271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1872 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_1872  hypothetical protein  100 
 
 
277 aa  575  1.0000000000000001e-163  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1032  protein of unknown function DUF1568  44.77 
 
 
326 aa  260  2e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1748  hypothetical protein  33.45 
 
 
312 aa  173  2.9999999999999996e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.994794  normal  0.0128416 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2086  hypothetical protein  35.85 
 
 
321 aa  171  1e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.464464  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3016  hypothetical protein  31.73 
 
 
312 aa  163  3e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3020  hypothetical protein  34.7 
 
 
316 aa  160  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0793  hypothetical protein  32.84 
 
 
314 aa  160  3e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2771  hypothetical protein  33.46 
 
 
318 aa  143  4e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2264  transposase and inactivated derivatives  31.39 
 
 
323 aa  139  6e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.88974  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1356  hypothetical protein  30.91 
 
 
319 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.895893  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1967  hypothetical protein  38.51 
 
 
282 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.969925  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1406  protein of unknown function DUF1568  38.64 
 
 
289 aa  130  3e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3926  hypothetical protein  31.39 
 
 
322 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1966  hypothetical protein  37.36 
 
 
305 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.527692  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2878  protein of unknown function DUF1568  37.5 
 
 
289 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000473385 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0207  hypothetical protein  33.07 
 
 
288 aa  125  7e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0203  hypothetical protein  33.07 
 
 
288 aa  125  1e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0950  hypothetical protein  29.63 
 
 
321 aa  124  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000190963  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0770  protein of unknown function DUF1568  31 
 
 
316 aa  123  3e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.717082  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2265  transposase and inactivated derivatives  37.43 
 
 
241 aa  123  4e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0201  hypothetical protein  32.68 
 
 
288 aa  122  5e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1620  hypothetical protein  34.6 
 
 
313 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2878  protein of unknown function DUF1568  31.33 
 
 
287 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1813  protein of unknown function DUF1568  38.02 
 
 
277 aa  119  6e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00112655  hitchhiker  0.00000000103135 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1782  protein of unknown function DUF1568  29.18 
 
 
325 aa  112  7.000000000000001e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0188832 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3037  protein of unknown function DUF1568  32.51 
 
 
315 aa  107  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0164  transposase  36.26 
 
 
287 aa  103  4e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0743928  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0925  protein of unknown function DUF1568  31.22 
 
 
336 aa  99.8  4e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12790  transposase  44.9 
 
 
241 aa  99.8  5e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4538  protein of unknown function DUF1568  37.7 
 
 
251 aa  97.4  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0855967  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0136  transposase  36.3 
 
 
236 aa  97.4  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1423  protein of unknown function DUF1568  30.89 
 
 
325 aa  96.3  5e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.892865 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2643  transposase domain-containing protein  51.22 
 
 
335 aa  95.9  6e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2207  protein of unknown function DUF1568  30.4 
 
 
323 aa  95.5  8e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.45311e-16 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0722  protein of unknown function DUF1568  35.42 
 
 
321 aa  95.1  1e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.645218  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0595  hypothetical protein  37.6 
 
 
258 aa  94.7  1e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.217159  hitchhiker  2.03187e-17 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0148  transposase  36.57 
 
 
236 aa  94  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0526667  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0954  hypothetical protein  36.76 
 
 
326 aa  93.6  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.729066  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1427  hypothetical protein  28.51 
 
 
321 aa  94  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2050  protein of unknown function DUF1568  26.9 
 
 
336 aa  93.6  3e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.633564  normal  0.705399 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1425  hypothetical protein  28.51 
 
 
321 aa  93.2  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0844  hypothetical protein  38.46 
 
 
340 aa  92.4  6e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2153  hypothetical protein  42.11 
 
 
221 aa  92.4  6e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0207768  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1791  transposase and inactivated derivatives  28.03 
 
 
323 aa  92  8e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1484  hypothetical protein  27.59 
 
 
295 aa  91.3  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1084  transposase and inactivated derivatives  38.46 
 
 
338 aa  91.3  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1506  protein of unknown function DUF1568  34.03 
 
 
321 aa  90.5  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2474  protein of unknown function DUF1568  39.42 
 
 
224 aa  90.5  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000403207  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1104  methionine-R-sulfoxide reductase  28.84 
 
 
506 aa  90.1  3e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000471642  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1256  protein of unknown function DUF1568  35.07 
 
 
321 aa  89.7  5e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0072967  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0397  protein of unknown function DUF1568  26.51 
 
