84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1473 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1473  transposase, putative  100 
 
 		 179 aa  370  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1952  hypothetical protein  62.07 
 
 		 178 aa  226  2e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33360  hypothetical protein  61.9 
 
 		 176 aa  223  1e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1685  transposase, putative  63.91 
 
 		 184 aa  223  2e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.207714 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1855  hypothetical protein  62.8 
 
 		 175 aa  217  7e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4226  hypothetical protein  57.39 
 
 		 177 aa  216  2e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.853067  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4081  hypothetical protein  53.93 
 
 		 177 aa  209  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0580442  normal  0.342905 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1689  hypothetical protein  52.57 
 
 		 184 aa  194  4.0000000000000005e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.625848  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0768  hypothetical protein  54.6 
 
 		 175 aa  188  4e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0333217  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1962  hypothetical protein  54.94 
 
 		 164 aa  187  8e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2421  hypothetical protein  52.5 
 
 		 161 aa  184  7e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4825  transposase and inactivated derivative  50.57 
 
 		 163 aa  178  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3405  hypothetical protein  53.89 
 
 		 179 aa  178  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0242544  normal  0.205029 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3392  hypothetical protein  52.1 
 
 		 165 aa  177  7e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3379  conserved hypothetical protein  52.1 
 
 		 165 aa  176  1e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00227  hypothetical protein  52.1 
 
 		 165 aa  177  1e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00223  hypothetical protein  52.1 
 
 		 165 aa  177  1e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3130  transposase and inactivated derivatives  47.75 
 
 		 178 aa  174  4e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0127624  normal  0.415202 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4373  hypothetical protein  51.11 
 
 		 178 aa  174  6e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.295832  normal  0.0449373 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0240  hypothetical protein  50.9 
 
 		 165 aa  172  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0243  hypothetical protein  47.31 
 
 		 178 aa  171  5e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.273479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2530  hypothetical protein  47.4 
 
 		 179 aa  171  5e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1317  protein of unknown function DUF1568  48.33 
 
 		 179 aa  170  1e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.737296  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1384  hypothetical protein  48.28 
 
 		 180 aa  169  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.705846 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3135  hypothetical protein  46.02 
 
 		 176 aa  168  4e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.464073  normal  0.01424 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0731  hypothetical protein  48.81 
 
 		 176 aa  165  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2478  hypothetical protein  53.38 
 
 		 161 aa  165  4e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0721b  hypothetical protein  56.49 
 
 		 133 aa  161  4.0000000000000004e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2835  hypothetical protein  47.06 
 
 		 191 aa  160  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1888  hypothetical protein  46.34 
 
 		 171 aa  153  1e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.17258  hitchhiker  0.00842787 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0352  hypothetical protein  48.81 
 
 		 187 aa  150  7e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.642542  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2531  transposase  48.21 
 
 		 187 aa  148  4e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.719011  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0796  hypothetical protein  46.95 
 
 		 159 aa  145  3e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2890  hypothetical protein  41.48 
 
 		 191 aa  143  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0361  hypothetical protein  40 
 
 		 191 aa  132  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2532  hypothetical protein  37.28 
 
 		 157 aa  105  3e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709096 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2244  transposase  35.51 
 
 		 161 aa  62.4  0.000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.196666  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3154  hypothetical protein  46.88 
 
 		 58 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0787684 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1552  hypothetical protein  30.28 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0339239 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1136  hypothetical protein  25.77 
 
 		 192 aa  58.2  0.00000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2844  hypothetical protein  28.86 
 
 		 168 aa  54.3  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3252  hypothetical protein  28.57 
 
 		 174 aa  53.9  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1272  hypothetical protein  31.51 
 
 		 196 aa  53.9  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1784  hypothetical protein  27.66 
 
 		 197 aa  52.8  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3477  hypothetical protein  25.17 
 
 		 188 aa  52  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.379705  normal  0.40189 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3465  hypothetical protein  28.97 
 
 		 150 aa  50.8  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1888b  hypothetical protein  48.94 
 
 		 101 aa  50.4  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0885  protein of unknown function DUF1568  29.53 
 
 		 169 aa  50.1  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0301  hypothetical protein  48.94 
 
 		 91 aa  50.1  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0943  protein of unknown function DUF1568  27.34 
 
 		 163 aa  49.7  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.74816  normal  0.454082 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3286  protein of unknown function DUF1568  30.3 
 
 		 214 aa  48.9  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00118326  unclonable  0.0000000135739 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0554  hypothetical protein  32.22 
 
 		 177 aa  48.5  0.00005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3277  protein of unknown function DUF1568  29.5 
 
 		 197 aa  48.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4599  hypothetical protein  22.76 
 
 		 160 aa  47.8  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3976  protein of unknown function DUF1568  27.35 
 
 		 151 aa  46.6  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.183049  normal  0.223747 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0837  hypothetical protein  28.99 
 
 		 206 aa  46.6  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0284  hypothetical protein  25.49 
 
 		 187 aa  47  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1423  hypothetical protein  27.5 
 
 		 190 aa  46.6  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0723696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5411  protein of unknown function DUF1568  24.58 
 
 		 218 aa  45.8  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000187281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0181  hypothetical protein  25.31 
 
 		 200 aa  46.2  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2607  protein of unknown function DUF1568  25.83 
 
 		 186 aa  45.4  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.407993  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1574  hypothetical protein  27.97 
 
 		 150 aa  45.4  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.620864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2426  hypothetical protein  26.99 
 
 		 249 aa  44.7  0.0007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.763748  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2777  hypothetical protein  34.69 
 
 		 149 aa  44.7  0.0007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.430133  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0337  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  27.19 
 
 		 1345 aa  44.7  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.038664  normal  0.920027 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4462  hypothetical protein  25.62 
 
 		 152 aa  44.3  0.0009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2451  hypothetical protein  26.9 
 
 		 201 aa  44.3  0.0009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.875999 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2563  hypothetical protein  28.1 
 
 		 176 aa  44.3  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000213064  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1676  hypothetical protein  29.58 
 
 		 157 aa  43.9  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1024  hypothetical protein  28.89 
 
 		 163 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0275616 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3612  hypothetical protein  25.53 
 
 		 201 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0368765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0995  hypothetical protein  28.89 
 
 		 163 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0311  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  27.19 
 
 		 1372 aa  43.1  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.220801 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3712  hypothetical protein  28.87 
 
 		 177 aa  43.5  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013542 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3049  transposase and inactivated derivatives  27.14 
 
 		 226 aa  43.1  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3026  hypothetical protein  42.22 
 
 		 76 aa  43.5  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.247877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4707  hypothetical protein  25.53 
 
 		 152 aa  42  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26971  hypothetical protein  29.22 
 
 		 260 aa  41.6  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0595  hypothetical protein  26.72 
 
 		 258 aa  41.6  0.006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.217159  hitchhiker  2.03187e-17 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0440  hypothetical protein  53.33 
 
 		 251 aa  41.2  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0347  hypothetical protein  32.69 
 
 		 158 aa  41.2  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.119312  normal  0.0189577 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1975  hypothetical protein  22.14 
 
 		 163 aa  41.6  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121263 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0093  hypothetical protein  28.85 
 
 		 234 aa  41.2  0.007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150021  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27481  hypothetical protein  28.21 
 
 		 260 aa  40.8  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.581269 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>