More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0790 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_0790  hypothetical protein  100 
 
 
232 aa  475  1e-133  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.513436  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0682  hypothetical protein  74.89 
 
 
232 aa  364  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.349284  normal  0.584525 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2932  hypothetical protein  74.67 
 
 
234 aa  358  6e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.56667  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1151  protein of unknown function DUF1568  68.72 
 
 
231 aa  332  4e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0708  protein of unknown function DUF1568  63.79 
 
 
233 aa  309  2e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.615013  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0740  hypothetical protein  63.91 
 
 
255 aa  306  2.0000000000000002e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.345588  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1007  hypothetical protein  63.64 
 
 
234 aa  306  2.0000000000000002e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.849512  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2394  hypothetical protein  65.33 
 
 
239 aa  304  8.000000000000001e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.419691  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5559  hypothetical protein  59.48 
 
 
236 aa  288  4e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.316618  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0401  hypothetical protein  47.11 
 
 
237 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0380  hypothetical protein  47.11 
 
 
237 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3498  hypothetical protein  47.11 
 
 
237 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.827202  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2706  hypothetical protein  47.11 
 
 
237 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0803898  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0329  hypothetical protein  47.11 
 
 
237 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0320  hypothetical protein  47.11 
 
 
237 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.396962  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0304  hypothetical protein  47.56 
 
 
237 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2737  hypothetical protein  47.11 
 
 
237 aa  209  3e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3719  transposase  47.11 
 
 
237 aa  209  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.719861  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3015  hypothetical protein  47.11 
 
 
237 aa  209  3e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3749  hypothetical protein  47.11 
 
 
237 aa  209  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1766  hypothetical protein  47.11 
 
 
237 aa  209  3e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3215  hypothetical protein  47.11 
 
 
237 aa  209  3e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2788  hypothetical protein  47.11 
 
 
237 aa  209  3e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3691  hypothetical protein  47.11 
 
 
237 aa  209  3e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2966  hypothetical protein  46.29 
 
 
241 aa  208  6e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3592  protein of unknown function DUF1568  45.33 
 
 
235 aa  206  4e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00165115  hitchhiker  0.000000708999 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3127  hypothetical protein  47.11 
 
 
261 aa  205  5e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3264  hypothetical protein  47.11 
 
 
247 aa  205  5e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0926373  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3244  protein of unknown function DUF1568  44.54 
 
 
241 aa  205  6e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1802  protein of unknown function DUF1568  44.68 
 
 
240 aa  205  6e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0364  transposase-like protein  44.89 
 
 
235 aa  204  9e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.72516  normal  0.431982 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2897  protein of unknown function DUF1568  44.69 
 
 
250 aa  203  2e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0773075 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2789  hypothetical protein  44 
 
 
235 aa  198  6e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.603101  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3295  hypothetical protein  40.43 
 
 
230 aa  196  3e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3122  transposase  43.67 
 
 
231 aa  195  4.0000000000000005e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.299801  normal  0.623865 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3397  hypothetical protein  45.85 
 
 
237 aa  195  5.000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0477  hypothetical protein  42.22 
 
 
232 aa  193  2e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4446  hypothetical protein  40.57 
 
 
236 aa  185  6e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.885807  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3670  transposase and inactivated derivatives  37.72 
 
 
228 aa  182  3e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0093  hypothetical protein  41.33 
 
 
234 aa  180  2e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150021  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1484  hypothetical protein  38.67 
 
 
231 aa  178  7e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0996  protein of unknown function DUF1568  45.24 
 
 
216 aa  174  8e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.976226  normal  0.164778 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3871  protein of unknown function DUF1568  43.36 
 
 
236 aa  168  5e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3104  hypothetical protein  40.17 
 
 
233 aa  168  8e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.18817 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0859  protein of unknown function DUF1568  41.01 
 
 
238 aa  161  7e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.682505  normal  0.123586 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1552  protein of unknown function DUF1568  35.09 
 
 
230 aa  157  9e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.268269 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1554  protein of unknown function DUF1568  35.4 
 
 
230 aa  153  2e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.335003 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5648  hypothetical protein  40.84 
 
 
226 aa  154  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.299518  normal  0.988864 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1556  protein of unknown function DUF1568  35.4 
 
 
230 aa  153  2e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.444415 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0033  hypothetical protein  41.74 
 
