154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3104 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3104  hypothetical protein  100 
 
 		 233 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.18817 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3397  hypothetical protein  49.12 
 
 		 237 aa  197  1.0000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1007  hypothetical protein  43.91 
 
 		 234 aa  181  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.849512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0682  hypothetical protein  41.67 
 
 		 232 aa  174  9e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.349284  normal  0.584525 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3264  hypothetical protein  41.92 
 
 		 247 aa  174  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0926373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3127  hypothetical protein  40.17 
 
 		 261 aa  169  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5559  hypothetical protein  41.48 
 
 		 236 aa  169  3e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.316618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0790  hypothetical protein  40.17 
 
 		 232 aa  168  8e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.513436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0708  protein of unknown function DUF1568  39.91 
 
 		 233 aa  167  1e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.615013  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3244  protein of unknown function DUF1568  40.43 
 
 		 241 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2897  protein of unknown function DUF1568  40.43 
 
 		 250 aa  165  5e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0773075 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2966  hypothetical protein  40.17 
 
 		 241 aa  165  6.9999999999999995e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0740  hypothetical protein  39.39 
 
 		 255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.345588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2932  hypothetical protein  38.98 
 
 		 234 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.56667  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1151  protein of unknown function DUF1568  41.3 
 
 		 231 aa  164  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2737  hypothetical protein  40.61 
 
 		 237 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3719  transposase  40.61 
 
 		 237 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.719861  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3015  hypothetical protein  40.61 
 
 		 237 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3215  hypothetical protein  40.61 
 
 		 237 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1766  hypothetical protein  40.61 
 
 		 237 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3691  hypothetical protein  40.61 
 
 		 237 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3749  hypothetical protein  40.61 
 
 		 237 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2788  hypothetical protein  40.61 
 
 		 237 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2394  hypothetical protein  41.78 
 
 		 239 aa  162  6e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.419691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2789  hypothetical protein  39.32 
 
 		 235 aa  161  9e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.603101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0364  transposase-like protein  39.48 
 
 		 235 aa  161  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.72516  normal  0.431982 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0304  hypothetical protein  40.17 
 
 		 237 aa  160  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3498  hypothetical protein  39.74 
 
 		 237 aa  159  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.827202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2706  hypothetical protein  39.74 
 
 		 237 aa  159  3e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0803898  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0329  hypothetical protein  39.74 
 
 		 237 aa  159  3e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0320  hypothetical protein  39.74 
 
 		 237 aa  159  3e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.396962  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0401  hypothetical protein  39.74 
 
 		 237 aa  159  3e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0380  hypothetical protein  39.74 
 
 		 237 aa  159  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3592  protein of unknown function DUF1568  39.06 
 
 		 235 aa  159  4e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00165115  hitchhiker  0.000000708999 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0093  hypothetical protein  34.04 
 
 		 234 aa  132  3e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150021  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4446  hypothetical protein  30.49 
 
 		 236 aa  122  3e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.885807  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1708  hypothetical protein  28.12 
 
 		 461 aa  116  1.9999999999999998e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3871  protein of unknown function DUF1568  33.48 
 
 		 236 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1802  protein of unknown function DUF1568  31.74 
 
 		 240 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0859  protein of unknown function DUF1568  32.62 
 
 		 238 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.682505  normal  0.123586 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1484  hypothetical protein  31.1 
 
 		 231 aa  113  3e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3122  transposase  30.13 
 
 		 231 aa  112  5e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.299801  normal  0.623865 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1552  protein of unknown function DUF1568  27.95 
 
 		 230 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.268269 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5648  hypothetical protein  32.99 
 
 		 226 aa  108  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.299518  normal  0.988864 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3670  transposase and inactivated derivatives  26.39 
 
 		 228 aa  108  6e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0477  hypothetical protein  27.9 
 
 		 232 aa  102  4e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3295  hypothetical protein  28.07 
 
 		 230 aa  102  4e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1554  protein of unknown function DUF1568  26.64 
 
 		 230 aa  101  1e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.335003 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1556  protein of unknown function DUF1568  26.64 
 
 		 230 aa  101  1e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.444415 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1558  protein of unknown function DUF1568  27.27 
 
 		 230 aa  99  6e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.55731 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0996  protein of unknown function DUF1568  30.66 
 
 		 216 aa  91.3  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.976226  normal  0.164778 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0033  hypothetical protein  31.17 
 
 		 235 aa  90.5  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2776  hypothetical protein  30.34 
 
