218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0397 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_0397  protein of unknown function DUF1568  100 
 
 
304 aa  627  1e-179  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000164254  normal  0.853679 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1356  hypothetical protein  35.91 
 
 
319 aa  129  8.000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.895893  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2932  hypothetical protein  38.42 
 
 
234 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.56667  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3020  hypothetical protein  30.88 
 
 
316 aa  125  8.000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1620  hypothetical protein  43.17 
 
 
313 aa  123  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1748  hypothetical protein  39.05 
 
 
312 aa  123  4e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.994794  normal  0.0128416 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2394  hypothetical protein  35.65 
 
 
239 aa  123  4e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.419691  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2265  transposase and inactivated derivatives  31.93 
 
 
241 aa  121  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2264  transposase and inactivated derivatives  31.93 
 
 
323 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.88974  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3926  hypothetical protein  35.64 
 
 
322 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1967  hypothetical protein  35.8 
 
 
282 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.969925  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0996  protein of unknown function DUF1568  37.85 
 
 
216 aa  119  4.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.976226  normal  0.164778 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0793  hypothetical protein  38.46 
 
 
314 aa  119  7e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3016  hypothetical protein  37.87 
 
 
312 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0682  hypothetical protein  37.23 
 
 
232 aa  118  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.349284  normal  0.584525 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1966  hypothetical protein  35.8 
 
 
305 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.527692  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2771  hypothetical protein  37.14 
 
 
318 aa  116  5e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0950  hypothetical protein  38.3 
 
 
321 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000190963  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1813  protein of unknown function DUF1568  29.18 
 
 
277 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00112655  hitchhiker  0.00000000103135 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1151  protein of unknown function DUF1568  34.46 
 
 
231 aa  113  4.0000000000000004e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3037  protein of unknown function DUF1568  36.97 
 
 
315 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0790  hypothetical protein  35.68 
 
 
232 aa  110  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.513436  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3049  transposase and inactivated derivatives  36.36 
 
 
226 aa  109  6e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3632  hypothetical protein  34.59 
 
 
316 aa  108  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.108416  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2474  protein of unknown function DUF1568  41.22 
 
 
224 aa  108  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000403207  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0477  hypothetical protein  39.08 
 
 
232 aa  108  1e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2878  protein of unknown function DUF1568  28.01 
 
 
287 aa  108  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0595  hypothetical protein  37.04 
 
 
258 aa  108  2e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.217159  hitchhiker  2.03187e-17 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1406  protein of unknown function DUF1568  27.62 
 
 
289 aa  107  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0093  hypothetical protein  36.42 
 
 
234 aa  108  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150021  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0203  hypothetical protein  34.09 
 
 
288 aa  107  3e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2878  protein of unknown function DUF1568  27.27 
 
 
289 aa  107  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000473385 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0207  hypothetical protein  34.09 
 
 
288 aa  106  4e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0136  transposase  38.89 
 
 
236 aa  106  4e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2086  hypothetical protein  38.85 
 
 
321 aa  106  5e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.464464  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12790  transposase  39.39 
 
 
241 aa  106  6e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3295  hypothetical protein  34.04 
 
 
230 aa  105  7e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1552  protein of unknown function DUF1568  35.96 
 
 
230 aa  105  8e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.268269 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0201  hypothetical protein  33.52 
 
 
288 aa  105  9e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0740  hypothetical protein  33.33 
 
 
255 aa  105  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.345588  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0148  transposase  38.1 
 
 
236 aa  104  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0526667  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0708  protein of unknown function DUF1568  34.41 
 
 
233 aa  104  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.615013  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1558  protein of unknown function DUF1568  37.64 
 
 
230 aa  104  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.55731 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2396  hypothetical protein  36.05 
 
 
220 aa  103  4e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1032  protein of unknown function DUF1568  27.82 
 
 
326 aa  103  4e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3670  transposase and inactivated derivatives  33.33 
 
 
228 aa  102  5e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1319  protein of unknown function DUF1568  32.02 
 
 
319 aa  101  1e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0490388  hitchhiker  0.00690567 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0033  hypothetical protein  38.97 
 
 
235 aa  102  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4446  hypothetical protein  36.09 
 
 
236 aa  100  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.885807  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1802  protein of unknown function DUF1568  38.41 
 
 
240 aa  101  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1512  hypothetical protein  34.87 
 
