More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1484 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_1484  hypothetical protein  100 
 
 		 231 aa  489  1e-137  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3122  transposase  68.44 
 
 		 231 aa  330  8e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.299801  normal  0.623865 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1802  protein of unknown function DUF1568  53.48 
 
 		 240 aa  266  2e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0477  hypothetical protein  47.84 
 
 		 232 aa  230  2e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4446  hypothetical protein  46.52 
 
 		 236 aa  227  1e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.885807  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3295  hypothetical protein  48.25 
 
 		 230 aa  221  4.9999999999999996e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3670  transposase and inactivated derivatives  50.24 
 
 		 228 aa  218  7e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2932  hypothetical protein  40.87 
 
 		 234 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.56667  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0682  hypothetical protein  40.26 
 
 		 232 aa  189  2.9999999999999997e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.349284  normal  0.584525 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1151  protein of unknown function DUF1568  40 
 
 		 231 aa  189  4e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1007  hypothetical protein  39.21 
 
 		 234 aa  186  3e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.849512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0996  protein of unknown function DUF1568  43.13 
 
 		 216 aa  183  2.0000000000000003e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.976226  normal  0.164778 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2394  hypothetical protein  38.86 
 
 		 239 aa  181  1e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.419691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0364  transposase-like protein  38.1 
 
 		 235 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.72516  normal  0.431982 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0790  hypothetical protein  38.67 
 
 		 232 aa  178  7e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.513436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0304  hypothetical protein  37.83 
 
 		 237 aa  176  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3592  protein of unknown function DUF1568  37.66 
 
 		 235 aa  177  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00165115  hitchhiker  0.000000708999 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2789  hypothetical protein  37.66 
 
 		 235 aa  176  4e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.603101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0320  hypothetical protein  37.39 
 
 		 237 aa  175  5e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.396962  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3498  hypothetical protein  37.39 
 
 		 237 aa  175  5e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.827202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0401  hypothetical protein  37.39 
 
 		 237 aa  175  5e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2706  hypothetical protein  37.39 
 
 		 237 aa  175  5e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0803898  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0329  hypothetical protein  37.39 
 
 		 237 aa  175  5e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0380  hypothetical protein  37.39 
 
 		 237 aa  175  5e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3244  protein of unknown function DUF1568  37 
 
 		 241 aa  174  9e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2897  protein of unknown function DUF1568  37.23 
 
 		 250 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0773075 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3015  hypothetical protein  36.8 
 
 		 237 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3749  hypothetical protein  36.96 
 
 		 237 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2737  hypothetical protein  36.96 
 
 		 237 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3719  transposase  36.96 
 
 		 237 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.719861  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2788  hypothetical protein  36.96 
 
 		 237 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3215  hypothetical protein  36.96 
 
 		 237 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3691  hypothetical protein  36.96 
 
 		 237 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1766  hypothetical protein  36.96 
 
 		 237 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0033  hypothetical protein  39.66 
 
 		 235 aa  171  5.999999999999999e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2966  hypothetical protein  37 
 
 		 241 aa  170  1e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0093  hypothetical protein  40 
 
 		 234 aa  163  2.0000000000000002e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150021  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3127  hypothetical protein  36.12 
 
 		 261 aa  163  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3264  hypothetical protein  35.93 
 
 		 247 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0926373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3871  protein of unknown function DUF1568  37.38 
 
 		 236 aa  160  2e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1556  protein of unknown function DUF1568  34.36 
 
 		 230 aa  155  4e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.444415 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1554  protein of unknown function DUF1568  34.36 
 
 		 230 aa  155  4e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.335003 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1552  protein of unknown function DUF1568  34.96 
 
 		 230 aa  155  4e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.268269 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0708  protein of unknown function DUF1568  37.38 
 
 		 233 aa  153  2.9999999999999998e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.615013  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3397  hypothetical protein  37.04 
 
 		 237 aa  150  1e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0740  hypothetical protein  37.25 
 
 		 255 aa  151  1e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.345588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2793  transposase-like p;rotein  46.26 
 
 		 165 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1558  protein of unknown function DUF1568  34.4 
 
 		 230 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.55731 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5559  hypothetical protein  31.17 
 
 		 236 aa  145  5e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.316618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3037  protein of unknown function DUF1568  41.18 
 
 		 315 aa  142  5e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0859  protein of unknown function DUF1568  34.15 
 
