191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1811 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_1811  protein of unknown function DUF1568  100 
 
 
138 aa  283  8e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00808567  hitchhiker  0.000000000975496 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1813  protein of unknown function DUF1568  100 
 
 
277 aa  228  3e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00112655  hitchhiker  0.00000000103135 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1812  protein of unknown function DUF1568  80.43 
 
 
111 aa  216  6e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.001052  hitchhiker  0.000000000744567 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0207  hypothetical protein  59.63 
 
 
288 aa  150  4e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0203  hypothetical protein  59.63 
 
 
288 aa  150  5e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0201  hypothetical protein  58.72 
 
 
288 aa  149  1e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2878  protein of unknown function DUF1568  59.63 
 
 
287 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1966  hypothetical protein  64.22 
 
 
305 aa  144  3e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.527692  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1967  hypothetical protein  64.22 
 
 
282 aa  144  3e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.969925  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1406  protein of unknown function DUF1568  57.8 
 
 
289 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0793  hypothetical protein  57.41 
 
 
314 aa  138  3e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3020  hypothetical protein  55.56 
 
 
316 aa  136  7.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2878  protein of unknown function DUF1568  55.05 
 
 
289 aa  136  7.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000473385 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3016  hypothetical protein  56.48 
 
 
312 aa  135  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1748  hypothetical protein  56.88 
 
 
312 aa  130  9e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.994794  normal  0.0128416 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3926  hypothetical protein  53.21 
 
 
322 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2264  transposase and inactivated derivatives  50.46 
 
 
323 aa  122  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.88974  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2265  transposase and inactivated derivatives  50.46 
 
 
241 aa  119  9e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1032  protein of unknown function DUF1568  52.78 
 
 
326 aa  118  3e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2050  protein of unknown function DUF1568  51.85 
 
 
336 aa  118  3e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.633564  normal  0.705399 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2086  hypothetical protein  51.85 
 
 
321 aa  110  5e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.464464  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0489  hypothetical protein  48.15 
 
 
310 aa  108  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.448467 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1356  hypothetical protein  47.22 
 
 
319 aa  101  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.895893  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0950  hypothetical protein  45.37 
 
 
321 aa  100  5e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000190963  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1724  hypothetical protein  44.23 
 
 
248 aa  98.2  3e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1725  hypothetical protein  44.23 
 
 
248 aa  98.2  3e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0324  protein of unknown function DUF1568  40.38 
 
 
252 aa  91.7  3e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.551772  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0770  protein of unknown function DUF1568  42.59 
 
 
316 aa  90.5  7e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.717082  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1319  protein of unknown function DUF1568  42.59 
 
 
319 aa  89.4  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0490388  hitchhiker  0.00690567 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3037  protein of unknown function DUF1568  41.67 
 
 
315 aa  87.4  5e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0722  protein of unknown function DUF1568  42.59 
 
 
321 aa  87.8  5e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.645218  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12790  transposase  43.75 
 
 
241 aa  87.4  6e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1929  protein of unknown function DUF1568  41.28 
 
 
321 aa  86.3  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2771  hypothetical protein  43.52 
 
 
318 aa  85.5  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1872  hypothetical protein  60.34 
 
 
277 aa  84.3  5e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1506  protein of unknown function DUF1568  38.89 
 
 
321 aa  83.6  9e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1423  protein of unknown function DUF1568  41.67 
 
 
180 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.7985800000000005e-18 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2204  hypothetical protein  39.81 
 
 
327 aa  83.2  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2205  hypothetical protein  39.45 
 
 
160 aa  82.8  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2233  hypothetical protein  39.81 
 
 
321 aa  83.2  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2237  hypothetical protein  39.81 
 
 
321 aa  83.2  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2246  hypothetical protein  39.81 
 
 
321 aa  83.2  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1620  hypothetical protein  39.81 
 
 
313 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1356  protein of unknown function DUF1568  39.81 
 
 
321 aa  82.4  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0875577  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0844  hypothetical protein  40.54 
 
 
340 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1425  hypothetical protein  40.74 
 
 
321 aa  81.6  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1427  hypothetical protein  40.74 
 
 
321 aa  81.6  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2131  hypothetical protein  41.67 
 
 
333 aa  81.6  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.132605  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2643  transposase domain-containing protein  38.89 
 
 
335 aa  80.9  0.000000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1392  hypothetical protein  39.81 
 
