More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3871 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_3871  protein of unknown function DUF1568  100 
 
 
236 aa  486  1e-136  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1802  protein of unknown function DUF1568  40.89 
 
 
240 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1151  protein of unknown function DUF1568  44.54 
 
 
231 aa  179  4.999999999999999e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4446  hypothetical protein  39.91 
 
 
236 aa  172  5e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.885807  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0996  protein of unknown function DUF1568  44 
 
 
216 aa  169  3e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.976226  normal  0.164778 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1007  hypothetical protein  42.29 
 
 
234 aa  169  4e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.849512  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0790  hypothetical protein  43.36 
 
 
232 aa  168  5e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.513436  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0682  hypothetical protein  42.22 
 
 
232 aa  168  8e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.349284  normal  0.584525 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3122  transposase  39.11 
 
 
231 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.299801  normal  0.623865 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1484  hypothetical protein  37.38 
 
 
231 aa  160  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0708  protein of unknown function DUF1568  40 
 
 
233 aa  160  2e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.615013  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3049  transposase and inactivated derivatives  37.77 
 
 
226 aa  158  5e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2932  hypothetical protein  45.81 
 
 
234 aa  157  1e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.56667  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0093  hypothetical protein  38.33 
 
 
234 aa  157  1e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150021  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0740  hypothetical protein  39.46 
 
 
255 aa  157  2e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.345588  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2394  hypothetical protein  41.23 
 
 
239 aa  156  3e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.419691  normal 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0033  hypothetical protein  39.24 
 
 
235 aa  155  4e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0477  hypothetical protein  35.81 
 
 
232 aa  154  1e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3749  hypothetical protein  36.56 
 
 
237 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1766  hypothetical protein  36.56 
 
 
237 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2737  hypothetical protein  36.56 
 
 
237 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3719  transposase  36.56 
 
 
237 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.719861  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3015  hypothetical protein  36.56 
 
 
237 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3691  hypothetical protein  36.56 
 
 
237 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2788  hypothetical protein  36.56 
 
 
237 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3215  hypothetical protein  36.56 
 
 
237 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3592  protein of unknown function DUF1568  35.68 
 
 
235 aa  152  4e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00165115  hitchhiker  0.000000708999 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0364  transposase-like protein  35.68 
 
 
235 aa  152  5e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.72516  normal  0.431982 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0304  hypothetical protein  36.56 
 
 
237 aa  151  7e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1512  hypothetical protein  41.78 
 
 
222 aa  150  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.656335 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3670  transposase and inactivated derivatives  36 
 
 
228 aa  150  2e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3498  hypothetical protein  36.12 
 
 
237 aa  149  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.827202  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0380  hypothetical protein  36.12 
 
 
237 aa  149  4e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0401  hypothetical protein  36.12 
 
 
237 aa  149  4e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2706  hypothetical protein  36.12 
 
 
237 aa  149  4e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0803898  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0329  hypothetical protein  35.68 
 
 
237 aa  148  9e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3295  hypothetical protein  35.68 
 
 
230 aa  148  9e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0320  hypothetical protein  35.68 
 
 
237 aa  148  9e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.396962  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2789  hypothetical protein  34.21 
 
 
235 aa  143  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.603101  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3244  protein of unknown function DUF1568  35.11 
 
 
241 aa  142  5e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2897  protein of unknown function DUF1568  34.47 
 
 
250 aa  139  3e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0773075 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2966  hypothetical protein  35.56 
 
 
241 aa  139  3e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3397  hypothetical protein  38.67 
 
 
237 aa  139  3e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5559  hypothetical protein  35.56 
 
 
236 aa  138  7.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.316618  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1552  protein of unknown function DUF1568  35.84 
 
 
230 aa  137  1e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.268269 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2396  hypothetical protein  36.24 
 
 
220 aa  137  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3264  hypothetical protein  34.19 
 
 
247 aa  134  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0926373  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1554  protein of unknown function DUF1568  35.37 
 
 
230 aa  134  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.335003 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1556  protein of unknown function DUF1568  35.37 
 
