265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3632 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_3632  hypothetical protein  100 
 
 
316 aa  655    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.108416  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3037  protein of unknown function DUF1568  64.01 
 
 
315 aa  376  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0770  protein of unknown function DUF1568  55.06 
 
 
316 aa  367  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.717082  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2771  hypothetical protein  52.77 
 
 
318 aa  330  1e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1620  hypothetical protein  51.92 
 
 
313 aa  331  1e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0950  hypothetical protein  49.84 
 
 
321 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000190963  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1356  hypothetical protein  49.01 
 
 
319 aa  278  6e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.895893  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0793  hypothetical protein  36.08 
 
 
314 aa  205  8e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3016  hypothetical protein  36.11 
 
 
312 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3020  hypothetical protein  32.41 
 
 
316 aa  186  5e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3926  hypothetical protein  33.44 
 
 
322 aa  185  9e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2264  transposase and inactivated derivatives  34.66 
 
 
323 aa  183  3e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.88974  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2265  transposase and inactivated derivatives  42.23 
 
 
241 aa  178  1e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1748  hypothetical protein  35.4 
 
 
312 aa  173  2.9999999999999996e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.994794  normal  0.0128416 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2086  hypothetical protein  34.95 
 
 
321 aa  171  2e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.464464  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0954  hypothetical protein  35.29 
 
 
326 aa  163  3e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.729066  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2233  hypothetical protein  32.06 
 
 
321 aa  162  8.000000000000001e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2237  hypothetical protein  32.06 
 
 
321 aa  162  8.000000000000001e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2246  hypothetical protein  32.06 
 
 
321 aa  162  8.000000000000001e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2878  protein of unknown function DUF1568  42.03 
 
 
289 aa  162  9e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000473385 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1406  protein of unknown function DUF1568  41.06 
 
 
289 aa  160  4e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2204  hypothetical protein  32.46 
 
 
327 aa  160  4e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1084  transposase and inactivated derivatives  31.56 
 
 
338 aa  159  6e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1356  protein of unknown function DUF1568  31.75 
 
 
321 aa  157  1e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0875577  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2213  hypothetical protein  31.75 
 
 
321 aa  158  1e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.809495  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2878  protein of unknown function DUF1568  40.09 
 
 
287 aa  157  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2218  hypothetical protein  31.45 
 
 
327 aa  155  7e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00293328  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2207  protein of unknown function DUF1568  30.89 
 
 
323 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.45311e-16 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1966  hypothetical protein  41.44 
 
 
305 aa  151  1e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.527692  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1506  protein of unknown function DUF1568  31.11 
 
 
321 aa  151  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2643  transposase domain-containing protein  31.99 
 
 
335 aa  152  1e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1967  hypothetical protein  40.88 
 
 
282 aa  151  2e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.969925  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1392  hypothetical protein  31.69 
 
 
320 aa  149  8e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1791  transposase and inactivated derivatives  32.29 
 
 
323 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0207  hypothetical protein  41.76 
 
 
288 aa  145  9e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2885  hypothetical protein  63.27 
 
 
98 aa  144  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0203  hypothetical protein  41.21 
 
 
288 aa  144  3e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1423  protein of unknown function DUF1568  31.38 
 
 
325 aa  144  3e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.892865 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1813  protein of unknown function DUF1568  42.7 
 
 
277 aa  144  3e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00112655  hitchhiker  0.00000000103135 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0201  hypothetical protein  41.21 
 
 
288 aa  143  4e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0722  protein of unknown function DUF1568  30.7 
 
 
321 aa  143  4e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.645218  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1256  protein of unknown function DUF1568  31.21 
 
 
321 aa  143  4e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0072967  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2131  hypothetical protein  29.69 
 
 
333 aa  143  4e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.132605  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1319  protein of unknown function DUF1568  31.05 
 
 
319 aa  141  9.999999999999999e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0490388  hitchhiker  0.00690567 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0682  hypothetical protein  35.16 
 
 
232 aa  141  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.349284  normal  0.584525 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0033  hypothetical protein  38.94 
 
 
235 aa  139  6e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0477  hypothetical protein  36.23 
 
 
232 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0845  hypothetical protein  39.29 
 
 
334 aa  137  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0844  hypothetical protein  28.32 
 
 
340 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4446  hypothetical protein  36.41 
 
