245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3020 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3020  hypothetical protein  100 
 
 		 316 aa  656    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3016  hypothetical protein  63.02 
 
 		 312 aa  424  1e-118  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0793  hypothetical protein  63.49 
 
 		 314 aa  423  1e-117  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1748  hypothetical protein  54.66 
 
 		 312 aa  340  2e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.994794  normal  0.0128416 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2264  transposase and inactivated derivatives  44.44 
 
 		 323 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.88974  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3926  hypothetical protein  44 
 
 		 322 aa  259  5.0000000000000005e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2265  transposase and inactivated derivatives  51.67 
 
 		 241 aa  248  1e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2086  hypothetical protein  40.73 
 
 		 321 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.464464  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1813  protein of unknown function DUF1568  42.16 
 
 		 277 aa  224  2e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00112655  hitchhiker  0.00000000103135 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1032  protein of unknown function DUF1568  37.46 
 
 		 326 aa  217  2e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2878  protein of unknown function DUF1568  41.75 
 
 		 289 aa  216  4e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000473385 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2878  protein of unknown function DUF1568  39.65 
 
 		 287 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0203  hypothetical protein  40.58 
 
 		 288 aa  214  1.9999999999999998e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0207  hypothetical protein  41.81 
 
 		 288 aa  214  1.9999999999999998e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1406  protein of unknown function DUF1568  40.7 
 
 		 289 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0201  hypothetical protein  39.94 
 
 		 288 aa  210  2e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1967  hypothetical protein  47.85 
 
 		 282 aa  203  3e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.969925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0950  hypothetical protein  36.33 
 
 		 321 aa  202  7e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000190963  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1966  hypothetical protein  47.37 
 
 		 305 aa  200  3e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.527692  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2771  hypothetical protein  34.77 
 
 		 318 aa  196  3e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3037  protein of unknown function DUF1568  41.47 
 
 		 315 aa  194  1e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1620  hypothetical protein  40.24 
 
 		 313 aa  186  3e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1356  hypothetical protein  31.76 
 
 		 319 aa  179  5.999999999999999e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.895893  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3632  hypothetical protein  32.41 
 
 		 316 aa  171  1e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.108416  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0770  protein of unknown function DUF1568  39.13 
 
 		 316 aa  169  7e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.717082  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1872  hypothetical protein  34.7 
 
 		 277 aa  160  3e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0164  transposase  36.54 
 
 		 287 aa  159  4e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0743928  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2218  hypothetical protein  29.85 
 
 		 327 aa  149  4e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00293328  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2050  protein of unknown function DUF1568  39.36 
 
 		 336 aa  144  2e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.633564  normal  0.705399 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0845  hypothetical protein  30.94 
 
 		 334 aa  143  4e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0489  hypothetical protein  38.91 
 
 		 310 aa  142  6e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.448467 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0925  protein of unknown function DUF1568  31.17 
 
 		 336 aa  141  9.999999999999999e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2207  protein of unknown function DUF1568  39.36 
 
 		 323 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.45311e-16 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1791  transposase and inactivated derivatives  33.44 
 
 		 323 aa  141  9.999999999999999e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2233  hypothetical protein  29.6 
 
 		 321 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2246  hypothetical protein  29.6 
 
 		 321 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1104  methionine-R-sulfoxide reductase  32 
 
 		 506 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000471642  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0844  hypothetical protein  29.81 
 
 		 340 aa  140  3e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1392  hypothetical protein  36.65 
 
 		 320 aa  140  3e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2237  hypothetical protein  30.53 
 
 		 321 aa  140  3e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2204  hypothetical protein  38.59 
 
 		 327 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2131  hypothetical protein  39.67 
 
 		 333 aa  139  4.999999999999999e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.132605  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0790  hypothetical protein  34.82 
 
 		 232 aa  139  8.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.513436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1319  protein of unknown function DUF1568  29.19 
 
 		 319 aa  139  8.999999999999999e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0490388  hitchhiker  0.00690567 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2213  hypothetical protein  29.6 
 
 		 321 aa  137  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.809495  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1811  protein of unknown function DUF1568  55.56 
 
 		 138 aa  136  4e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00808567  hitchhiker  0.000000000975496 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1356  protein of unknown function DUF1568  29.54 
 
 		 321 aa  136  4e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0875577  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0722  protein of unknown function DUF1568  32.34 
 
 		 321 aa  136  6.0000000000000005e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.645218  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3248  protein of unknown function DUF1568  38.55 
 
