221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2777 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2777  hypothetical protein  100 
 
 		 149 aa  303  4.0000000000000004e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.430133  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5047  hypothetical protein  52.35 
 
 		 151 aa  147  6e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0419469  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1489  hypothetical protein  49.66 
 
 		 153 aa  146  1.0000000000000001e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4707  hypothetical protein  50 
 
 		 152 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5083  hypothetical protein  51.32 
 
 		 151 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.268045  normal  0.309651 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1133  hypothetical protein  54.97 
 
 		 153 aa  143  9e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000547954  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1574  hypothetical protein  55.56 
 
 		 150 aa  142  1e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.620864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4597  hypothetical protein  51.39 
 
 		 151 aa  140  5e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0971888 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1364  hypothetical protein  48.97 
 
 		 150 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0968684  normal  0.0104776 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4421  hypothetical protein  51.39 
 
 		 152 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.268203 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5236  hypothetical protein  51.32 
 
 		 151 aa  138  3e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0613  hypothetical protein  48.61 
 
 		 151 aa  134  5e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.018198 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3919  hypothetical protein  44.83 
 
 		 151 aa  134  5e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0968412  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0262  hypothetical protein  46.53 
 
 		 152 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0568  hypothetical protein  52.78 
 
 		 151 aa  130  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.853287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0788  hypothetical protein  46 
 
 		 150 aa  130  9e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0607  hypothetical protein  52.08 
 
 		 151 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0943  protein of unknown function DUF1568  45.95 
 
 		 163 aa  126  8.000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.74816  normal  0.454082 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5176  hypothetical protein  50 
 
 		 184 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00299086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1685  hypothetical protein  42.28 
 
 		 149 aa  124  5e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.365398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3976  protein of unknown function DUF1568  43.24 
 
 		 151 aa  115  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.183049  normal  0.223747 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3465  hypothetical protein  39.74 
 
 		 150 aa  104  5e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16060  hypothetical protein  53.49 
 
 		 86 aa  90.5  7e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00113675  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2468  hypothetical protein  34.75 
 
 		 181 aa  77.8  0.00000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.321631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02923  hypothetical protein  35.16 
 
 		 169 aa  68.6  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3286  protein of unknown function DUF1568  38.54 
 
 		 214 aa  67.4  0.00000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00118326  unclonable  0.0000000135739 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0337  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  35.71 
 
 		 1345 aa  66.6  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.038664  normal  0.920027 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0311  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  37.08 
 
 		 1372 aa  66.6  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.220801 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4223  hypothetical protein  32.48 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.228925 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0352  hypothetical protein  32.19 
 
 		 187 aa  65.9  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.642542  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4462  hypothetical protein  32.14 
 
 		 152 aa  66.2  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0917  protein of unknown function DUF1568  32.59 
 
 		 221 aa  66.2  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2835  hypothetical protein  31.21 
 
 		 191 aa  64.3  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3135  hypothetical protein  34.9 
 
 		 176 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.464073  normal  0.01424 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1701  hypothetical protein  34.33 
 
 		 174 aa  63.2  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1423  protein of unknown function DUF1568  32.31 
 
 		 180 aa  62.8  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.7985800000000005e-18 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5411  protein of unknown function DUF1568  34.55 
 
 		 218 aa  61.6  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000187281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2890  hypothetical protein  29.41 
 
 		 191 aa  61.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0361  hypothetical protein  27.86 
 
 		 191 aa  60.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2531  transposase  32.21 
 
 		 187 aa  60.5  0.000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.719011  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3702  hypothetical protein  37.5 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000809832 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1966  hypothetical protein  36.63 
 
 		 231 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.74185  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2474  protein of unknown function DUF1568  34.83 
 
 		 224 aa  58.2  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000403207  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1512  hypothetical protein  32.12 
 
 		 222 aa  58.5  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.656335 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1791  transposase and inactivated derivatives  33.81 
 
 		 323 aa  58.2  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2264  transposase and inactivated derivatives  27.7 
 
 		 323 aa  57.8  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.88974  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2793  transposase-like p;rotein  28.06 
 
 		 165 aa  57.8  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1084  transposase and inactivated derivatives  28.37 
 
 		 338 aa  57  0.00000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1967  hypothetical protein  34.95 
 
 		 282 aa  56.6  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.969925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3049  transposase and inactivated derivatives  28.15 
 