 
304 aa  89  7e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000164254  normal  0.853679 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1055  transposase  41.74 
 
 
250 aa  89  8e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1423  protein of unknown function DUF1568  44 
 
 
180 aa  88.2  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.7985800000000005e-18 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0845  hypothetical protein  44.57 
 
 
334 aa  87.8  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3632  hypothetical protein  27.96 
 
 
316 aa  87.8  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.108416  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0489  hypothetical protein  37.5 
 
 
310 aa  87.4  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.448467 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2333  protein of unknown function DUF1568  28.81 
 
 
324 aa  87.8  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3248  protein of unknown function DUF1568  39.62 
 
 
181 aa  87.4  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00178625  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2131  hypothetical protein  35.11 
 
 
333 aa  86.7  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.132605  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1386  protein of unknown function DUF1568  31.02 
 
 
325 aa  87  3e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1487  hypothetical protein  26.73 
 
 
323 aa  87  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2192  hypothetical protein  32.41 
 
 
253 aa  87  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107555  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2198  transposase  32.41 
 
 
253 aa  87.4  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1319  protein of unknown function DUF1568  34.72 
 
 
319 aa  86.7  4e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0490388  hitchhiker  0.00690567 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1724  hypothetical protein  30.66 
 
 
248 aa  85.9  7e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1725  hypothetical protein  30.66 
 
 
248 aa  85.9  7e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1392  hypothetical protein  31.25 
 
 
320 aa  85.9  7e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1929  protein of unknown function DUF1568  28.34 
 
 
321 aa  85.5  8e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3078  protein of unknown function DUF1568  41.18 
 
 
190 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2336  protein of unknown function DUF1568  43.48 
 
 
324 aa  85.1  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4446  hypothetical protein  33.14 
 
 
236 aa  84.3  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.885807  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1554  protein of unknown function DUF1568  31.87 
 
 
230 aa  84.3  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.335003 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3105  protein of unknown function DUF1568  41.18 
 
 
192 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000625853  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0996  protein of unknown function DUF1568  45.26 
 
 
216 aa  84.3  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.976226  normal  0.164778 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1556  protein of unknown function DUF1568  31.87 
 
 
230 aa  84.3  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.444415 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2213  hypothetical protein  31.94 
 
 
321 aa  84  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.809495  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1811  protein of unknown function DUF1568  60.34 
 
 
138 aa  84.3  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00808567  hitchhiker  0.000000000975496 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2218  hypothetical protein  41.41 
 
 
327 aa  84.3  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00293328  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2237  hypothetical protein  27.85 
 
 
321 aa  84.3  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01210  transposase  37.3 
 
 
245 aa  84  0.000000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2204  hypothetical protein  31.94 
 
 
327 aa  84  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2233  hypothetical protein  31.94 
 
 
321 aa  83.6  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2246  hypothetical protein  31.94 
 
 
321 aa  83.6  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1558  protein of unknown function DUF1568  32.56 
 
 
230 aa  82.8  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.55731 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1552  protein of unknown function DUF1568  32.42 
 
 
230 aa  82.8  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.268269 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1356  protein of unknown function DUF1568  31.94 
 
 
321 aa  82.4  0.000000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0875577  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3049  transposase and inactivated derivatives  38.78 
 
 
226 aa  82  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0708  protein of unknown function DUF1568  36.63 
 
 
233 aa  80.9  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.615013  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0682  hypothetical protein  39.81 
 
 
232 aa  81.3  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.349284  normal  0.584525 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1151  protein of unknown function DUF1568  38.83 
 
 
231 aa  80.9  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0740  hypothetical protein  36.63 
 
 
255 aa  80.5  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.345588  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3871  protein of unknown function DUF1568  29.38 
 
 
236 aa  80.1  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1007  hypothetical protein  40 
 
 
234 aa  80.5  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.849512  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2454  protein of unknown function DUF1568  25.43 
 
 
321 aa  79  0.00000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000257297  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0793  hypothetical protein  37.01 
 
 
335 aa  79  0.00000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000261863  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0255  hypothetical protein  37.61 
 
 
288 aa  79  0.00000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0724188  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2932  hypothetical protein  38.83 
 
 
234 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.56667  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2205  hypothetical protein  39.36 
 
 
160 aa  77.4  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1701  hypothetical protein  37.4 
 
 
174 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1967  hypothetical protein  30.77 
 
 
226 aa  77.4  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00827335  normal  0.496503 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>