224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1620 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_1620  hypothetical protein  100 
 
 
313 aa  650    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2771  hypothetical protein  51.27 
 
 
318 aa  335  7.999999999999999e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3632  hypothetical protein  51.92 
 
 
316 aa  318  7.999999999999999e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.108416  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0950  hypothetical protein  47.3 
 
 
321 aa  313  1.9999999999999998e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000190963  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3037  protein of unknown function DUF1568  51.89 
 
 
315 aa  300  3e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0770  protein of unknown function DUF1568  45.51 
 
 
316 aa  285  5e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.717082  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1356  hypothetical protein  46.13 
 
 
319 aa  278  1e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.895893  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2885  hypothetical protein  97.96 
 
 
98 aa  207  3e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0793  hypothetical protein  37.27 
 
 
314 aa  203  3e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3016  hypothetical protein  37.07 
 
 
312 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3020  hypothetical protein  34.69 
 
 
316 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2086  hypothetical protein  37.93 
 
 
321 aa  189  4e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.464464  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2264  transposase and inactivated derivatives  37.67 
 
 
323 aa  177  2e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.88974  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2265  transposase and inactivated derivatives  44.39 
 
 
241 aa  175  7e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3926  hypothetical protein  45.58 
 
 
322 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1748  hypothetical protein  48.88 
 
 
312 aa  168  9e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.994794  normal  0.0128416 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0954  hypothetical protein  35.14 
 
 
326 aa  167  1e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.729066  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1967  hypothetical protein  41.47 
 
 
282 aa  167  2e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.969925  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1406  protein of unknown function DUF1568  43.27 
 
 
289 aa  167  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2878  protein of unknown function DUF1568  42.79 
 
 
289 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000473385 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0201  hypothetical protein  40.76 
 
 
288 aa  161  1e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0203  hypothetical protein  44.51 
 
 
288 aa  162  1e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1966  hypothetical protein  40.55 
 
 
305 aa  161  1e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.527692  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2878  protein of unknown function DUF1568  42.79 
 
 
287 aa  161  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0207  hypothetical protein  40.76 
 
 
288 aa  160  2e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1032  protein of unknown function DUF1568  32.82 
 
 
326 aa  159  4e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0845  hypothetical protein  33.65 
 
 
334 aa  155  7e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2643  transposase domain-containing protein  31.6 
 
 
335 aa  154  1e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1791  transposase and inactivated derivatives  34.08 
 
 
323 aa  153  4e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2218  hypothetical protein  31.35 
 
 
327 aa  152  5.9999999999999996e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00293328  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1256  protein of unknown function DUF1568  31.46 
 
 
321 aa  151  1e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0072967  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1813  protein of unknown function DUF1568  37.14 
 
 
277 aa  150  2e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00112655  hitchhiker  0.00000000103135 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1506  protein of unknown function DUF1568  35.31 
 
 
321 aa  150  3e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1423  protein of unknown function DUF1568  33.33 
 
 
325 aa  149  4e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.892865 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2207  protein of unknown function DUF1568  31.11 
 
 
323 aa  149  4e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.45311e-16 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1392  hypothetical protein  29.91 
 
 
320 aa  148  9e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2204  hypothetical protein  33.68 
 
 
327 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2233  hypothetical protein  33.68 
 
 
321 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2237  hypothetical protein  33.68 
 
 
321 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2246  hypothetical protein  33.68 
 
 
321 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4538  protein of unknown function DUF1568  43.18 
 
 
251 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0855967  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0844  hypothetical protein  29.91 
 
 
340 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1356  protein of unknown function DUF1568  34.27 
 
 
321 aa  147  3e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0875577  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2131  hypothetical protein  29.23 
 
 
333 aa  144  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.132605  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1084  transposase and inactivated derivatives  35.47 
 
 
338 aa  143  5e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1484  hypothetical protein  38.97 
 
 
295 aa  142  7e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2213  hypothetical protein  32.98 
 
 
321 aa  142  8e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.809495  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1386  protein of unknown function DUF1568  31.23 
 
 
325 aa  140  1.9999999999999998e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2333  protein of unknown function DUF1568  38.46 
 
 
324 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0722  protein of unknown function DUF1568  35.47 
 
 
321 aa  140  3e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.645218  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1487  hypothetical protein  38.97 
 