 		 226 aa  56.2  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0996  protein of unknown function DUF1568  28.89 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.976226  normal  0.164778 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3295  hypothetical protein  31.46 
 
 		 230 aa  56.2  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1966  hypothetical protein  34.95 
 
 		 305 aa  55.8  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.527692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2265  transposase and inactivated derivatives  28.87 
 
 		 241 aa  55.8  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0554  hypothetical protein  23.24 
 
 		 177 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0477  hypothetical protein  26.36 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0731  hypothetical protein  27.03 
 
 		 176 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02732  hypothetical protein  38.67 
 
 		 91 aa  55.8  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.979452  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2932  hypothetical protein  36.05 
 
 		 234 aa  55.1  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.56667  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3130  transposase and inactivated derivatives  29.93 
 
 		 178 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0127624  normal  0.415202 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1748  hypothetical protein  28.15 
 
 		 312 aa  55.1  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.994794  normal  0.0128416 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2396  hypothetical protein  30.89 
 
 		 220 aa  54.7  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1888  hypothetical protein  26.95 
 
 		 171 aa  54.3  0.0000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.17258  hitchhiker  0.00842787 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3122  transposase  27.41 
 
 		 231 aa  53.9  0.0000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.299801  normal  0.623865 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1092  hypothetical protein  25.64 
 
 		 223 aa  53.5  0.0000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.462205  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0845  hypothetical protein  30.94 
 
 		 334 aa  53.9  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2321  hypothetical protein  32.59 
 
 		 297 aa  53.5  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0102584 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1802  protein of unknown function DUF1568  27.41 
 
 		 240 aa  53.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5035  protein of unknown function DUF1568  25.64 
 
 		 214 aa  53.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.916294 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4599  hypothetical protein  31.06 
 
 		 160 aa  53.1  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3871  protein of unknown function DUF1568  32.19 
 
 		 236 aa  52.8  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3670  transposase and inactivated derivatives  33.72 
 
 		 228 aa  53.1  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1024  hypothetical protein  27.34 
 
 		 163 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0275616 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0995  hypothetical protein  27.34 
 
 		 163 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2394  hypothetical protein  31.03 
 
 		 239 aa  53.5  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.419691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0708  protein of unknown function DUF1568  29.41 
 
 		 233 aa  53.1  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.615013  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1558  protein of unknown function DUF1568  37.08 
 
 		 230 aa  52.4  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.55731 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1554  protein of unknown function DUF1568  37.08 
 
 		 230 aa  52.4  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.335003 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1055  transposase  29.73 
 
 		 250 aa  52.4  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0740  hypothetical protein  28.78 
 
 		 255 aa  52.8  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.345588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1556  protein of unknown function DUF1568  37.08 
 
 		 230 aa  52.4  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.444415 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2643  transposase domain-containing protein  27.86 
 
 		 335 aa  52  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0309  hypothetical protein  36.73 
 
 		 297 aa  51.6  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.359735  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1975  hypothetical protein  32.52 
 
 		 163 aa  52  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121263 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1406  protein of unknown function DUF1568  29.46 
 
 		 289 aa  51.2  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3926  hypothetical protein  32.18 
 
 		 322 aa  51.6  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2153  hypothetical protein  32.18 
 
 		 221 aa  50.8  0.000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0207768  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0164  transposase  34.07 
 
 		 287 aa  51.2  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0743928  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1541  hypothetical protein  26.15 
 
 		 267 aa  50.8  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.463797  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4226  hypothetical protein  31.51 
 
 		 177 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.853067  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0844  hypothetical protein  28.79 
 
 		 340 aa  50.4  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5382  hypothetical protein  32.61 
 
 		 223 aa  50.4  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564815  normal  0.588654 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2878  protein of unknown function DUF1568  29.23 
 
 		 289 aa  50.4  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000473385 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0954  hypothetical protein  38.2 
 
 		 326 aa  50.1  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.729066  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1552  protein of unknown function DUF1568  35.96 
 
 		 230 aa  49.7  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.268269 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0243  hypothetical protein  33.33 
 
 		 178 aa  50.1  0.00001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.273479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0472  protein of unknown function DUF1568  25.71 
 
 		 185 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.527235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4081  hypothetical protein  33.33 
 
 		 177 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0580442  normal  0.342905 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1552  hypothetical protein  32.05 
 
 		 205 aa  49.7  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0339239 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0595  hypothetical protein  31.76 
 
 		 258 aa  50.1  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.217159  hitchhiker  2.03187e-17 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>