 
235 aa  151  1e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1558  protein of unknown function DUF1568  35.16 
 
 
230 aa  144  1e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.55731 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2793  transposase-like p;rotein  45.62 
 
 
165 aa  143  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3020  hypothetical protein  34.82 
 
 
316 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1708  hypothetical protein  33.33 
 
 
461 aa  138  7.999999999999999e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1512  hypothetical protein  37.12 
 
 
222 aa  132  5e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.656335 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3926  hypothetical protein  34.4 
 
 
322 aa  132  6e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0917  protein of unknown function DUF1568  34.21 
 
 
221 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3037  protein of unknown function DUF1568  36.54 
 
 
315 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1701  hypothetical protein  40.88 
 
 
174 aa  126  3e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2396  hypothetical protein  34.53 
 
 
220 aa  124  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3016  hypothetical protein  34.6 
 
 
312 aa  123  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1620  hypothetical protein  40.57 
 
 
313 aa  123  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3632  hypothetical protein  35.58 
 
 
316 aa  121  7e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.108416  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0950  hypothetical protein  40.14 
 
 
321 aa  121  8e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000190963  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2776  hypothetical protein  33.48 
 
 
235 aa  121  8e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.721483  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0793  hypothetical protein  33.33 
 
 
314 aa  121  9e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2265  transposase and inactivated derivatives  31.16 
 
 
241 aa  121  9e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2264  transposase and inactivated derivatives  31.16 
 
 
323 aa  121  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.88974  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1748  hypothetical protein  32.74 
 
 
312 aa  118  7e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.994794  normal  0.0128416 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3049  transposase and inactivated derivatives  29.65 
 
 
226 aa  118  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2474  protein of unknown function DUF1568  36.62 
 
 
224 aa  116  3e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000403207  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2878  protein of unknown function DUF1568  31.76 
 
 
287 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0770  protein of unknown function DUF1568  30.58 
 
 
316 aa  115  6e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.717082  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1356  hypothetical protein  32.78 
 
 
319 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.895893  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2771  hypothetical protein  31.94 
 
 
318 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1967  hypothetical protein  33.33 
 
 
226 aa  112  4.0000000000000004e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00827335  normal  0.496503 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2153  hypothetical protein  30.43 
 
 
221 aa  111  8.000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0207768  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0397  protein of unknown function DUF1568  35.68 
 
 
304 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000164254  normal  0.853679 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1967  hypothetical protein  32.89 
 
 
282 aa  110  3e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.969925  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2086  hypothetical protein  37.16 
 
 
321 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.464464  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1406  protein of unknown function DUF1568  30.67 
 
 
289 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1966  hypothetical protein  33.18 
 
 
305 aa  107  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.527692  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0148  transposase  38.76 
 
 
236 aa  106  3e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0526667  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2878  protein of unknown function DUF1568  30.67 
 
 
289 aa  106  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000473385 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0164  transposase  33.33 
 
 
287 aa  106  4e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0743928  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1392  hypothetical protein  34.07 
 
 
320 aa  105  6e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0136  transposase  38.76 
 
 
236 aa  104  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1541  hypothetical protein  30.45 
 
 
267 aa  103  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.463797  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1782  protein of unknown function DUF1568  30.08 
 
 
325 aa  100  1e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0188832 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1036  hypothetical protein  32.38 
 
 
222 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1813  protein of unknown function DUF1568  33.82 
 
 
277 aa  100  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00112655  hitchhiker  0.00000000103135 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1032  protein of unknown function DUF1568  30.37 
 
 
326 aa  99.4  4e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2131  hypothetical protein  32.16 
 
 
333 aa  99  5e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.132605  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5382  hypothetical protein  29.79 
 
 
223 aa  98.6  8e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564815  normal  0.588654 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27481  hypothetical protein  36.31 
 
 
260 aa  97.8  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.581269 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0207  hypothetical protein  35.14 
 
 
288 aa  98.2  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0722  protein of unknown function DUF1568  30.45 
 
 
321 aa  97.4  1e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.645218  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0203  hypothetical protein  38.46 
 
 
288 aa  97.4  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0201  hypothetical protein  37.76 
 
 
288 aa  96.3  3e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1506  protein of unknown function DUF1568  28.93 
 
 
321 aa  96.3  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>