 
222 aa  100  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.656335 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1356  protein of unknown function DUF1568  32.02 
 
 
321 aa  100  3e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0875577  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2336  protein of unknown function DUF1568  26.03 
 
 
324 aa  100  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1386  protein of unknown function DUF1568  32.21 
 
 
325 aa  100  4e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1256  protein of unknown function DUF1568  34.23 
 
 
321 aa  99.8  5e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0072967  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1423  protein of unknown function DUF1568  36.84 
 
 
325 aa  99.4  7e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.892865 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1725  hypothetical protein  36.51 
 
 
248 aa  99  8e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0917  protein of unknown function DUF1568  30.27 
 
 
221 aa  99.4  8e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5382  hypothetical protein  30.88 
 
 
223 aa  99  8e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564815  normal  0.588654 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1007  hypothetical protein  32.2 
 
 
234 aa  99  8e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.849512  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2153  hypothetical protein  38.64 
 
 
221 aa  99  9e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0207768  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1724  hypothetical protein  36.51 
 
 
248 aa  98.6  1e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2218  hypothetical protein  35.29 
 
 
327 aa  98.6  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00293328  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2050  protein of unknown function DUF1568  31.11 
 
 
336 aa  97.8  2e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.633564  normal  0.705399 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1556  protein of unknown function DUF1568  34.27 
 
 
230 aa  97.8  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.444415 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1554  protein of unknown function DUF1568  34.27 
 
 
230 aa  97.8  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.335003 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1484  hypothetical protein  33.33 
 
 
295 aa  97.4  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1701  hypothetical protein  33.33 
 
 
174 aa  97.1  3e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2789  hypothetical protein  31.96 
 
 
235 aa  96.7  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.603101  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0770  protein of unknown function DUF1568  31.58 
 
 
316 aa  96.3  5e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.717082  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1929  protein of unknown function DUF1568  30.9 
 
 
321 aa  96.7  5e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4538  protein of unknown function DUF1568  37.04 
 
 
251 aa  96.3  6e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0855967  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2233  hypothetical protein  30.9 
 
 
321 aa  96.3  6e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2246  hypothetical protein  30.9 
 
 
321 aa  96.3  6e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0845  hypothetical protein  35.17 
 
 
334 aa  95.9  7e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2237  hypothetical protein  30.9 
 
 
321 aa  95.9  7e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2204  hypothetical protein  30.9 
 
 
327 aa  95.9  8e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3592  protein of unknown function DUF1568  31.96 
 
 
235 aa  95.9  8e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00165115  hitchhiker  0.000000708999 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1484  hypothetical protein  29.5 
 
 
231 aa  95.9  8e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2776  hypothetical protein  32.6 
 
 
235 aa  95.5  9e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.721483  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1425  hypothetical protein  30.9 
 
 
321 aa  95.5  9e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1427  hypothetical protein  30.9 
 
 
321 aa  95.5  9e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1791  transposase and inactivated derivatives  30 
 
 
323 aa  95.1  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0364  transposase-like protein  31.96 
 
 
235 aa  95.5  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.72516  normal  0.431982 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1392  hypothetical protein  32.65 
 
 
320 aa  95.1  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1506  protein of unknown function DUF1568  30.9 
 
 
321 aa  95.5  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0324  protein of unknown function DUF1568  31.97 
 
 
252 aa  94.4  2e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.551772  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2737  hypothetical protein  37.96 
 
 
237 aa  94  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2793  transposase-like p;rotein  37.23 
 
 
165 aa  94  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3719  transposase  37.96 
 
 
237 aa  94  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.719861  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3015  hypothetical protein  37.96 
 
 
237 aa  94  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0489  hypothetical protein  36.36 
 
 
310 aa  94  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.448467 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0722  protein of unknown function DUF1568  29.78 
 
 
321 aa  94  3e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.645218  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2131  hypothetical protein  34.31 
 
 
333 aa  94  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.132605  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3215  hypothetical protein  37.96 
 
 
237 aa  94  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3871  protein of unknown function DUF1568  36.81 
 
 
236 aa  94  3e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1766  hypothetical protein  37.96 
 
 
237 aa  94  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3691  hypothetical protein  37.96 
 
 
237 aa  94  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3749  hypothetical protein  37.96 
 
 
237 aa  94  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2788  hypothetical protein  37.96 
 
 
237 aa  94  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>