 		 238 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.682505  normal  0.123586 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1512  hypothetical protein  34.12 
 
 		 222 aa  133  3e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.656335 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3049  transposase and inactivated derivatives  31.72 
 
 		 226 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5382  hypothetical protein  33.33 
 
 		 223 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564815  normal  0.588654 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0770  protein of unknown function DUF1568  31.71 
 
 		 316 aa  129  6e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.717082  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2264  transposase and inactivated derivatives  34.59 
 
 		 323 aa  128  8.000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.88974  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1620  hypothetical protein  33.66 
 
 		 313 aa  125  7e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5648  hypothetical protein  33.33 
 
 		 226 aa  124  9e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.299518  normal  0.988864 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1708  hypothetical protein  28.1 
 
 		 461 aa  122  3e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1701  hypothetical protein  37.74 
 
 		 174 aa  122  6e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2396  hypothetical protein  31.84 
 
 		 220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2265  transposase and inactivated derivatives  34.59 
 
 		 241 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0917  protein of unknown function DUF1568  30.43 
 
 		 221 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3926  hypothetical protein  35.29 
 
 		 322 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3632  hypothetical protein  33.97 
 
 		 316 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.108416  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1356  hypothetical protein  33.52 
 
 		 319 aa  116  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.895893  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1967  hypothetical protein  32.84 
 
 		 226 aa  115  6e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00827335  normal  0.496503 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1813  protein of unknown function DUF1568  33.05 
 
 		 277 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00112655  hitchhiker  0.00000000103135 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0950  hypothetical protein  33.94 
 
 		 321 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000190963  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3104  hypothetical protein  31.1 
 
 		 233 aa  113  3e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.18817 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2878  protein of unknown function DUF1568  31.07 
 
 		 287 aa  111  8.000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1406  protein of unknown function DUF1568  30.58 
 
 		 289 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0207  hypothetical protein  31.14 
 
 		 288 aa  109  4.0000000000000004e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3016  hypothetical protein  33.33 
 
 		 312 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0793  hypothetical protein  39.1 
 
 		 314 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2878  protein of unknown function DUF1568  33.15 
 
 		 289 aa  108  5e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000473385 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3020  hypothetical protein  32.27 
 
 		 316 aa  108  6e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1724  hypothetical protein  37.32 
 
 		 248 aa  107  1e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1725  hypothetical protein  37.32 
 
 		 248 aa  107  2e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2474  protein of unknown function DUF1568  27.54 
 
 		 224 aa  107  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000403207  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2153  hypothetical protein  30.05 
 
 		 221 aa  106  3e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0207768  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0203  hypothetical protein  33.16 
 
 		 288 aa  106  3e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0267  transposase and inactivated derivatives  52.94 
 
 		 104 aa  106  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2131  hypothetical protein  34.86 
 
 		 333 aa  106  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.132605  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1748  hypothetical protein  38.19 
 
 		 312 aa  105  8e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.994794  normal  0.0128416 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0845  hypothetical protein  29.78 
 
 		 334 aa  105  8e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0201  hypothetical protein  32.64 
 
 		 288 aa  104  9e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2086  hypothetical protein  29.86 
 
 		 321 aa  102  6e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.464464  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1392  hypothetical protein  33.33 
 
 		 320 aa  101  8e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0148  transposase  37.9 
 
 		 236 aa  100  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0526667  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1032  protein of unknown function DUF1568  34.72 
 
 		 326 aa  100  3e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2336  protein of unknown function DUF1568  36.11 
 
 		 324 aa  99  5e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0722  protein of unknown function DUF1568  36.62 
 
 		 321 aa  98.6  6e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.645218  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2771  hypothetical protein  33.71 
 
 		 318 aa  98.2  8e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0136  transposase  37.1 
 
 		 236 aa  98.6  8e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2218  hypothetical protein  33.79 
 
 		 327 aa  97.1  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00293328  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1966  hypothetical protein  30.56 
 
 		 305 aa  97.1  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.527692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1967  hypothetical protein  30.56 
 
 		 282 aa  97.4  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.969925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4538  protein of unknown function DUF1568  33.8 
 
 		 251 aa  96.7  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0855967  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0595  hypothetical protein  34.75 
 
 		 258 aa  95.9  5e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.217159  hitchhiker  2.03187e-17 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>