protein  27.05 
 
 
232 aa  52.8  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2530  hypothetical protein  25 
 
 
179 aa  52.8  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1007  hypothetical protein  26.95 
 
 
234 aa  52.8  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.849512  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26971  hypothetical protein  26.35 
 
 
260 aa  52.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2086  hypothetical protein  27.41 
 
 
321 aa  52.4  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.464464  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4549  hypothetical protein  26.67 
 
 
181 aa  52.4  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.86188 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13701  hypothetical protein  26.67 
 
 
164 aa  52.4  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1975  hypothetical protein  27.89 
 
 
163 aa  52.8  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.121263 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03381  hypothetical protein  26.67 
 
 
199 aa  52  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.593355 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1620  hypothetical protein  33.59 
 
 
313 aa  52  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3712  hypothetical protein  24.36 
 
 
177 aa  51.6  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0013542 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0243  hypothetical protein  27.27 
 
 
178 aa  51.6  0.000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.273479  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2394  hypothetical protein  29.66 
 
 
239 aa  51.6  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.419691  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1676  hypothetical protein  26.39 
 
 
157 aa  51.2  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1967  hypothetical protein  26 
 
 
282 aa  50.8  0.000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.969925  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1406  protein of unknown function DUF1568  23.68 
 
 
289 aa  50.8  0.000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3919  hypothetical protein  26.53 
 
 
151 aa  50.8  0.000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0968412  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4599  hypothetical protein  24.82 
 
 
160 aa  50.8  0.000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1364  hypothetical protein  26.57 
 
 
150 aa  50.8  0.000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0968684  normal  0.0104776 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0790  hypothetical protein  26.49 
 
 
232 aa  50.8  0.000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.513436  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0164  transposase  29.52 
 
 
287 aa  50.8  0.000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0743928  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2421  hypothetical protein  25.95 
 
 
161 aa  50.4  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1872  hypothetical protein  28.97 
 
 
277 aa  50.1  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3130  transposase and inactivated derivatives  30.83 
 
 
178 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0127624  normal  0.415202 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0136  transposase  27.78 
 
 
236 aa  50.4  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27031  hypothetical protein  26.95 
 
 
260 aa  50.8  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2793  transposase-like p;rotein  27.82 
 
 
165 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0489  hypothetical protein  27.66 
 
 
310 aa  50.1  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.448467 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1554  protein of unknown function DUF1568  28.97 
 
 
230 aa  49.7  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.335003 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4446  hypothetical protein  23.78 
 
 
236 aa  49.7  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.885807  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1473  transposase, putative  29.53 
 
 
179 aa  50.1  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1558  protein of unknown function DUF1568  28.97 
 
 
230 aa  49.7  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.55731 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2153  hypothetical protein  27.86 
 
 
221 aa  49.3  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0207768  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1556  protein of unknown function DUF1568  28.97 
 
 
230 aa  49.7  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.444415 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5382  hypothetical protein  28.48 
 
 
223 aa  49.7  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564815  normal  0.588654 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0397  protein of unknown function DUF1568  28.1 
 
 
304 aa  49.3  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000164254  normal  0.853679 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3612  hypothetical protein  22.88 
 
 
201 aa  48.9  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0368765  normal 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0033  hypothetical protein  25.76 
 
 
235 aa  48.9  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4081  hypothetical protein  27.78 
 
 
177 aa  49.3  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0580442  normal  0.342905 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4373  hypothetical protein  31.78 
 
 
178 aa  48.9  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.295832  normal  0.0449373 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1701  hypothetical protein  25 
 
 
174 aa  48.9  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27481  hypothetical protein  25.85 
 
 
260 aa  48.9  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.581269 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12790  transposase  27.01 
 
 
241 aa  48.9  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0796  hypothetical protein  31.68 
 
 
159 aa  48.5  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2878  protein of unknown function DUF1568  23.68 
 
 
289 aa  48.5  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000473385 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>