209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2207 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_2207  protein of unknown function DUF1568  100 
 
 
323 aa  657    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.45311e-16 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0844  hypothetical protein  45.03 
 
 
340 aa  262  8e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1084  transposase and inactivated derivatives  41.8 
 
 
338 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1392  hypothetical protein  43.65 
 
 
320 aa  244  9.999999999999999e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2218  hypothetical protein  41.3 
 
 
327 aa  243  3e-63  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00293328  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1423  protein of unknown function DUF1568  41.49 
 
 
325 aa  243  3e-63  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.892865 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1487  hypothetical protein  42.24 
 
 
323 aa  239  5e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0925  protein of unknown function DUF1568  42.67 
 
 
336 aa  239  5e-62  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1484  hypothetical protein  44.06 
 
 
295 aa  236  3e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1256  protein of unknown function DUF1568  42.06 
 
 
321 aa  236  4e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0072967  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1104  methionine-R-sulfoxide reductase  42.72 
 
 
506 aa  235  7e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000471642  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2643  transposase domain-containing protein  40.67 
 
 
335 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0845  hypothetical protein  47.76 
 
 
334 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0793  hypothetical protein  41.36 
 
 
335 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000261863  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1386  protein of unknown function DUF1568  44.97 
 
 
325 aa  230  2e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0954  hypothetical protein  42.17 
 
 
326 aa  227  3e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.729066  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2131  hypothetical protein  41.12 
 
 
333 aa  223  4.9999999999999996e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.132605  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2333  protein of unknown function DUF1568  37.92 
 
 
324 aa  220  3e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1319  protein of unknown function DUF1568  40.91 
 
 
319 aa  213  2.9999999999999995e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0490388  hitchhiker  0.00690567 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0722  protein of unknown function DUF1568  38.64 
 
 
321 aa  211  2e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.645218  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2336  protein of unknown function DUF1568  37.38 
 
 
324 aa  211  2e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1506  protein of unknown function DUF1568  39.54 
 
 
321 aa  211  2e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1425  hypothetical protein  39.94 
 
 
321 aa  206  4e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1427  hypothetical protein  39.61 
 
 
321 aa  206  4e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1929  protein of unknown function DUF1568  41.26 
 
 
321 aa  204  1e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1356  protein of unknown function DUF1568  39.22 
 
 
321 aa  202  5e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0875577  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1782  protein of unknown function DUF1568  37.58 
 
 
325 aa  202  5e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0188832 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2204  hypothetical protein  38.89 
 
 
327 aa  202  8e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2237  hypothetical protein  38.89 
 
 
321 aa  202  8e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2233  hypothetical protein  38.89 
 
 
321 aa  202  9e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2246  hypothetical protein  38.89 
 
 
321 aa  202  9e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2213  hypothetical protein  38.56 
 
 
321 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.809495  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1791  transposase and inactivated derivatives  43.62 
 
 
323 aa  191  1e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2454  protein of unknown function DUF1568  38.24 
 
 
321 aa  189  5e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000257297  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0255  hypothetical protein  36.13 
 
 
288 aa  179  4e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0724188  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1423  protein of unknown function DUF1568  50.99 
 
 
180 aa  177  3e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.7985800000000005e-18 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1578  hypothetical protein  34.98 
 
 
316 aa  172  7.999999999999999e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000706252  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2205  hypothetical protein  51.66 
 
 
160 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0950  hypothetical protein  32.7 
 
 
321 aa  157  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000190963  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0770  protein of unknown function DUF1568  33.81 
 
 
316 aa  155  7e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.717082  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3016  hypothetical protein  36.21 
 
 
312 aa  155  1e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0793  hypothetical protein  35.77 
 
 
314 aa  152  8.999999999999999e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1620  hypothetical protein  32.23 
 
 
313 aa  149  6e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2771  hypothetical protein  31.65 
 
 
318 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3926  hypothetical protein  32.97 
 
 
322 aa  143  4e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3020  hypothetical protein  39.36 
 
 
316 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3037  protein of unknown function DUF1568  30.54 
 
 
315 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1356  hypothetical protein  31.65 
 
 
319 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.895893  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3632  hypothetical protein  30.89 
 
 
316 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.108416  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0167  hypothetical protein  56.86 
 
 
101 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1967  hypothetical protein  39.25 
 
 
282 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.969925  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1748  hypothetical protein  39.13 
 
