164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2885 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1620  hypothetical protein  97.96 
 
 		 313 aa  206  8e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2885  hypothetical protein  100 
 
 		 98 aa  206  1e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2771  hypothetical protein  67.35 
 
 		 318 aa  149  1e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3632  hypothetical protein  63.27 
 
 		 316 aa  144  5e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.108416  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0950  hypothetical protein  61.22 
 
 		 321 aa  143  8.000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000190963  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3037  protein of unknown function DUF1568  64.29 
 
 		 315 aa  135  1e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0770  protein of unknown function DUF1568  56.12 
 
 		 316 aa  123  9e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.717082  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1356  hypothetical protein  53.06 
 
 		 319 aa  113  8.999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.895893  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3926  hypothetical protein  46.94 
 
 		 322 aa  92  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3020  hypothetical protein  42.86 
 
 		 316 aa  87.4  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3016  hypothetical protein  43.88 
 
 		 312 aa  87  7e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0793  hypothetical protein  42.86 
 
 		 314 aa  85.1  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1406  protein of unknown function DUF1568  43.88 
 
 		 289 aa  84.7  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2878  protein of unknown function DUF1568  42.86 
 
 		 289 aa  82  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000473385 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1748  hypothetical protein  43.88 
 
 		 312 aa  81.6  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.994794  normal  0.0128416 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2264  transposase and inactivated derivatives  38.78 
 
 		 323 aa  80.5  0.000000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.88974  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4538  protein of unknown function DUF1568  41.84 
 
 		 251 aa  80.1  0.000000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0855967  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0397  protein of unknown function DUF1568  41.05 
 
 		 304 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000164254  normal  0.853679 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2878  protein of unknown function DUF1568  40.82 
 
 		 287 aa  79  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2265  transposase and inactivated derivatives  37.76 
 
 		 241 aa  76.6  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1966  hypothetical protein  36.73 
 
 		 305 aa  75.1  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.527692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1967  hypothetical protein  36.73 
 
 		 282 aa  75.1  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.969925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2050  protein of unknown function DUF1568  40.82 
 
 		 336 aa  75.1  0.0000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.633564  normal  0.705399 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0207  hypothetical protein  36.73 
 
 		 288 aa  73.9  0.0000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0203  hypothetical protein  36.73 
 
 		 288 aa  73.9  0.0000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0201  hypothetical protein  36.73 
 
 		 288 aa  73.6  0.0000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0033  hypothetical protein  40.4 
 
 		 235 aa  73.6  0.0000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3248  protein of unknown function DUF1568  36.73 
 
 		 181 aa  72.8  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00178625  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2198  transposase  37.76 
 
 		 253 aa  71.6  0.000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0167  hypothetical protein  39.8 
 
 		 101 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2192  hypothetical protein  37.76 
 
 		 253 aa  71.2  0.000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107555  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1423  protein of unknown function DUF1568  39.8 
 
 		 180 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.7985800000000005e-18 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1802  protein of unknown function DUF1568  38 
 
 		 240 aa  69.7  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1319  protein of unknown function DUF1568  39.8 
 
 		 319 aa  69.3  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0490388  hitchhiker  0.00690567 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2086  hypothetical protein  39.8 
 
 		 321 aa  68.2  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.464464  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2394  hypothetical protein  42.42 
 
 		 239 aa  67.4  0.00000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.419691  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3078  protein of unknown function DUF1568  35.71 
 
 		 190 aa  67  0.00000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3105  protein of unknown function DUF1568  35.71 
 
 		 192 aa  67.4  0.00000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000625853  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2932  hypothetical protein  38.38 
 
 		 234 aa  66.6  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.56667  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0996  protein of unknown function DUF1568  39 
 
 		 216 aa  66.2  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.976226  normal  0.164778 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2204  hypothetical protein  38.78 
 
 		 327 aa  66.6  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2233  hypothetical protein  38.78 
 
 		 321 aa  66.6  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2237  hypothetical protein  38.78 
 
 		 321 aa  66.6  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2246  hypothetical protein  38.78 
 
 		 321 aa  66.6  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0682  hypothetical protein  36.36 
 
 		 232 aa  66.6  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.349284  normal  0.584525 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0489  hypothetical protein  40.4 
 
 		 310 aa  66.6  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.448467 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0093  hypothetical protein  34.34 
 
 		 234 aa  66.2  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150021  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2793  transposase-like p;rotein  40 
 
 		 165 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1151  protein of unknown function DUF1568  38.38 
 
 		 231 aa  65.9  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2205  hypothetical protein  38.78 
 
 		 160 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2224  hypothetical protein  38.78 
 
