138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1966 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_1966  hypothetical protein  100 
 
 		 231 aa  484  1e-136  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.74185  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0337  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  65.81 
 
 		 1345 aa  317  1e-85  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.038664  normal  0.920027 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0311  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  68.64 
 
 		 1372 aa  313  1.9999999999999998e-84  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.220801 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3702  hypothetical protein  30.39 
 
 		 208 aa  89.7  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000809832 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3286  protein of unknown function DUF1568  31.44 
 
 		 214 aa  89  6e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00118326  unclonable  0.0000000135739 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4223  hypothetical protein  30.89 
 
 		 212 aa  86.7  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.228925 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5035  protein of unknown function DUF1568  33.69 
 
 		 214 aa  86.7  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.916294 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5411  protein of unknown function DUF1568  29.53 
 
 		 218 aa  70.9  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000187281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1552  hypothetical protein  30.97 
 
 		 205 aa  63.9  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0339239 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0943  protein of unknown function DUF1568  36.63 
 
 		 163 aa  62.4  0.000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.74816  normal  0.454082 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0995  hypothetical protein  38.64 
 
 		 163 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1024  hypothetical protein  38.82 
 
 		 163 aa  60.1  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0275616 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2777  hypothetical protein  36.63 
 
 		 149 aa  59.3  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.430133  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1489  hypothetical protein  36.84 
 
 		 153 aa  57.8  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4446  hypothetical protein  29.52 
 
 		 236 aa  58.2  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.885807  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4421  hypothetical protein  36.73 
 
 		 152 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.268203 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4599  hypothetical protein  35.42 
 
 		 160 aa  57  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1484  hypothetical protein  29.63 
 
 		 231 aa  55.8  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2474  protein of unknown function DUF1568  27.37 
 
 		 224 aa  53.5  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000403207  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1975  hypothetical protein  31.13 
 
 		 163 aa  54.3  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121263 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0472  protein of unknown function DUF1568  34.04 
 
 		 185 aa  52.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.527235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0459  protein of unknown function DUF1568  34.04 
 
 		 219 aa  53.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1574  hypothetical protein  38.67 
 
 		 150 aa  52.4  0.000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.620864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3252  hypothetical protein  35.42 
 
 		 174 aa  52.4  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2844  hypothetical protein  35.42 
 
 		 168 aa  52  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1151  protein of unknown function DUF1568  31.18 
 
 		 231 aa  52  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0788  hypothetical protein  37.33 
 
 		 150 aa  52  0.000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2153  hypothetical protein  28.87 
 
 		 221 aa  52  0.000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0207768  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3277  protein of unknown function DUF1568  31.17 
 
 		 197 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0262  hypothetical protein  36.84 
 
 		 152 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3976  protein of unknown function DUF1568  28.71 
 
 		 151 aa  50.4  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.183049  normal  0.223747 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0708  protein of unknown function DUF1568  31.58 
 
 		 233 aa  50.4  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.615013  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0790  hypothetical protein  28.57 
 
 		 232 aa  50.8  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.513436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1685  hypothetical protein  32.94 
 
 		 149 aa  50.4  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.365398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2426  hypothetical protein  29.06 
 
 		 249 aa  50.8  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.763748  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3465  hypothetical protein  31.19 
 
 		 150 aa  50.8  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1092  hypothetical protein  32.98 
 
 		 223 aa  50.1  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.462205  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0740  hypothetical protein  31.58 
 
 		 255 aa  50.1  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.345588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3122  transposase  32.99 
 
 		 231 aa  49.7  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.299801  normal  0.623865 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0996  protein of unknown function DUF1568  27.85 
 
 		 216 aa  49.7  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.976226  normal  0.164778 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1423  hypothetical protein  28.57 
 
 		 190 aa  49.3  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0723696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2793  transposase-like p;rotein  30 
 
 		 165 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5047  hypothetical protein  38.16 
 
 		 151 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0419469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0682  hypothetical protein  27.62 
 
 		 232 aa  48.9  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.349284  normal  0.584525 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1032  protein of unknown function DUF1568  32.5 
 
 		 326 aa  49.3  0.00006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4707  hypothetical protein  35.53 
 
 		 152 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1802  protein of unknown function DUF1568  30.86 
 
 		 240 aa  48.5  0.00008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0722  protein of unknown function DUF1568  28.57 
 
 		 321 aa  48.5  0.00009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.645218  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5176  hypothetical protein  31.07 
 
 		 184 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00299086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1068  hypothetical protein  25.95 
 
