135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_4223 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_4223  hypothetical protein  100 
 
 		 212 aa  442  1e-123  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.228925 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3286  protein of unknown function DUF1568  53.37 
 
 		 214 aa  223  2e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00118326  unclonable  0.0000000135739 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3702  hypothetical protein  52.28 
 
 		 208 aa  202  3e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000809832 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5411  protein of unknown function DUF1568  42.72 
 
 		 218 aa  169  3e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000187281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5035  protein of unknown function DUF1568  36.79 
 
 		 214 aa  149  3e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.916294 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0311  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  32.99 
 
 		 1372 aa  95.5  5e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.220801 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0337  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  33.33 
 
 		 1345 aa  94.4  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.038664  normal  0.920027 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1966  hypothetical protein  30.89 
 
 		 231 aa  86.7  3e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.74185  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2777  hypothetical protein  32.48 
 
 		 149 aa  65.5  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.430133  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0943  protein of unknown function DUF1568  27.94 
 
 		 163 aa  59.7  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.74816  normal  0.454082 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0242  protein of unknown function DUF1568  32.76 
 
 		 298 aa  57.8  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0717597  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0231  protein of unknown function DUF1568  32.76 
 
 		 298 aa  57.8  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1975  hypothetical protein  32.26 
 
 		 163 aa  57.4  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121263 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1489  hypothetical protein  34.29 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3976  protein of unknown function DUF1568  33.33 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.183049  normal  0.223747 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1685  hypothetical protein  27.45 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.365398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0595  hypothetical protein  29.7 
 
 		 258 aa  55.8  0.0000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.217159  hitchhiker  2.03187e-17 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12790  transposase  33.03 
 
 		 241 aa  55.1  0.0000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4707  hypothetical protein  31 
 
 		 152 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0220  hypothetical protein  32.17 
 
 		 298 aa  54.3  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0309  hypothetical protein  33.04 
 
 		 297 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.359735  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3465  hypothetical protein  27.94 
 
 		 150 aa  54.3  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1423  hypothetical protein  32.52 
 
 		 190 aa  53.5  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0723696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0459  protein of unknown function DUF1568  35.48 
 
 		 219 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0472  protein of unknown function DUF1568  34.41 
 
 		 185 aa  53.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.527235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3872  hypothetical protein  32.08 
 
 		 317 aa  53.1  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3990  hypothetical protein  29.08 
 
 		 320 aa  52.8  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0917  protein of unknown function DUF1568  33.98 
 
 		 221 aa  52.8  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0793  hypothetical protein  33.04 
 
 		 314 aa  52.8  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0788  hypothetical protein  28.69 
 
 		 150 aa  52.8  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4133  hypothetical protein  29.08 
 
 		 298 aa  52.8  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4421  hypothetical protein  32.26 
 
 		 152 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.268203 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2192  hypothetical protein  31.37 
 
 		 253 aa  52  0.000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107555  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2198  transposase  31.37 
 
 		 253 aa  52  0.000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2474  protein of unknown function DUF1568  31.31 
 
 		 224 aa  51.6  0.000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000403207  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2478  hypothetical protein  34.29 
 
 		 161 aa  51.6  0.000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3277  protein of unknown function DUF1568  34.34 
 
 		 197 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3135  hypothetical protein  28.23 
 
 		 176 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.464073  normal  0.01424 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2153  hypothetical protein  31.78 
 
 		 221 aa  51.2  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0207768  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0331  protein of unknown function DUF1568  32.74 
 
 		 297 aa  50.8  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.214506  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0320  protein of unknown function DUF1568  32.74 
 
 		 297 aa  50.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.726603  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1133  hypothetical protein  32.65 
 
 		 153 aa  50.8  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000547954  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3049  transposase and inactivated derivatives  35.56 
 
 		 226 aa  50.1  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2161  hypothetical protein  31.78 
 
 		 295 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2321  hypothetical protein  31.03 
 
 		 297 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0102584 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3257  hypothetical protein  31.03 
 
 		 314 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3477  hypothetical protein  25.14 
 
 		 188 aa  49.7  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.379705  normal  0.40189 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0902  hypothetical protein  29.86 
 
 		 250 aa  49.7  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4226  hypothetical protein  32.38 
 
 		 177 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.853067  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2835  hypothetical protein  25.69 
 
