209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1084 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1084  transposase and inactivated derivatives  100 
 
 		 338 aa  697    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2643  transposase domain-containing protein  76.33 
 
 		 335 aa  526  1e-148  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0844  hypothetical protein  51.93 
 
 		 340 aa  359  3e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0793  hypothetical protein  49.55 
 
 		 335 aa  350  2e-95  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000261863  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1423  protein of unknown function DUF1568  46.56 
 
 		 325 aa  296  4e-79  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.892865 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1392  hypothetical protein  46.25 
 
 		 320 aa  296  5e-79  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2218  hypothetical protein  43.4 
 
 		 327 aa  291  7e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00293328  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0925  protein of unknown function DUF1568  45.31 
 
 		 336 aa  290  2e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1487  hypothetical protein  43.75 
 
 		 323 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0954  hypothetical protein  47.71 
 
 		 326 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.729066  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0845  hypothetical protein  44.61 
 
 		 334 aa  282  5.000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2131  hypothetical protein  45.62 
 
 		 333 aa  282  7.000000000000001e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.132605  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1104  methionine-R-sulfoxide reductase  44.62 
 
 		 506 aa  280  3e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000471642  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1484  hypothetical protein  45.05 
 
 		 295 aa  276  4e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2333  protein of unknown function DUF1568  43.85 
 
 		 324 aa  272  5.000000000000001e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1256  protein of unknown function DUF1568  43.12 
 
 		 321 aa  271  1e-71  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0072967  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1929  protein of unknown function DUF1568  44.13 
 
 		 321 aa  270  2.9999999999999997e-71  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1386  protein of unknown function DUF1568  43.67 
 
 		 325 aa  269  5.9999999999999995e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0722  protein of unknown function DUF1568  44.2 
 
 		 321 aa  265  1e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.645218  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2336  protein of unknown function DUF1568  42.99 
 
 		 324 aa  264  2e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1791  transposase and inactivated derivatives  44.71 
 
 		 323 aa  262  6e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1356  protein of unknown function DUF1568  41.61 
 
 		 321 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0875577  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1506  protein of unknown function DUF1568  40.37 
 
 		 321 aa  253  3e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1423  protein of unknown function DUF1568  69.82 
 
 		 180 aa  252  5.000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.7985800000000005e-18 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2233  hypothetical protein  40.88 
 
 		 321 aa  252  5.000000000000001e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2246  hypothetical protein  40.88 
 
 		 321 aa  252  5.000000000000001e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2237  hypothetical protein  40.88 
 
 		 321 aa  252  7e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1427  hypothetical protein  42.14 
 
 		 321 aa  252  8.000000000000001e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2213  hypothetical protein  40.88 
 
 		 321 aa  251  1e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.809495  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1425  hypothetical protein  41.82 
 
 		 321 aa  251  2e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2204  hypothetical protein  41.42 
 
 		 327 aa  249  4e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1319  protein of unknown function DUF1568  41.51 
 
 		 319 aa  249  5e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0490388  hitchhiker  0.00690567 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2454  protein of unknown function DUF1568  40.57 
 
 		 321 aa  248  1e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000257297  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2207  protein of unknown function DUF1568  41.8 
 
 		 323 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.45311e-16 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1782  protein of unknown function DUF1568  38.94 
 
 		 325 aa  236  6e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0188832 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0255  hypothetical protein  39.72 
 
 		 288 aa  229  4e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0724188  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1578  hypothetical protein  37.61 
 
 		 316 aa  213  2.9999999999999995e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000706252  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2205  hypothetical protein  52 
 
 		 160 aa  177  2e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1356  hypothetical protein  32.25 
 
 		 319 aa  172  9e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.895893  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2771  hypothetical protein  32.2 
 
 		 318 aa  157  3e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3037  protein of unknown function DUF1568  32.81 
 
 		 315 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0770  protein of unknown function DUF1568  31.25 
 
 		 316 aa  152  8e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.717082  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1785  hypothetical protein  32.62 
 
 		 264 aa  150  3e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0950  hypothetical protein  29.57 
 
 		 321 aa  150  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000190963  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3632  hypothetical protein  31.56 
 
 		 316 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.108416  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0167  hypothetical protein  66.34 
 
 		 101 aa  143  5e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1620  hypothetical protein  35.47 
 
 		 313 aa  143  5e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3016  hypothetical protein  37.02 
 
 		 312 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1032  protein of unknown function DUF1568  40.66 
 
 		 326 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1967  hypothetical protein  38.59 
 