 		 112 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00479916  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1386  protein of unknown function DUF1568  34.69 
 
 		 325 aa  65.5  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1724  hypothetical protein  36.73 
 
 		 248 aa  65.1  0.0000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1725  hypothetical protein  36.73 
 
 		 248 aa  65.1  0.0000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2396  hypothetical protein  42 
 
 		 220 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1356  protein of unknown function DUF1568  38.78 
 
 		 321 aa  64.7  0.0000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0875577  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0324  protein of unknown function DUF1568  39.18 
 
 		 252 aa  64.7  0.0000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.551772  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2333  protein of unknown function DUF1568  35.71 
 
 		 324 aa  64.3  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1813  protein of unknown function DUF1568  35.71 
 
 		 277 aa  64.3  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00112655  hitchhiker  0.00000000103135 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1811  protein of unknown function DUF1568  35.71 
 
 		 138 aa  64.3  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00808567  hitchhiker  0.000000000975496 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1506  protein of unknown function DUF1568  38.78 
 
 		 321 aa  64.3  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1554  protein of unknown function DUF1568  38 
 
 		 230 aa  63.9  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.335003 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1556  protein of unknown function DUF1568  38 
 
 		 230 aa  63.9  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.444415 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2336  protein of unknown function DUF1568  34.69 
 
 		 324 aa  64.3  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1256  protein of unknown function DUF1568  38.78 
 
 		 321 aa  63.9  0.0000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0072967  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1487  hypothetical protein  36.73 
 
 		 323 aa  63.9  0.0000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3122  transposase  36.36 
 
 		 231 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.299801  normal  0.623865 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0790  hypothetical protein  37.37 
 
 		 232 aa  63.5  0.0000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.513436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1558  protein of unknown function DUF1568  38 
 
 		 230 aa  63.2  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.55731 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1552  protein of unknown function DUF1568  38 
 
 		 230 aa  63.2  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.268269 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0722  protein of unknown function DUF1568  37.76 
 
 		 321 aa  63.2  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.645218  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1423  protein of unknown function DUF1568  36.73 
 
 		 325 aa  62.8  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.892865 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1484  hypothetical protein  36.73 
 
 		 295 aa  63.2  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0954  hypothetical protein  37.76 
 
 		 326 aa  62.8  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.729066  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1578  hypothetical protein  37.62 
 
 		 316 aa  62  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000706252  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1104  methionine-R-sulfoxide reductase  36.73 
 
 		 506 aa  62.4  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000471642  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1007  hypothetical protein  40.59 
 
 		 234 aa  62.4  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.849512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2213  hypothetical protein  36.73 
 
 		 321 aa  61.2  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.809495  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2218  hypothetical protein  36.73 
 
 		 327 aa  60.8  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00293328  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0925  protein of unknown function DUF1568  35.71 
 
 		 336 aa  60.8  0.000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3295  hypothetical protein  34.34 
 
 		 230 aa  60.5  0.000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1701  hypothetical protein  37.37 
 
 		 174 aa  60.5  0.000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1055  transposase  28.57 
 
 		 250 aa  60.5  0.000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0844  hypothetical protein  34.69 
 
 		 340 aa  60.5  0.000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0595  hypothetical protein  33.67 
 
 		 258 aa  60.1  0.000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.217159  hitchhiker  2.03187e-17 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2643  transposase domain-containing protein  35.71 
 
 		 335 aa  59.7  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2207  protein of unknown function DUF1568  35.35 
 
 		 323 aa  59.7  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.45311e-16 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1425  hypothetical protein  36.73 
 
 		 321 aa  60.1  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1427  hypothetical protein  36.73 
 
 		 321 aa  60.1  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1084  transposase and inactivated derivatives  35.71 
 
 		 338 aa  58.9  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0708  protein of unknown function DUF1568  37.62 
 
 		 233 aa  58.9  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.615013  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0477  hypothetical protein  33.33 
 
 		 232 aa  58.5  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1484  hypothetical protein  31.31 
 
 		 231 aa  58.5  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0148  transposase  33.33 
 
 		 236 aa  58.2  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0526667  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3049  transposase and inactivated derivatives  32.32 
 
 		 226 aa  57.8  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01210  transposase  31.63 
 
 		 245 aa  57.8  0.00000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12790  transposase  33.72 
 
 		 241 aa  57.8  0.00000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0845  hypothetical protein  36.89 
 
 		 334 aa  57.8  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1512  hypothetical protein  35.35 
 
 		 222 aa  57.4  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.656335 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1929  protein of unknown function DUF1568  37 
 
 		 321 aa  57  0.00000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>