 		 179 aa  48.5  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0377724 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2932  hypothetical protein  30 
 
 		 234 aa  48.1  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.56667  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4462  hypothetical protein  22.77 
 
 		 152 aa  47.8  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2394  hypothetical protein  27.63 
 
 		 239 aa  47.8  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.419691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1133  hypothetical protein  36.59 
 
 		 153 aa  48.1  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000547954  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4597  hypothetical protein  31.4 
 
 		 151 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0971888 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1541  hypothetical protein  30.38 
 
 		 267 aa  47  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.463797  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3049  transposase and inactivated derivatives  27.63 
 
 		 226 aa  47.4  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3871  protein of unknown function DUF1568  28.89 
 
 		 236 aa  47.4  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0093  hypothetical protein  32.89 
 
 		 234 aa  47.4  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150021  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0324  protein of unknown function DUF1568  33.71 
 
 		 252 aa  47.4  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.551772  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16060  hypothetical protein  33.33 
 
 		 86 aa  47  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00113675  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1272  hypothetical protein  31.11 
 
 		 196 aa  47  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1007  hypothetical protein  30.26 
 
 		 234 aa  47  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.849512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2887  hypothetical protein  31.33 
 
 		 242 aa  47  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3919  hypothetical protein  31.58 
 
 		 151 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0968412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0554  hypothetical protein  29.03 
 
 		 177 aa  46.2  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5083  hypothetical protein  31.07 
 
 		 151 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.268045  normal  0.309651 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3670  transposase and inactivated derivatives  30.26 
 
 		 228 aa  46.2  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1929  protein of unknown function DUF1568  34.62 
 
 		 321 aa  46.6  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2451  hypothetical protein  28.19 
 
 		 201 aa  46.2  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.875999 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1364  hypothetical protein  27.88 
 
 		 150 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0968684  normal  0.0104776 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1319  protein of unknown function DUF1568  34.21 
 
 		 319 aa  45.8  0.0005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0490388  hitchhiker  0.00690567 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1141  hypothetical protein  38.18 
 
 		 204 aa  45.8  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343798  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0721b  hypothetical protein  30.19 
 
 		 133 aa  45.8  0.0006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2204  hypothetical protein  34.21 
 
 		 327 aa  45.4  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0595  hypothetical protein  31.58 
 
 		 258 aa  45.4  0.0007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.217159  hitchhiker  2.03187e-17 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1782  protein of unknown function DUF1568  32.89 
 
 		 325 aa  45.4  0.0007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0188832 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2237  hypothetical protein  34.21 
 
 		 321 aa  45.4  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0837  hypothetical protein  25.36 
 
 		 206 aa  44.3  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0347  hypothetical protein  32.47 
 
 		 158 aa  45.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.119312  normal  0.0189577 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4538  protein of unknown function DUF1568  24.27 
 
 		 251 aa  45.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0855967  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1425  hypothetical protein  28.83 
 
 		 321 aa  45.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1427  hypothetical protein  28.83 
 
 		 321 aa  45.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2205  hypothetical protein  34.21 
 
 		 160 aa  45.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2213  hypothetical protein  34.21 
 
 		 321 aa  45.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.809495  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2233  hypothetical protein  34.21 
 
 		 321 aa  45.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2246  hypothetical protein  34.21 
 
 		 321 aa  45.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2563  protein of unknown function DUF1568  26.92 
 
 		 248 aa  44.7  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3295  hypothetical protein  29.11 
 
 		 230 aa  45.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5648  hypothetical protein  25.45 
 
 		 226 aa  45.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.299518  normal  0.988864 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1356  protein of unknown function DUF1568  34.21 
 
 		 321 aa  44.7  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0875577  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1506  protein of unknown function DUF1568  34.21 
 
 		 321 aa  44.7  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1386  protein of unknown function DUF1568  31.08 
 
 		 325 aa  44.7  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1450  hypothetical protein  27.97 
 
 		 203 aa  44.7  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0568  hypothetical protein  29.66 
 
 		 151 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.853287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1554  protein of unknown function DUF1568  25.88 
 
 		 230 aa  43.9  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.335003 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1552  protein of unknown function DUF1568  25.88 
 
 		 230 aa  44.3  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.268269 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12790  transposase  27.93 
 
 		 241 aa  43.9  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0315  hypothetical protein  27.68 
 
 		 197 aa  44.3  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1556  protein of unknown function DUF1568  25.88 
 
 		 230 aa  43.9  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.444415 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>