 
236 aa  136  6.0000000000000005e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.885807  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2333  protein of unknown function DUF1568  30.16 
 
 
324 aa  135  7.000000000000001e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0790  hypothetical protein  35.58 
 
 
232 aa  135  8e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.513436  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0793  hypothetical protein  30.18 
 
 
335 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000261863  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1484  hypothetical protein  33.97 
 
 
231 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0925  protein of unknown function DUF1568  30 
 
 
336 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1007  hypothetical protein  38.57 
 
 
234 aa  133  3.9999999999999996e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.849512  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1484  hypothetical protein  29.97 
 
 
295 aa  132  6.999999999999999e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4538  protein of unknown function DUF1568  34.5 
 
 
251 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0855967  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1929  protein of unknown function DUF1568  28.34 
 
 
321 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3295  hypothetical protein  36.67 
 
 
230 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0996  protein of unknown function DUF1568  39.34 
 
 
216 aa  129  6e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.976226  normal  0.164778 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0255  hypothetical protein  31.06 
 
 
288 aa  129  6e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0724188  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2336  protein of unknown function DUF1568  27.81 
 
 
324 aa  129  7.000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1487  hypothetical protein  30.15 
 
 
323 aa  129  9.000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1151  protein of unknown function DUF1568  36.41 
 
 
231 aa  128  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1802  protein of unknown function DUF1568  35.41 
 
 
240 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1427  hypothetical protein  29.34 
 
 
321 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1032  protein of unknown function DUF1568  29.54 
 
 
326 aa  127  3e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1425  hypothetical protein  31.25 
 
 
321 aa  126  4.0000000000000003e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1578  hypothetical protein  27.56 
 
 
316 aa  125  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000706252  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2932  hypothetical protein  34.86 
 
 
234 aa  124  3e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.56667  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2394  hypothetical protein  35.58 
 
 
239 aa  123  3e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.419691  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1386  protein of unknown function DUF1568  29.62 
 
 
325 aa  124  3e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1554  protein of unknown function DUF1568  33.01 
 
 
230 aa  123  4e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.335003 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2454  protein of unknown function DUF1568  27.71 
 
 
321 aa  123  4e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000257297  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1556  protein of unknown function DUF1568  33.01 
 
 
230 aa  123  4e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.444415 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1782  protein of unknown function DUF1568  28.57 
 
 
325 aa  122  7e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0188832 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3122  transposase  33.01 
 
 
231 aa  122  8e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.299801  normal  0.623865 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1558  protein of unknown function DUF1568  33.01 
 
 
230 aa  121  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.55731 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3248  protein of unknown function DUF1568  35.75 
 
 
181 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00178625  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0708  protein of unknown function DUF1568  34.15 
 
 
233 aa  120  3e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.615013  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1104  methionine-R-sulfoxide reductase  28.4 
 
 
506 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000471642  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0093  hypothetical protein  36.26 
 
 
234 aa  120  3.9999999999999996e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150021  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1552  protein of unknown function DUF1568  32.06 
 
 
230 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.268269 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0164  transposase  33.65 
 
 
287 aa  119  7.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0743928  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3105  protein of unknown function DUF1568  35.2 
 
 
192 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000625853  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1423  protein of unknown function DUF1568  39.29 
 
 
180 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.7985800000000005e-18 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0397  protein of unknown function DUF1568  34.59 
 
 
304 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000164254  normal  0.853679 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3078  protein of unknown function DUF1568  35.2 
 
 
190 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2897  protein of unknown function DUF1568  33.82 
 
 
250 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0773075 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2966  hypothetical protein  33.33 
 
 
241 aa  117  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2776  hypothetical protein  34.65 
 
 
235 aa  117  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.721483  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0740  hypothetical protein  33.5 
 
 
255 aa  116  3.9999999999999997e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.345588  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3244  protein of unknown function DUF1568  32.85 
 
 
241 aa  116  5e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0148  transposase  33.12 
 
 
236 aa  115  1.0000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0526667  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3670  transposase and inactivated derivatives  31.25 
 
 
228 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1701  hypothetical protein  36.97 
 
 
174 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1967  hypothetical protein  35.5 
 
 
226 aa  112  1.0000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00827335  normal  0.496503 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2793  transposase-like p;rotein  39.86 
 
 
165 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2789  hypothetical protein  31.02 
 
 
235 aa  110  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.603101  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>