192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3592 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A0364  transposase-like protein  99.57 
 
 
235 aa  481  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.72516  normal  0.431982 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3592  protein of unknown function DUF1568  100 
 
 
235 aa  482  1e-135  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00165115  hitchhiker  0.000000708999 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2789  hypothetical protein  94.04 
 
 
235 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.603101  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2737  hypothetical protein  87.34 
 
 
237 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3719  transposase  87.34 
 
 
237 aa  432  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.719861  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3498  hypothetical protein  87.76 
 
 
237 aa  432  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.827202  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3015  hypothetical protein  88.31 
 
 
237 aa  431  1e-120  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2706  hypothetical protein  87.76 
 
 
237 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0803898  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0329  hypothetical protein  87.34 
 
 
237 aa  431  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0380  hypothetical protein  87.76 
 
 
237 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0320  hypothetical protein  87.34 
 
 
237 aa  431  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.396962  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0401  hypothetical protein  87.76 
 
 
237 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0304  hypothetical protein  87.76 
 
 
237 aa  432  1e-120  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3215  hypothetical protein  87.34 
 
 
237 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1766  hypothetical protein  87.34 
 
 
237 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3691  hypothetical protein  87.34 
 
 
237 aa  432  1e-120  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3749  hypothetical protein  87.34 
 
 
237 aa  432  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2788  hypothetical protein  87.34 
 
 
237 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0859  protein of unknown function DUF1568  62.5 
 
 
238 aa  285  2.9999999999999996e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.682505  normal  0.123586 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5648  hypothetical protein  60 
 
 
226 aa  250  1e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.299518  normal  0.988864 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3244  protein of unknown function DUF1568  48.44 
 
 
241 aa  219  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3264  hypothetical protein  46.38 
 
 
247 aa  218  8.999999999999998e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0926373  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2897  protein of unknown function DUF1568  48 
 
 
250 aa  218  8.999999999999998e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0773075 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2966  hypothetical protein  48 
 
 
241 aa  217  1e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2932  hypothetical protein  44.87 
 
 
234 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.56667  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1007  hypothetical protein  48.02 
 
 
234 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.849512  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0708  protein of unknown function DUF1568  46.93 
 
 
233 aa  210  2e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.615013  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3127  hypothetical protein  46.26 
 
 
261 aa  209  3e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0682  hypothetical protein  43.72 
 
 
232 aa  207  8e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.349284  normal  0.584525 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1151  protein of unknown function DUF1568  45.78 
 
 
231 aa  206  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0740  hypothetical protein  46.46 
 
 
255 aa  206  3e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.345588  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0790  hypothetical protein  45.33 
 
 
232 aa  206  4e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.513436  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2394  hypothetical protein  45.02 
 
 
239 aa  197  7.999999999999999e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.419691  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4446  hypothetical protein  42.54 
 
 
236 aa  197  1.0000000000000001e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.885807  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5559  hypothetical protein  45.33 
 
 
236 aa  195  4.0000000000000005e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.316618  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3397  hypothetical protein  44 
 
 
237 aa  186  2e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0093  hypothetical protein  40.43 
 
 
234 aa  182  6e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150021  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1802  protein of unknown function DUF1568  40.44 
 
 
240 aa  180  2e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3122  transposase  39.56 
 
 
231 aa  180  2e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.299801  normal  0.623865 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1484  hypothetical protein  37.66 
 
 
231 aa  177  2e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0477  hypothetical protein  40.53 
 
 
232 aa  174  8e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3670  transposase and inactivated derivatives  35.56 
 
 
228 aa  167  1e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3295  hypothetical protein  37.44 
 
 
230 aa  166  2e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3104  hypothetical protein  39.06 
 
 
233 aa  159  4e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.18817 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0033  hypothetical protein  40.52 
 
 
235 aa  156  3e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3871  protein of unknown function DUF1568  35.68 
 
 
236 aa  152  4e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0996  protein of unknown function DUF1568  39.62 
 
 
216 aa  149  3e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.976226  normal  0.164778 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1708  hypothetical protein  33.78 
 
 
461 aa  145  4.0000000000000006e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1552  protein of unknown function DUF1568  34.78 
 
 
230 aa  143  3e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.268269 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1554  protein of unknown function DUF1568  34.78 
 
 
230 aa  141  8e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.335003 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1556  protein of unknown function DUF1568  34.78 
 
