83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5035 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_5035  protein of unknown function DUF1568  100 
 
 
214 aa  447  1e-125  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.916294 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3286  protein of unknown function DUF1568  41.9 
 
 
214 aa  180  2e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00118326  unclonable  0.0000000135739 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3702  hypothetical protein  41.05 
 
 
208 aa  159  3e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000809832 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5411  protein of unknown function DUF1568  40.47 
 
 
218 aa  154  8e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000187281  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4223  hypothetical protein  36.79 
 
 
212 aa  149  3e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.228925 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0337  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  32.84 
 
 
1345 aa  97.4  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.038664  normal  0.920027 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0311  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  33.68 
 
 
1372 aa  95.9  4e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.220801 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1966  hypothetical protein  33.69 
 
 
231 aa  86.7  3e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.74185  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3049  transposase and inactivated derivatives  29.73 
 
 
226 aa  55.8  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2620  hypothetical protein  33.68 
 
 
254 aa  54.3  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000852823  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2153  hypothetical protein  29.7 
 
 
221 aa  54.7  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0207768  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4421  hypothetical protein  28.57 
 
 
152 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.268203 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2777  hypothetical protein  25.64 
 
 
149 aa  53.1  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.430133  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2793  transposase-like p;rotein  25.66 
 
 
165 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0179  hypothetical protein  32.63 
 
 
254 aa  52  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0565655  normal  0.576766 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2474  protein of unknown function DUF1568  25 
 
 
224 aa  52  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000403207  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0788  hypothetical protein  22.67 
 
 
150 aa  51.6  0.000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4707  hypothetical protein  25.93 
 
 
152 aa  51.6  0.000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0943  protein of unknown function DUF1568  26.21 
 
 
163 aa  50.8  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.74816  normal  0.454082 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0917  protein of unknown function DUF1568  28.16 
 
 
221 aa  50.4  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0242  protein of unknown function DUF1568  30.69 
 
 
298 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0717597  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5047  hypothetical protein  28.71 
 
 
151 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0419469  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3465  hypothetical protein  28.41 
 
 
150 aa  50.4  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1024  hypothetical protein  26.53 
 
 
163 aa  49.7  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0275616 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0995  hypothetical protein  26.53 
 
 
163 aa  49.7  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3919  hypothetical protein  30.91 
 
 
151 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0968412  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0231  protein of unknown function DUF1568  29.7 
 
 
298 aa  48.9  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3485  hypothetical protein  32.58 
 
 
260 aa  48.5  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.36702  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3477  hypothetical protein  25 
 
 
188 aa  48.5  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.379705  normal  0.40189 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1802  protein of unknown function DUF1568  29 
 
 
240 aa  48.1  0.00009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1574  hypothetical protein  21.92 
 
 
150 aa  47  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.620864  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0902  hypothetical protein  32.58 
 
 
250 aa  47.4  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0220  hypothetical protein  28.71 
 
 
298 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1272  hypothetical protein  25.89 
 
 
196 aa  46.2  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27481  hypothetical protein  32.58 
 
 
260 aa  46.6  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.581269 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0033  hypothetical protein  27.27 
 
 
235 aa  46.6  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0262  hypothetical protein  26.04 
 
 
152 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1975  hypothetical protein  29.6 
 
 
163 aa  46.2  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.121263 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1558  protein of unknown function DUF1568  24.3 
 
 
230 aa  45.8  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.55731 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16060  hypothetical protein  30.86 
 
 
86 aa  45.8  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00113675  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26971  hypothetical protein  32.58 
 
 
260 aa  45.4  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1552  protein of unknown function DUF1568  24.3 
 
 
230 aa  45.4  0.0006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.268269 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1133  hypothetical protein  26.6 
 
 
153 aa  45.1  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000547954  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1685  hypothetical protein  26.74 
 
 
149 aa  45.4  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.365398  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1556  protein of unknown function DUF1568  24.3 
 
 
230 aa  45.4  0.0007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.444415 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1554  protein of unknown function DUF1568  24.3 
 
 
230 aa  45.4  0.0007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.335003 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2844  hypothetical protein  27.08 
 
 
168 aa  45.1  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3872  hypothetical protein  27.45 
 
 
317 aa  45.1  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1489  hypothetical protein  24.79 
 
 
153 aa  45.1  0.0009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27031  hypothetical protein  30.34 
 
 
260 aa  45.1  0.0009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1512  hypothetical protein  27.88 
 
 
222 aa  44.3  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.656335 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0309  hypothetical protein  27.18 
 
 
297 aa  44.3  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.359735  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0613  hypothetical protein  25.23 
 
 
151 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.018198 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03381  hypothetical protein  28.57 
 
 
199 aa  43.9  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.593355 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0568  hypothetical protein  28.57 
 
 
151 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.853287  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3990  hypothetical protein  28.43 
 
 
320 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2563  protein of unknown function DUF1568  23.47 
 
 
248 aa  43.9  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2198  transposase  28.87 
 
 
253 aa  43.5  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4133  hypothetical protein  28.43 
 
 
298 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29611  hypothetical protein  31.11 
 
 
124 aa  43.5  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4538  protein of unknown function DUF1568  25.77 
 
 
251 aa  44.3  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0855967  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3295  hypothetical protein  25 
 
 
230 aa  43.5  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4597  hypothetical protein  23.42 
 
 
151 aa  43.1  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0971888 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3252  hypothetical protein  26.88 
 
 
174 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2192  hypothetical protein  28.87 
 
 
253 aa  43.5  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107555  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3248  protein of unknown function DUF1568  27.27 
 
 
181 aa  43.5  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00178625  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0607  hypothetical protein  28.57 
 
 
151 aa  42.7  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4462  hypothetical protein  24.42 
 
 
152 aa  42.7  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0493  transposase  26 
 
 
222 aa  42.7  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13701  hypothetical protein  28.57 
 
 
164 aa  42.7  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1541  hypothetical protein  30.93 
 
 
267 aa  43.1  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.463797  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0721b  hypothetical protein  26.79 
 
 
133 aa  42.4  0.005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3871  protein of unknown function DUF1568  25.49 
 
 
236 aa  42.4  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0595  hypothetical protein  26.32 
 
 
258 aa  42.4  0.005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.217159  hitchhiker  2.03187e-17 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0996  protein of unknown function DUF1568  25.47 
 
 
216 aa  42.4  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.976226  normal  0.164778 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3026  hypothetical protein  35.85 
 
 
76 aa  42  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.247877  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3976  protein of unknown function DUF1568  25 
 
 
151 aa  42  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.183049  normal  0.223747 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2161  hypothetical protein  30.84 
 
 
295 aa  41.6  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0331  protein of unknown function DUF1568  27.88 
 
 
297 aa  41.6  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.214506  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0790  hypothetical protein  25.47 
 
 
232 aa  41.6  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.513436  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1136  hypothetical protein  25.69 
 
 
192 aa  41.6  0.009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1151  protein of unknown function DUF1568  28.28 
 
 
231 aa  41.6  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01210  transposase  29.79 
 
 
245 aa  41.2  0.01  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>