 
320 aa  80.9  0.000000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1151  protein of unknown function DUF1568  41.82 
 
 
231 aa  80.9  0.000000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0595  hypothetical protein  37.96 
 
 
258 aa  80.1  0.000000000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.217159  hitchhiker  2.03187e-17 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1084  transposase and inactivated derivatives  37.96 
 
 
338 aa  79.3  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2213  hypothetical protein  38.89 
 
 
321 aa  80.1  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.809495  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2207  protein of unknown function DUF1568  38.39 
 
 
323 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.45311e-16 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4538  protein of unknown function DUF1568  36.11 
 
 
251 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0855967  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3248  protein of unknown function DUF1568  34.82 
 
 
181 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00178625  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2336  protein of unknown function DUF1568  39.81 
 
 
324 aa  77.8  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3871  protein of unknown function DUF1568  41.82 
 
 
236 aa  76.6  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3632  hypothetical protein  39.81 
 
 
316 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.108416  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1782  protein of unknown function DUF1568  37.96 
 
 
325 aa  76.6  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0188832 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3049  transposase and inactivated derivatives  41.82 
 
 
226 aa  75.5  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0793  hypothetical protein  39.81 
 
 
335 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000261863  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3105  protein of unknown function DUF1568  34.26 
 
 
192 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000625853  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3078  protein of unknown function DUF1568  34.26 
 
 
190 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0164  transposase  40 
 
 
287 aa  75.5  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0743928  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0925  protein of unknown function DUF1568  37.96 
 
 
336 aa  75.1  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2333  protein of unknown function DUF1568  37.04 
 
 
324 aa  75.1  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1578  hypothetical protein  36.11 
 
 
316 aa  75.1  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000706252  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2153  hypothetical protein  35.14 
 
 
221 aa  75.1  0.0000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0207768  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2474  protein of unknown function DUF1568  34 
 
 
224 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000403207  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1423  protein of unknown function DUF1568  37.96 
 
 
325 aa  74.7  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.892865 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1104  methionine-R-sulfoxide reductase  36.11 
 
 
506 aa  73.9  0.0000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000471642  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2932  hypothetical protein  35.78 
 
 
234 aa  73.2  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.56667  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2224  hypothetical protein  39 
 
 
112 aa  72.8  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00479916  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0996  protein of unknown function DUF1568  39.09 
 
 
216 aa  71.6  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.976226  normal  0.164778 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2454  protein of unknown function DUF1568  37.04 
 
 
321 aa  71.6  0.000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000257297  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0397  protein of unknown function DUF1568  35.29 
 
 
304 aa  71.2  0.000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000164254  normal  0.853679 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0682  hypothetical protein  34.86 
 
 
232 aa  70.9  0.000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.349284  normal  0.584525 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1802  protein of unknown function DUF1568  37.61 
 
 
240 aa  69.7  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0845  hypothetical protein  37.04 
 
 
334 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1386  protein of unknown function DUF1568  37.04 
 
 
325 aa  68.9  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01210  transposase  32.41 
 
 
245 aa  68.6  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0167  hypothetical protein  37.62 
 
 
101 aa  68.2  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2192  hypothetical protein  33.33 
 
 
253 aa  68.6  0.00000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107555  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2198  transposase  33.33 
 
 
253 aa  68.6  0.00000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1256  protein of unknown function DUF1568  35.19 
 
 
321 aa  67.8  0.00000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0072967  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1484  hypothetical protein  34.26 
 
 
295 aa  68.2  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1487  hypothetical protein  34.26 
 
 
323 aa  68.2  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0033  hypothetical protein  41.28 
 
 
235 aa  66.6  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0136  transposase  34.44 
 
 
236 aa  66.2  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1007  hypothetical protein  34.86 
 
 
234 aa  66.6  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.849512  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2394  hypothetical protein  40.91 
 
 
239 aa  66.2  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.419691  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0790  hypothetical protein  33.94 
 
 
232 aa  65.9  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.513436  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1484  hypothetical protein  33.64 
 
 
231 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2218  hypothetical protein  34.26 
 
 
327 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00293328  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0093  hypothetical protein  34.55 
 
 
234 aa  64.7  0.0000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150021  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2885  hypothetical protein  35.71 
 
 
98 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0954  hypothetical protein  35.19 
 
 
326 aa  62.4  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.729066  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3719  transposase  34.86 
 
 
237 aa  62  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.719861  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>