 
230 aa  141  8e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.444415 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1558  protein of unknown function DUF1568  35.92 
 
 
230 aa  134  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.55731 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3049  transposase and inactivated derivatives  32.6 
 
 
226 aa  128  9.000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1512  hypothetical protein  37.33 
 
 
222 aa  122  4e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.656335 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3020  hypothetical protein  37.1 
 
 
316 aa  122  4e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0917  protein of unknown function DUF1568  33.77 
 
 
221 aa  115  5e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1701  hypothetical protein  37.74 
 
 
174 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3016  hypothetical protein  33.49 
 
 
312 aa  112  5e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3037  protein of unknown function DUF1568  34.93 
 
 
315 aa  112  5e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1748  hypothetical protein  33.98 
 
 
312 aa  111  8.000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.994794  normal  0.0128416 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1725  hypothetical protein  34.25 
 
 
248 aa  108  8.000000000000001e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2396  hypothetical protein  33.33 
 
 
220 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1724  hypothetical protein  34.25 
 
 
248 aa  108  1e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1032  protein of unknown function DUF1568  32.56 
 
 
326 aa  107  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5382  hypothetical protein  33.04 
 
 
223 aa  107  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564815  normal  0.588654 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2878  protein of unknown function DUF1568  31.49 
 
 
289 aa  106  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000473385 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2474  protein of unknown function DUF1568  29 
 
 
224 aa  102  4e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000403207  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0793  hypothetical protein  30.43 
 
 
314 aa  101  8e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2265  transposase and inactivated derivatives  30.24 
 
 
241 aa  100  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2264  transposase and inactivated derivatives  29.76 
 
 
323 aa  100  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.88974  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0950  hypothetical protein  35.37 
 
 
321 aa  100  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000190963  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2793  transposase-like p;rotein  35.66 
 
 
165 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3926  hypothetical protein  30.69 
 
 
322 aa  100  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1406  protein of unknown function DUF1568  30.21 
 
 
289 aa  99.8  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2878  protein of unknown function DUF1568  30.77 
 
 
287 aa  99.4  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2776  hypothetical protein  31.72 
 
 
235 aa  99.4  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.721483  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2153  hypothetical protein  28.97 
 
 
221 aa  99  5e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0207768  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0136  transposase  36.64 
 
 
236 aa  98.6  7e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0595  hypothetical protein  33.86 
 
 
258 aa  96.7  3e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.217159  hitchhiker  2.03187e-17 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1620  hypothetical protein  28.02 
 
 
313 aa  96.7  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0148  transposase  35.88 
 
 
236 aa  96.3  4e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0526667  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0397  protein of unknown function DUF1568  31.96 
 
 
304 aa  95.9  5e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000164254  normal  0.853679 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2198  transposase  31.28 
 
 
253 aa  95.5  7e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2192  hypothetical protein  31.28 
 
 
253 aa  93.6  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107555  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3632  hypothetical protein  30.09 
 
 
316 aa  93.2  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.108416  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12790  transposase  32.72 
 
 
241 aa  92.8  4e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0770  protein of unknown function DUF1568  26.76 
 
 
316 aa  92.4  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.717082  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1813  protein of unknown function DUF1568  38.03 
 
 
277 aa  92  6e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00112655  hitchhiker  0.00000000103135 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4538  protein of unknown function DUF1568  31.9 
 
 
251 aa  91.7  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0855967  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3105  protein of unknown function DUF1568  33.8 
 
 
192 aa  90.1  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000625853  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1967  hypothetical protein  35 
 
 
226 aa  90.1  3e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00827335  normal  0.496503 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3078  protein of unknown function DUF1568  33.8 
 
 
190 aa  90.1  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1386  protein of unknown function DUF1568  35.17 
 
 
325 aa  89.7  3e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1356  hypothetical protein  31.29 
 
 
319 aa  89.4  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.895893  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2086  hypothetical protein  32.47 
 
 
321 aa  88.6  7e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.464464  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0493  transposase  33.51 
 
 
222 aa  88.6  7e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0487  transposase  32.98 
 
 
222 aa  89  7e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1055  transposase  28.92 
 
 
250 aa  88.6  8e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3248  protein of unknown function DUF1568  30.11 
 
 
181 aa  88.2  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00178625  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1782  protein of unknown function DUF1568  29.61 
 
 
325 aa  87.4  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0188832 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>