52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2688 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2688  hypothetical protein  100 
 
 		 239 aa  493  9.999999999999999e-139  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.968577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1453  hypothetical protein  50.69 
 
 		 203 aa  218  6e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1450  hypothetical protein  49.77 
 
 		 203 aa  215  4e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1092  hypothetical protein  48.76 
 
 		 223 aa  207  1e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.462205  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0300  hypothetical protein  47.27 
 
 		 193 aa  197  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.401229  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1806  hypothetical protein  42.06 
 
 		 220 aa  183  2.0000000000000003e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.929401  normal  0.508252 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0837  hypothetical protein  46.89 
 
 		 206 aa  169  4e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2451  hypothetical protein  41.31 
 
 		 201 aa  167  1e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.875999 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3321  hypothetical protein  43.72 
 
 		 197 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.873195  hitchhiker  0.0000029094 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0825  hypothetical protein  44.39 
 
 		 204 aa  165  5e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0459  protein of unknown function DUF1568  40.67 
 
 		 219 aa  164  9e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0472  protein of unknown function DUF1568  39.9 
 
 		 185 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.527235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1141  hypothetical protein  43.13 
 
 		 204 aa  149  3e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343798  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1272  hypothetical protein  38.84 
 
 		 196 aa  148  8e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0508  hypothetical protein  41.83 
 
 		 197 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2720  hypothetical protein  38.82 
 
 		 232 aa  144  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2239  hypothetical protein  41.21 
 
 		 193 aa  143  2e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.892224 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1123  hypothetical protein  37.44 
 
 		 198 aa  140  9.999999999999999e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2426  hypothetical protein  37.44 
 
 		 249 aa  138  8.999999999999999e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.763748  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3252  hypothetical protein  36.97 
 
 		 174 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2260  hypothetical protein  36.92 
 
 		 207 aa  135  8e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000303912  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0181  hypothetical protein  37.93 
 
 		 200 aa  134  9e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1136  hypothetical protein  38.68 
 
 		 192 aa  134  9.999999999999999e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2335  hypothetical protein  38.25 
 
 		 198 aa  133  3e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000417097  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2844  hypothetical protein  36.76 
 
 		 168 aa  132  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0995  hypothetical protein  35.41 
 
 		 163 aa  129  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1024  hypothetical protein  35.41 
 
 		 163 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0275616 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1068  hypothetical protein  37.14 
 
 		 179 aa  128  7.000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0377724 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0544  hypothetical protein  37.39 
 
 		 221 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0315  hypothetical protein  34.89 
 
 		 197 aa  126  3e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1035  hypothetical protein  35.89 
 
 		 224 aa  124  9e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0284  hypothetical protein  37.44 
 
 		 187 aa  124  1e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0440  hypothetical protein  34.32 
 
 		 251 aa  123  2e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1350  hypothetical protein  29.02 
 
 		 258 aa  121  8e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0718437  normal  0.104355 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1437  hypothetical protein  35.32 
 
 		 200 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1527  hypothetical protein  33.96 
 
 		 199 aa  116  1.9999999999999998e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0554  hypothetical protein  36.23 
 
 		 177 aa  115  8.999999999999998e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1529  hypothetical protein  31.98 
 
 		 192 aa  103  3e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0779  hypothetical protein  55.56 
 
 		 107 aa  101  9e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0555  hypothetical protein  45.74 
 
 		 127 aa  95.9  5e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1423  hypothetical protein  32.35 
 
 		 190 aa  94  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0723696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4519  hypothetical protein  41.11 
 
 		 152 aa  76.3  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2775  hypothetical protein  55.56 
 
 		 129 aa  59.3  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.963752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1352  hypothetical protein  29.46 
 
 		 172 aa  55.1  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0376314  normal  0.0977946 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1351  hypothetical protein  36 
 
 		 165 aa  53.9  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0430442  normal  0.0970629 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0262  hypothetical protein  23 
 
 		 152 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2777  hypothetical protein  25.12 
 
 		 149 aa  48.1  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.430133  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4707  hypothetical protein  23.66 
 
 		 152 aa  47  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5083  hypothetical protein  22.8 
 
 		 151 aa  43.5  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.268045  normal  0.309651 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2890  hypothetical protein  26.78 
 
 		 191 aa  42.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1133  hypothetical protein  23.41 
 
 		 153 aa  42  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000547954  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1888  hypothetical protein  37.14 
 
 		 171 aa  41.6  0.01  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.17258  hitchhiker  0.00842787 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>