67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0315 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0315  hypothetical protein  100 
 
 		 197 aa  415  9.999999999999999e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2335  hypothetical protein  44 
 
 		 198 aa  155  4e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000417097  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1272  hypothetical protein  43.2 
 
 		 196 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0825  hypothetical protein  43.48 
 
 		 204 aa  147  7e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2451  hypothetical protein  42.08 
 
 		 201 aa  147  1.0000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.875999 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1068  hypothetical protein  42.02 
 
 		 179 aa  144  7.0000000000000006e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0377724 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3252  hypothetical protein  44.15 
 
 		 174 aa  143  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1035  hypothetical protein  37.56 
 
 		 224 aa  141  6e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0544  hypothetical protein  37.21 
 
 		 221 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2844  hypothetical protein  44.13 
 
 		 168 aa  137  7e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1450  hypothetical protein  40.32 
 
 		 203 aa  136  2e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0300  hypothetical protein  41.71 
 
 		 193 aa  136  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.401229  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2720  hypothetical protein  37.29 
 
 		 232 aa  136  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1453  hypothetical protein  40.98 
 
 		 203 aa  136  3.0000000000000003e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0181  hypothetical protein  39.56 
 
 		 200 aa  134  7.000000000000001e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0995  hypothetical protein  38.59 
 
 		 163 aa  133  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1024  hypothetical protein  38.59 
 
 		 163 aa  134  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0275616 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1092  hypothetical protein  41.46 
 
 		 223 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.462205  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0459  protein of unknown function DUF1568  40 
 
 		 219 aa  128  6e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0837  hypothetical protein  42.41 
 
 		 206 aa  128  7.000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0508  hypothetical protein  39.9 
 
 		 197 aa  127  8.000000000000001e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3321  hypothetical protein  38.89 
 
 		 197 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.873195  hitchhiker  0.0000029094 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1136  hypothetical protein  37.5 
 
 		 192 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0472  protein of unknown function DUF1568  39.15 
 
 		 185 aa  126  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.527235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2260  hypothetical protein  36.68 
 
 		 207 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000303912  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2426  hypothetical protein  36.67 
 
 		 249 aa  126  3e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.763748  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2688  hypothetical protein  34.47 
 
 		 239 aa  124  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.968577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0554  hypothetical protein  38.67 
 
 		 177 aa  119  3e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0440  hypothetical protein  33.92 
 
 		 251 aa  119  3e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0284  hypothetical protein  39.13 
 
 		 187 aa  117  7.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1123  hypothetical protein  36.73 
 
 		 198 aa  111  6e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1806  hypothetical protein  34.12 
 
 		 220 aa  106  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.929401  normal  0.508252 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1527  hypothetical protein  34.34 
 
 		 199 aa  105  3e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1141  hypothetical protein  34.8 
 
 		 204 aa  101  5e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343798  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2239  hypothetical protein  33.51 
 
 		 193 aa  98.2  8e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.892224 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1423  hypothetical protein  31.21 
 
 		 190 aa  87  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0723696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1529  hypothetical protein  30.98 
 
 		 192 aa  87.8  1e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1437  hypothetical protein  31.68 
 
 		 200 aa  84.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1350  hypothetical protein  27.24 
 
 		 258 aa  79.3  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0718437  normal  0.104355 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0555  hypothetical protein  36.89 
 
 		 127 aa  73.2  0.000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1352  hypothetical protein  46.84 
 
 		 172 aa  70.9  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0376314  normal  0.0977946 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0779  hypothetical protein  41.3 
 
 		 107 aa  68.9  0.00000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1351  hypothetical protein  43.9 
 
 		 165 aa  67.8  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0430442  normal  0.0970629 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2775  hypothetical protein  36.26 
 
 		 129 aa  58.2  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.963752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3286  protein of unknown function DUF1568  27.33 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00118326  unclonable  0.0000000135739 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3702  hypothetical protein  30.08 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000809832 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0311  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  28.21 
 
 		 1372 aa  52  0.000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.220801 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1855  hypothetical protein  25.64 
 
 		 175 aa  51.2  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1975  hypothetical protein  26.06 
 
 		 163 aa  50.4  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121263 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4519  hypothetical protein  30 
 
 		 152 aa  49.3  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1685  hypothetical protein  24.34 
 
 		 149 aa  48.9  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.365398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0731  hypothetical protein  26.62 
 
 		 176 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0337  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  25.42 
 
 		 1345 aa  48.5  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.038664  normal  0.920027 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4223  hypothetical protein  27.22 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.228925 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3976  protein of unknown function DUF1568  23.75 
 
 		 151 aa  47  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.183049  normal  0.223747 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3135  hypothetical protein  27.1 
 
 		 176 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.464073  normal  0.01424 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0788  hypothetical protein  23.84 
 
 		 150 aa  45.1  0.0007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4597  hypothetical protein  22.98 
 
 		 151 aa  44.7  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0971888 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2835  hypothetical protein  27.92 
 
 		 191 aa  45.1  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1966  hypothetical protein  27.68 
 
 		 231 aa  44.3  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.74185  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0943  protein of unknown function DUF1568  28.3 
 
 		 163 aa  43.1  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.74816  normal  0.454082 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4226  hypothetical protein  25 
 
 		 177 aa  43.9  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.853067  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1952  hypothetical protein  23.53 
 
 		 178 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1133  hypothetical protein  23.39 
 
 		 153 aa  42.4  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000547954  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2777  hypothetical protein  25.45 
 
 		 149 aa  42  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.430133  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0262  hypothetical protein  25.61 
 
 		 152 aa  42  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2890  hypothetical protein  22.08 
 
 		 191 aa  41.2  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>