 
230 aa  134  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.444415 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1558  protein of unknown function DUF1568  34.88 
 
 
230 aa  125  6e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.55731 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1708  hypothetical protein  28.89 
 
 
461 aa  124  1e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1967  hypothetical protein  33.33 
 
 
282 aa  123  2e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.969925  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2776  hypothetical protein  33.04 
 
 
235 aa  123  3e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.721483  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12790  transposase  49.22 
 
 
241 aa  121  7e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0203  hypothetical protein  40.56 
 
 
288 aa  121  9e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3127  hypothetical protein  32.62 
 
 
261 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0201  hypothetical protein  40 
 
 
288 aa  120  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5382  hypothetical protein  35.27 
 
 
223 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564815  normal  0.588654 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2153  hypothetical protein  32.46 
 
 
221 aa  119  3e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0207768  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1966  hypothetical protein  31.62 
 
 
305 aa  119  3e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.527692  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3020  hypothetical protein  35.94 
 
 
316 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2793  transposase-like p;rotein  44.37 
 
 
165 aa  118  6e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0207  hypothetical protein  45.77 
 
 
288 aa  119  6e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3016  hypothetical protein  35.85 
 
 
312 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0859  protein of unknown function DUF1568  32.63 
 
 
238 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.682505  normal  0.123586 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0917  protein of unknown function DUF1568  31.25 
 
 
221 aa  117  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3104  hypothetical protein  33.48 
 
 
233 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.18817 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1620  hypothetical protein  32.24 
 
 
313 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1967  hypothetical protein  33.99 
 
 
226 aa  117  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00827335  normal  0.496503 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1748  hypothetical protein  32.24 
 
 
312 aa  116  3e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.994794  normal  0.0128416 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2474  protein of unknown function DUF1568  32.89 
 
 
224 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000403207  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2878  protein of unknown function DUF1568  31.14 
 
 
289 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000473385 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1356  hypothetical protein  34.83 
 
 
319 aa  115  7.999999999999999e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.895893  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0950  hypothetical protein  40.91 
 
 
321 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000190963  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2264  transposase and inactivated derivatives  33.49 
 
 
323 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.88974  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2198  transposase  34.04 
 
 
253 aa  114  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2192  hypothetical protein  39.86 
 
 
253 aa  113  3e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107555  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0845  hypothetical protein  36.61 
 
 
334 aa  111  8.000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0793  hypothetical protein  41.18 
 
 
314 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2265  transposase and inactivated derivatives  33.49 
 
 
241 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1701  hypothetical protein  36.71 
 
 
174 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1406  protein of unknown function DUF1568  30.26 
 
 
289 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3037  protein of unknown function DUF1568  33.03 
 
 
315 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1813  protein of unknown function DUF1568  37.99 
 
 
277 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00112655  hitchhiker  0.00000000103135 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0954  hypothetical protein  43.36 
 
 
326 aa  108  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.729066  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2336  protein of unknown function DUF1568  41.26 
 
 
324 aa  107  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5648  hypothetical protein  31.68 
 
 
226 aa  106  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.299518  normal  0.988864 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1425  hypothetical protein  40.56 
 
 
321 aa  106  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1427  hypothetical protein  40.56 
 
 
321 aa  106  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1724  hypothetical protein  34.15 
 
 
248 aa  104  9e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1725  hypothetical protein  34.15 
 
 
248 aa  104  1e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0595  hypothetical protein  36.36 
 
 
258 aa  104  1e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.217159  hitchhiker  2.03187e-17 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1386  protein of unknown function DUF1568  37.76 
 
 
325 aa  104  1e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0148  transposase  41.46 
 
 
236 aa  104  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0526667  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4538  protein of unknown function DUF1568  33.52 
 
 
251 aa  103  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0855967  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1392  hypothetical protein  34.97 
 
 
320 aa  103  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2086  hypothetical protein  38.73 
 
 
321 aa  103  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.464464  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2233  hypothetical protein  39.86 
 
 
321 aa  103  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2878  protein of unknown function DUF1568  30.99 
 
 
287 aa  103  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2246  hypothetical protein  39.86 
 
 
321 aa  103  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>