 
312 aa  126  5e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.994794  normal  0.0128416 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2265  transposase and inactivated derivatives  36.08 
 
 
241 aa  124  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1966  hypothetical protein  38.17 
 
 
305 aa  123  4e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.527692  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0203  hypothetical protein  34.27 
 
 
288 aa  123  5e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2264  transposase and inactivated derivatives  35.57 
 
 
323 aa  122  7e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.88974  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1406  protein of unknown function DUF1568  35 
 
 
289 aa  122  7e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2878  protein of unknown function DUF1568  35.5 
 
 
289 aa  122  8e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000473385 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0201  hypothetical protein  38.17 
 
 
288 aa  121  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0207  hypothetical protein  33.06 
 
 
288 aa  121  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4538  protein of unknown function DUF1568  36.67 
 
 
251 aa  120  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0855967  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2192  hypothetical protein  33.87 
 
 
253 aa  120  3.9999999999999996e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107555  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0164  transposase  38.3 
 
 
287 aa  119  9.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0743928  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2198  transposase  33.33 
 
 
253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2878  protein of unknown function DUF1568  32.84 
 
 
287 aa  116  6e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1032  protein of unknown function DUF1568  37.91 
 
 
326 aa  116  6.9999999999999995e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0148  transposase  35.86 
 
 
236 aa  114  3e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0526667  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1055  transposase  40.69 
 
 
250 aa  112  6e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1813  protein of unknown function DUF1568  36.56 
 
 
277 aa  112  6e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00112655  hitchhiker  0.00000000103135 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2050  protein of unknown function DUF1568  35.68 
 
 
336 aa  112  6e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.633564  normal  0.705399 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0136  transposase  35.86 
 
 
236 aa  110  4.0000000000000004e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2153  hypothetical protein  32.39 
 
 
221 aa  109  6e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0207768  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1785  hypothetical protein  31.07 
 
 
264 aa  109  6e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1007  hypothetical protein  37.82 
 
 
234 aa  106  6e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.849512  normal 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0033  hypothetical protein  36.3 
 
 
235 aa  105  7e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0595  hypothetical protein  37.75 
 
 
258 aa  105  9e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.217159  hitchhiker  2.03187e-17 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01210  transposase  41.26 
 
 
245 aa  104  2e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2474  protein of unknown function DUF1568  39.04 
 
 
224 aa  104  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000403207  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2086  hypothetical protein  27.78 
 
 
321 aa  104  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.464464  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12790  transposase  38.71 
 
 
241 aa  102  7e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2224  hypothetical protein  46.23 
 
 
112 aa  102  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00479916  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3105  protein of unknown function DUF1568  32.99 
 
 
192 aa  101  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000625853  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3248  protein of unknown function DUF1568  33.33 
 
 
181 aa  101  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00178625  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0708  protein of unknown function DUF1568  34 
 
 
233 aa  100  3e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.615013  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0996  protein of unknown function DUF1568  30.96 
 
 
216 aa  100  4e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.976226  normal  0.164778 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3078  protein of unknown function DUF1568  32.82 
 
 
190 aa  100  4e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0093  hypothetical protein  43.85 
 
 
234 aa  98.6  1e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150021  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0740  hypothetical protein  33.84 
 
 
255 aa  98.6  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.345588  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1724  hypothetical protein  37.59 
 
 
248 aa  97.8  2e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1151  protein of unknown function DUF1568  39.85 
 
 
231 aa  98.2  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0682  hypothetical protein  34.54 
 
 
232 aa  98.2  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.349284  normal  0.584525 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1552  protein of unknown function DUF1568  34.95 
 
 
230 aa  97.8  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.268269 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2394  hypothetical protein  35.07 
 
 
239 aa  97.4  3e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.419691  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1725  hypothetical protein  36.88 
 
 
248 aa  97.1  4e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1872  hypothetical protein  30.4 
 
 
277 aa  95.5  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1554  protein of unknown function DUF1568  34.47 
 
 
230 aa  95.1  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.335003 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0489  hypothetical protein  39.1 
 
 
310 aa  95.5  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.448467 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1556  protein of unknown function DUF1568  34.47 
 
 
230 aa  95.1  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.444415 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4446  hypothetical protein  31.86 
 
 
236 aa  94.4  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.885807  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2932  hypothetical protein  40.15 
 
 
234 aa  95.1  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.56667  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>