 		 235 aa  85.1  8e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.721483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3049  transposase and inactivated derivatives  25 
 
 		 226 aa  82  0.000000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2396  hypothetical protein  30.3 
 
 		 220 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2793  transposase-like p;rotein  30.89 
 
 		 165 aa  78.6  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0917  protein of unknown function DUF1568  29 
 
 		 221 aa  78.6  0.00000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1701  hypothetical protein  32.79 
 
 		 174 aa  77  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1512  hypothetical protein  31.14 
 
 		 222 aa  77.4  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.656335 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2454  protein of unknown function DUF1568  26.23 
 
 		 321 aa  70.1  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000257297  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3037  protein of unknown function DUF1568  26.36 
 
 		 315 aa  69.3  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1966  hypothetical protein  27.36 
 
 		 305 aa  69.3  0.00000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.527692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1967  hypothetical protein  27.7 
 
 		 282 aa  68.6  0.00000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.969925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1423  protein of unknown function DUF1568  32.23 
 
 		 325 aa  67.4  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.892865 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1578  hypothetical protein  29.75 
 
 		 316 aa  65.5  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000706252  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0770  protein of unknown function DUF1568  29.27 
 
 		 316 aa  65.1  0.0000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.717082  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5382  hypothetical protein  28.57 
 
 		 223 aa  65.1  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564815  normal  0.588654 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2207  protein of unknown function DUF1568  29.51 
 
 		 323 aa  64.7  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.45311e-16 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0950  hypothetical protein  30.08 
 
 		 321 aa  65.1  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000190963  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1484  hypothetical protein  31.4 
 
 		 295 aa  63.9  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1487  hypothetical protein  31.4 
 
 		 323 aa  63.9  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0324  protein of unknown function DUF1568  27.87 
 
 		 252 aa  63.5  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.551772  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1256  protein of unknown function DUF1568  29.75 
 
 		 321 aa  63.5  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0072967  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2878  protein of unknown function DUF1568  31.4 
 
 		 289 aa  62.8  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000473385 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0925  protein of unknown function DUF1568  32.52 
 
 		 336 aa  62.8  0.000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0722  protein of unknown function DUF1568  28.93 
 
 		 321 aa  62.8  0.000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.645218  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1356  protein of unknown function DUF1568  28.1 
 
 		 321 aa  63.2  0.000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0875577  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1386  protein of unknown function DUF1568  28.1 
 
 		 325 aa  62.8  0.000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2474  protein of unknown function DUF1568  20.7 
 
 		 224 aa  62.4  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000403207  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2204  hypothetical protein  28.1 
 
 		 327 aa  62.4  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2237  hypothetical protein  28.1 
 
 		 321 aa  62.4  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2205  hypothetical protein  28.1 
 
 		 160 aa  62  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2233  hypothetical protein  28.1 
 
 		 321 aa  62  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2246  hypothetical protein  28.1 
 
 		 321 aa  62  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1032  protein of unknown function DUF1568  25.83 
 
 		 326 aa  61.6  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1506  protein of unknown function DUF1568  27.27 
 
 		 321 aa  61.6  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12790  transposase  28.12 
 
 		 241 aa  61.6  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1541  hypothetical protein  26.23 
 
 		 267 aa  60.8  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.463797  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2333  protein of unknown function DUF1568  27.05 
 
 		 324 aa  60.8  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2213  hypothetical protein  27.27 
 
 		 321 aa  60.8  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.809495  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1724  hypothetical protein  21.83 
 
 		 248 aa  60.1  0.00000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1425  hypothetical protein  30.08 
 
 		 321 aa  60.1  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1427  hypothetical protein  30.08 
 
 		 321 aa  59.7  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1319  protein of unknown function DUF1568  29.51 
 
 		 319 aa  60.1  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0490388  hitchhiker  0.00690567 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1620  hypothetical protein  24.32 
 
 		 313 aa  60.1  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1929  protein of unknown function DUF1568  23.14 
 
 		 321 aa  60.1  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0595  hypothetical protein  21.74 
 
 		 258 aa  60.1  0.00000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.217159  hitchhiker  2.03187e-17 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1104  methionine-R-sulfoxide reductase  28.1 
 
 		 506 aa  59.3  0.00000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000471642  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1725  hypothetical protein  21.32 
 
 		 248 aa  58.9  0.00000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1356  hypothetical protein  28.67 
 
 		 319 aa  58.5  0.00000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.895893  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>