 
323 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0925  protein of unknown function DUF1568  31.93 
 
 
336 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2336  protein of unknown function DUF1568  37.44 
 
 
324 aa  139  7e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1319  protein of unknown function DUF1568  32.28 
 
 
319 aa  138  1e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0490388  hitchhiker  0.00690567 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1578  hypothetical protein  30.82 
 
 
316 aa  136  5e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000706252  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0033  hypothetical protein  41.08 
 
 
235 aa  133  3e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0682  hypothetical protein  38.46 
 
 
232 aa  134  3e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.349284  normal  0.584525 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1151  protein of unknown function DUF1568  40.66 
 
 
231 aa  133  3.9999999999999996e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1802  protein of unknown function DUF1568  38.81 
 
 
240 aa  133  5e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1554  protein of unknown function DUF1568  37.21 
 
 
230 aa  133  5e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.335003 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1556  protein of unknown function DUF1568  37.21 
 
 
230 aa  133  5e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.444415 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2454  protein of unknown function DUF1568  29.94 
 
 
321 aa  132  6.999999999999999e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000257297  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1929  protein of unknown function DUF1568  35.38 
 
 
321 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1007  hypothetical protein  41.8 
 
 
234 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.849512  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1558  protein of unknown function DUF1568  38.53 
 
 
230 aa  130  3e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.55731 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4446  hypothetical protein  39.81 
 
 
236 aa  129  5.0000000000000004e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.885807  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3248  protein of unknown function DUF1568  39.11 
 
 
181 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00178625  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2932  hypothetical protein  38.31 
 
 
234 aa  129  6e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.56667  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1552  protein of unknown function DUF1568  36.28 
 
 
230 aa  129  6e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.268269 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1423  protein of unknown function DUF1568  41.04 
 
 
180 aa  129  8.000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.7985800000000005e-18 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1872  hypothetical protein  33.58 
 
 
277 aa  129  9.000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1104  methionine-R-sulfoxide reductase  37.44 
 
 
506 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000471642  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0793  hypothetical protein  30.58 
 
 
335 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000261863  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1425  hypothetical protein  34.19 
 
 
321 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1427  hypothetical protein  34.19 
 
 
321 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1484  hypothetical protein  33.66 
 
 
231 aa  125  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2198  transposase  31.06 
 
 
253 aa  125  1e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2192  hypothetical protein  31.06 
 
 
253 aa  124  2e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107555  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2394  hypothetical protein  36.41 
 
 
239 aa  124  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.419691  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0790  hypothetical protein  40.57 
 
 
232 aa  124  3e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.513436  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0397  protein of unknown function DUF1568  43.26 
 
 
304 aa  123  3e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000164254  normal  0.853679 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0093  hypothetical protein  35.36 
 
 
234 aa  123  5e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150021  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1782  protein of unknown function DUF1568  28.97 
 
 
325 aa  122  7e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0188832 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2897  protein of unknown function DUF1568  33.64 
 
 
250 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0773075 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3244  protein of unknown function DUF1568  32.87 
 
 
241 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3078  protein of unknown function DUF1568  37.43 
 
 
190 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3105  protein of unknown function DUF1568  37.43 
 
 
192 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000625853  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2793  transposase-like p;rotein  45.45 
 
 
165 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0164  transposase  35.85 
 
 
287 aa  120  1.9999999999999998e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0743928  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3122  transposase  33.64 
 
 
231 aa  119  9e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.299801  normal  0.623865 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2966  hypothetical protein  33.18 
 
 
241 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0489  hypothetical protein  37.31 
 
 
310 aa  118  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.448467 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0148  transposase  32.16 
 
 
236 aa  118  9.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0526667  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0595  hypothetical protein  38.67 
 
 
258 aa  118  9.999999999999999e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.217159  hitchhiker  2.03187e-17 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3295  hypothetical protein  34.62 
 
 
230 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0477  hypothetical protein  32.42 
 
 
232 aa  117  3e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0255  hypothetical protein  30.64 
 
 
288 aa  117  3e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0724188  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2205  hypothetical protein  42 
 
 
160 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3871  protein of unknown function DUF1568  32.24 
 
 
236 aa  117  3.9999999999999997e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0996  protein of unknown function DUF1568  34.27 
 
 
216 aa  116  5e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.976226  normal  0.164778 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>