 		 181 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00178625  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0033  hypothetical protein  46.85 
 
 		 235 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1423  protein of unknown function DUF1568  29.55 
 
 		 325 aa  134  9.999999999999999e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.892865 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1423  protein of unknown function DUF1568  38.82 
 
 		 180 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.7985800000000005e-18 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1256  protein of unknown function DUF1568  30.28 
 
 		 321 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0072967  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2643  transposase domain-containing protein  29.71 
 
 		 335 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1506  protein of unknown function DUF1568  28.48 
 
 		 321 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3078  protein of unknown function DUF1568  38.22 
 
 		 190 aa  133  3e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3105  protein of unknown function DUF1568  38.22 
 
 		 192 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000625853  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1425  hypothetical protein  29.28 
 
 		 321 aa  132  5e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1427  hypothetical protein  28.97 
 
 		 321 aa  132  5e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0954  hypothetical protein  30.62 
 
 		 326 aa  132  9e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.729066  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1084  transposase and inactivated derivatives  35.71 
 
 		 338 aa  130  3e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0996  protein of unknown function DUF1568  36.57 
 
 		 216 aa  130  3e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.976226  normal  0.164778 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1782  protein of unknown function DUF1568  28.83 
 
 		 325 aa  129  5.0000000000000004e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0188832 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2932  hypothetical protein  35.65 
 
 		 234 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.56667  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1484  hypothetical protein  28.77 
 
 		 295 aa  129  8.000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0682  hypothetical protein  33.76 
 
 		 232 aa  129  9.000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.349284  normal  0.584525 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2192  hypothetical protein  40.96 
 
 		 253 aa  127  2.0000000000000002e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107555  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2198  transposase  40.96 
 
 		 253 aa  127  2.0000000000000002e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1151  protein of unknown function DUF1568  41.89 
 
 		 231 aa  127  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2333  protein of unknown function DUF1568  28.44 
 
 		 324 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1802  protein of unknown function DUF1568  37.08 
 
 		 240 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1929  protein of unknown function DUF1568  33.7 
 
 		 321 aa  126  5e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2454  protein of unknown function DUF1568  33.05 
 
 		 321 aa  126  5e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000257297  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0148  transposase  37.56 
 
 		 236 aa  126  6e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0526667  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1487  hypothetical protein  28.62 
 
 		 323 aa  126  6e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1578  hypothetical protein  34.06 
 
 		 316 aa  125  8.000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000706252  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0397  protein of unknown function DUF1568  30.88 
 
 		 304 aa  125  9e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000164254  normal  0.853679 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12790  transposase  38.56 
 
 		 241 aa  124  3e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1724  hypothetical protein  42.55 
 
 		 248 aa  123  4e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1725  hypothetical protein  42.55 
 
 		 248 aa  123  4e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1386  protein of unknown function DUF1568  35.16 
 
 		 325 aa  123  4e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3592  protein of unknown function DUF1568  37.1 
 
 		 235 aa  122  6e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00165115  hitchhiker  0.000000708999 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4538  protein of unknown function DUF1568  38.79 
 
 		 251 aa  122  9e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0855967  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0364  transposase-like protein  36.65 
 
 		 235 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.72516  normal  0.431982 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3498  hypothetical protein  35.29 
 
 		 237 aa  120  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.827202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2706  hypothetical protein  35.29 
 
 		 237 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0803898  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0380  hypothetical protein  35.29 
 
 		 237 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0401  hypothetical protein  35.29 
 
 		 237 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2205  hypothetical protein  42.36 
 
 		 160 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0093  hypothetical protein  35.52 
 
 		 234 aa  119  4.9999999999999996e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150021  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3871  protein of unknown function DUF1568  35.94 
 
 		 236 aa  119  6e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2336  protein of unknown function DUF1568  27.19 
 
 		 324 aa  119  7e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0329  hypothetical protein  34.84 
 
 		 237 aa  119  7e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0320  hypothetical protein  34.84 
 
 		 237 aa  119  7e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.396962  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3049  transposase and inactivated derivatives  34.27 
 
 		 226 aa  118  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0304  hypothetical protein  34.84 
 
 		 237 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2394  hypothetical protein  34.72 
 
 		 239 aa  117  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.419691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1007  hypothetical protein  37.14 
 
 		 234 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.849512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0136  transposase  34.85 
 
 		 236 aa  117  3e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0477  hypothetical protein  33.8 
 
 		 232 aa  116  5e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>