 		 282 aa  133  3e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.969925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1748  hypothetical protein  38.12 
 
 		 312 aa  132  6e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.994794  normal  0.0128416 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3020  hypothetical protein  35.71 
 
 		 316 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0793  hypothetical protein  35.61 
 
 		 314 aa  129  9.000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1966  hypothetical protein  37.5 
 
 		 305 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.527692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3926  hypothetical protein  28.89 
 
 		 322 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2878  protein of unknown function DUF1568  30.82 
 
 		 289 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000473385 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2086  hypothetical protein  30.51 
 
 		 321 aa  125  1e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.464464  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1406  protein of unknown function DUF1568  30.21 
 
 		 289 aa  123  4e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2192  hypothetical protein  33.89 
 
 		 253 aa  123  4e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107555  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1813  protein of unknown function DUF1568  38.38 
 
 		 277 aa  123  5e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00112655  hitchhiker  0.00000000103135 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2198  transposase  33.89 
 
 		 253 aa  122  9e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4538  protein of unknown function DUF1568  37.28 
 
 		 251 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0855967  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0203  hypothetical protein  37.84 
 
 		 288 aa  120  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0207  hypothetical protein  37.84 
 
 		 288 aa  120  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0201  hypothetical protein  37.3 
 
 		 288 aa  119  6e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0922  protein of unknown function DUF1568  39.64 
 
 		 176 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2878  protein of unknown function DUF1568  29.5 
 
 		 287 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2264  transposase and inactivated derivatives  31.41 
 
 		 323 aa  112  8.000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.88974  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2265  transposase and inactivated derivatives  31.94 
 
 		 241 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2224  hypothetical protein  46.67 
 
 		 112 aa  110  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00479916  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0164  transposase  34.41 
 
 		 287 aa  109  6e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0743928  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2247  hypothetical protein  48.91 
 
 		 101 aa  108  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12790  transposase  38.52 
 
 		 241 aa  104  2e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1055  transposase  33.33 
 
 		 250 aa  104  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0324  protein of unknown function DUF1568  33.11 
 
 		 252 aa  102  1e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.551772  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0489  hypothetical protein  34.34 
 
 		 310 aa  101  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.448467 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0148  transposase  35.82 
 
 		 236 aa  99.8  6e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0526667  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0595  hypothetical protein  33.33 
 
 		 258 aa  99.4  7e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.217159  hitchhiker  2.03187e-17 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0136  transposase  35.07 
 
 		 236 aa  99.4  7e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0708  protein of unknown function DUF1568  32.77 
 
 		 233 aa  99.8  7e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.615013  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2050  protein of unknown function DUF1568  31.09 
 
 		 336 aa  98.6  1e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.633564  normal  0.705399 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0033  hypothetical protein  38.24 
 
 		 235 aa  98.2  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3871  protein of unknown function DUF1568  37.58 
 
 		 236 aa  97.4  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0740  hypothetical protein  30.56 
 
 		 255 aa  97.8  3e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.345588  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1151  protein of unknown function DUF1568  36.67 
 
 		 231 aa  97.1  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1552  protein of unknown function DUF1568  32.63 
 
 		 230 aa  96.7  5e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.268269 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1558  protein of unknown function DUF1568  32.68 
 
 		 230 aa  95.5  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.55731 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2394  hypothetical protein  40.94 
 
 		 239 aa  95.5  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.419691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1554  protein of unknown function DUF1568  32.11 
 
 		 230 aa  95.1  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.335003 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1556  protein of unknown function DUF1568  32.11 
 
 		 230 aa  95.1  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.444415 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01210  transposase  33.33 
 
 		 245 aa  94.4  3e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2474  protein of unknown function DUF1568  33.83 
 
 		 224 aa  93.2  6e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000403207  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0996  protein of unknown function DUF1568  31.12 
 
 		 216 aa  92.4  9e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.976226  normal  0.164778 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0397  protein of unknown function DUF1568  35.29 
 
 		 304 aa  92  1e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000164254  normal  0.853679 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2153  hypothetical protein  34.93 
 
 		 221 aa  91.3  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0207768  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1872  hypothetical protein  38.46 
 
 		 277 aa  91.3  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2793  transposase-like p;rotein  34.01 
 
 		 165 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0477  hypothetical protein  39.29 
 
 		 232 aa  90.1  5e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1007  hypothetical protein  35.76 
 
 		 234 aa  89.7  6e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.849512  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3248  protein of unknown function DUF1568  30.98 
 
 		 181 aa  88.6  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00178625  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>