58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0181 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_0181  hypothetical protein  100 
 
 
200 aa  420  1e-117  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1123  hypothetical protein  52.74 
 
 
198 aa  201  8e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1272  hypothetical protein  40.31 
 
 
196 aa  153  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0300  hypothetical protein  43.17 
 
 
193 aa  148  4e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.401229  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2239  hypothetical protein  42.55 
 
 
193 aa  148  5e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.892224 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2451  hypothetical protein  41.05 
 
 
201 aa  148  5e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.875999 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3252  hypothetical protein  43.01 
 
 
174 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1136  hypothetical protein  44.32 
 
 
192 aa  144  9e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0554  hypothetical protein  42.46 
 
 
177 aa  144  1e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2844  hypothetical protein  43.33 
 
 
168 aa  142  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2335  hypothetical protein  38.27 
 
 
198 aa  142  3e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000417097  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1806  hypothetical protein  39.39 
 
 
220 aa  140  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.929401  normal  0.508252 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2426  hypothetical protein  41.21 
 
 
249 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.763748  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1068  hypothetical protein  41.44 
 
 
179 aa  139  3e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0377724 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0825  hypothetical protein  37.19 
 
 
204 aa  136  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0472  protein of unknown function DUF1568  39.25 
 
 
185 aa  136  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.527235  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3321  hypothetical protein  42.86 
 
 
197 aa  136  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.873195  hitchhiker  0.0000029094 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0459  protein of unknown function DUF1568  38.89 
 
 
219 aa  135  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0284  hypothetical protein  39.56 
 
 
187 aa  135  3.0000000000000003e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0315  hypothetical protein  39.56 
 
 
197 aa  134  7.000000000000001e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2720  hypothetical protein  35.06 
 
 
232 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1527  hypothetical protein  39.09 
 
 
199 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1092  hypothetical protein  41.18 
 
 
223 aa  131  6.999999999999999e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.462205  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0544  hypothetical protein  34.23 
 
 
221 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0508  hypothetical protein  35.68 
 
 
197 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1141  hypothetical protein  36.22 
 
 
204 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343798  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1024  hypothetical protein  40.66 
 
 
163 aa  126  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0275616 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1450  hypothetical protein  39.43 
 
 
203 aa  127  2.0000000000000002e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0995  hypothetical protein  40.66 
 
 
163 aa  126  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0837  hypothetical protein  41.24 
 
 
206 aa  125  5e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1035  hypothetical protein  36.23 
 
 
224 aa  124  7e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1350  hypothetical protein  54.29 
 
 
258 aa  124  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0718437  normal  0.104355 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1453  hypothetical protein  37.71 
 
 
203 aa  124  1e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2260  hypothetical protein  37.5 
 
 
207 aa  122  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000303912  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0440  hypothetical protein  32.89 
 
 
251 aa  121  6e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2688  hypothetical protein  37.13 
 
 
239 aa  120  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.968577  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1529  hypothetical protein  35.83 
 
 
192 aa  107  1e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0555  hypothetical protein  53.01 
 
 
127 aa  98.2  8e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1423  hypothetical protein  30.46 
 
 
190 aa  95.5  4e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0723696  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1352  hypothetical protein  63.49 
 
 
172 aa  92.8  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0376314  normal  0.0977946 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1351  hypothetical protein  62.5 
 
 
165 aa  91.3  9e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0430442  normal  0.0970629 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0779  hypothetical protein  47.67 
 
 
107 aa  90.9  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1437  hypothetical protein  30.41 
 
 
200 aa  84.7  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4519  hypothetical protein  41.25 
 
 
152 aa  68.9  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0731  hypothetical protein  26.75 
 
 
176 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1855  hypothetical protein  28.3 
 
 
175 aa  47.8  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2775  hypothetical protein  48.57 
 
 
129 aa  47.8  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.963752  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1317  protein of unknown function DUF1568  23.75 
 
 
179 aa  46.2  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.737296  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1473  transposase, putative  25.31 
 
 
179 aa  46.2  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4373  hypothetical protein  26.85 
 
 
178 aa  45.1  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.295832  normal  0.0449373 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3286  protein of unknown function DUF1568  27.12 
 
 
214 aa  44.3  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00118326  unclonable  0.0000000135739 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0243  hypothetical protein  23.64 
 
 
178 aa  43.9  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.273479  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3702  hypothetical protein  26.61 
 
 
208 aa  42.7  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000809832 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4226  hypothetical protein  22.7 
 
 
177 aa  42.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.853067  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2835  hypothetical protein  23.33 
 
 
191 aa  42.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1689  hypothetical protein  25.81 
 
 
184 aa  41.6  0.008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.625848  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3405  hypothetical protein  21.02 
 
 
179 aa  41.6  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0242544  normal  0.205029 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0788  hypothetical protein  25.62 
 
 
150 aa  41.2  0.01  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>