 		 191 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1724  hypothetical protein  29.36 
 
 		 248 aa  49.3  0.00004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0731  hypothetical protein  27.45 
 
 		 176 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2451  hypothetical protein  29.17 
 
 		 201 aa  49.7  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.875999 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0243  hypothetical protein  27.18 
 
 		 178 aa  48.9  0.00005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.273479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1725  hypothetical protein  29.36 
 
 		 248 aa  49.3  0.00005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3485  hypothetical protein  29.17 
 
 		 260 aa  48.9  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.36702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1620  hypothetical protein  31 
 
 		 313 aa  48.9  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1541  hypothetical protein  28 
 
 		 267 aa  48.9  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.463797  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2887  hypothetical protein  30 
 
 		 242 aa  48.9  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3919  hypothetical protein  26.98 
 
 		 151 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0968412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0033  hypothetical protein  29.81 
 
 		 235 aa  48.5  0.00007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4538  protein of unknown function DUF1568  25.95 
 
 		 251 aa  48.5  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0855967  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0203  hypothetical protein  32.29 
 
 		 288 aa  48.5  0.00008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2563  protein of unknown function DUF1568  26.72 
 
 		 248 aa  48.5  0.00008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0207  hypothetical protein  32.29 
 
 		 288 aa  48.1  0.00009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2771  hypothetical protein  27.55 
 
 		 318 aa  47.8  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0450  transposase  32.46 
 
 		 141 aa  47.8  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1272  hypothetical protein  29.79 
 
 		 196 aa  48.1  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0315  hypothetical protein  27.22 
 
 		 197 aa  47.8  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1423  protein of unknown function DUF1568  28.71 
 
 		 180 aa  48.1  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.7985800000000005e-18 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0201  hypothetical protein  31.25 
 
 		 288 aa  47  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1788  hypothetical protein  31.78 
 
 		 295 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.239361  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0324  protein of unknown function DUF1568  26.21 
 
 		 252 aa  47.4  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.551772  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4373  hypothetical protein  29.25 
 
 		 178 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.295832  normal  0.0449373 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3248  protein of unknown function DUF1568  27.1 
 
 		 181 aa  47  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00178625  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1689  hypothetical protein  27.1 
 
 		 184 aa  47  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.625848  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2844  hypothetical protein  29.35 
 
 		 168 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1717  hypothetical protein  34.86 
 
 		 295 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205722  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1967  hypothetical protein  29.2 
 
 		 282 aa  46.6  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.969925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3016  hypothetical protein  30.43 
 
 		 312 aa  46.2  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1024  hypothetical protein  32.18 
 
 		 163 aa  46.6  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0275616 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1512  hypothetical protein  30.69 
 
 		 222 aa  46.6  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.656335 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3037  protein of unknown function DUF1568  26.04 
 
 		 315 aa  46.6  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0995  hypothetical protein  32.18 
 
 		 163 aa  46.6  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1813  protein of unknown function DUF1568  31.3 
 
 		 277 aa  46.2  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00112655  hitchhiker  0.00000000103135 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1872  hypothetical protein  26.55 
 
 		 277 aa  46.2  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5176  hypothetical protein  30.11 
 
 		 184 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00299086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3405  hypothetical protein  29.91 
 
 		 179 aa  45.4  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0242544  normal  0.205029 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5382  hypothetical protein  33 
 
 		 223 aa  45.4  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564815  normal  0.588654 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2793  transposase-like p;rotein  30.84 
 
 		 165 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5083  hypothetical protein  30.11 
 
 		 151 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.268045  normal  0.309651 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3252  hypothetical protein  29.21 
 
 		 174 aa  45.1  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3026  hypothetical protein  37.29 
 
 		 76 aa  45.1  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.247877  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0262  hypothetical protein  27 
 
 		 152 aa  45.1  0.0009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3020  hypothetical protein  29.81 
 
 		 316 aa  45.1  0.0009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0554  hypothetical protein  28.72 
 
 		 177 aa  44.3  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1952  hypothetical protein  32.38 
 
 		 178 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1962  hypothetical protein  30.3 
 
 		 164 aa  44.3  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0721b  hypothetical protein  24.78 
 
 		 133 aa  44.7  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0770  protein of unknown function DUF1568  25.23 
 
 		 316 aa  44.7  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.717082  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>