230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0136 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0136  transposase  100 
 
 		 236 aa  492  9.999999999999999e-139  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0148  transposase  90.68 
 
 		 236 aa  453  1.0000000000000001e-126  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0526667  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2198  transposase  48.94 
 
 		 253 aa  227  1e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2192  hypothetical protein  48.94 
 
 		 253 aa  226  3e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107555  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4538  protein of unknown function DUF1568  41.13 
 
 		 251 aa  194  1e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0855967  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12790  transposase  44.59 
 
 		 241 aa  190  1e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0595  hypothetical protein  40.17 
 
 		 258 aa  184  9e-46  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.217159  hitchhiker  2.03187e-17 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1055  transposase  41.18 
 
 		 250 aa  177  2e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01210  transposase  34.47 
 
 		 245 aa  152  2.9999999999999998e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1356  hypothetical protein  37.5 
 
 		 319 aa  126  3e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.895893  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0950  hypothetical protein  37.25 
 
 		 321 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000190963  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0793  hypothetical protein  40.25 
 
 		 314 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3016  hypothetical protein  39.62 
 
 		 312 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2793  transposase-like p;rotein  41.13 
 
 		 165 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2771  hypothetical protein  38.12 
 
 		 318 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3020  hypothetical protein  34.85 
 
 		 316 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1392  hypothetical protein  38.04 
 
 		 320 aa  116  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3037  protein of unknown function DUF1568  39.55 
 
 		 315 aa  116  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1620  hypothetical protein  39.69 
 
 		 313 aa  115  6e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0845  hypothetical protein  36.81 
 
 		 334 aa  115  6e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1506  protein of unknown function DUF1568  38.46 
 
 		 321 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1151  protein of unknown function DUF1568  40.31 
 
 		 231 aa  113  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1423  protein of unknown function DUF1568  35.5 
 
 		 325 aa  113  3e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.892865 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2086  hypothetical protein  40 
 
 		 321 aa  112  3e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.464464  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0682  hypothetical protein  42.64 
 
 		 232 aa  112  7.000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.349284  normal  0.584525 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0925  protein of unknown function DUF1568  35.12 
 
 		 336 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2932  hypothetical protein  43.41 
 
 		 234 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.56667  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1484  hypothetical protein  32.84 
 
 		 295 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1554  protein of unknown function DUF1568  41.98 
 
 		 230 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.335003 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1386  protein of unknown function DUF1568  41.41 
 
 		 325 aa  110  2.0000000000000002e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2207  protein of unknown function DUF1568  35.86 
 
 		 323 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.45311e-16 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1556  protein of unknown function DUF1568  41.98 
 
 		 230 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.444415 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2213  hypothetical protein  35.15 
 
 		 321 aa  109  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.809495  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2218  hypothetical protein  40.6 
 
 		 327 aa  109  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00293328  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0203  hypothetical protein  30.74 
 
 		 288 aa  109  4.0000000000000004e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0207  hypothetical protein  30.3 
 
 		 288 aa  109  4.0000000000000004e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1748  hypothetical protein  36.48 
 
 		 312 aa  109  4.0000000000000004e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.994794  normal  0.0128416 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0201  hypothetical protein  30.3 
 
 		 288 aa  109  5e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1967  hypothetical protein  33.96 
 
 		 282 aa  108  5e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.969925  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2878  protein of unknown function DUF1568  33.96 
 
 		 289 aa  109  5e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000473385 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2131  hypothetical protein  36.09 
 
 		 333 aa  109  5e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.132605  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2333  protein of unknown function DUF1568  38.65 
 
 		 324 aa  109  5e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2336  protein of unknown function DUF1568  36.81 
 
 		 324 aa  108  6e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2233  hypothetical protein  35.15 
 
 		 321 aa  108  6e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2246  hypothetical protein  35.15 
 
 		 321 aa  108  6e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1487  hypothetical protein  33.33 
 
 		 323 aa  108  7.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2204  hypothetical protein  35.15 
 
 		 327 aa  108  7.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2237  hypothetical protein  35.15 
 
 		 321 aa  108  7.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1356  protein of unknown function DUF1568  35.58 
 
 		 321 aa  108  7.000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0875577  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0770  protein of unknown function DUF1568  33.75 
 
 		 316 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.717082  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1782  protein of unknown function DUF1568  39.53 
 
 		 325 aa  107  1e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0188832 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1966  hypothetical protein  33.96 
 
 		 305 aa  108  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.527692  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0954  hypothetical protein  38.81 
 
 		 326 aa  107  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.729066  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3926  hypothetical protein  35.93 
 
 		 322 aa  107  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1256  protein of unknown function DUF1568  35.33 
 
 		 321 aa  107  2e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0072967  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0477  hypothetical protein  42.74 
 
 		 232 aa  107  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1032  protein of unknown function DUF1568  39.69 
 
 		 326 aa  107  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0722  protein of unknown function DUF1568  34.97 
 
 		 321 aa  107  2e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.645218  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1558  protein of unknown function DUF1568  40.46 
 
 		 230 aa  107  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.55731 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0397  protein of unknown function DUF1568  38.89 
 
 		 304 aa  106  3e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000164254  normal  0.853679 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2205  hypothetical protein  40.62 
 
 		 160 aa  106  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1406  protein of unknown function DUF1568  33.33 
 
 		 289 aa  106  4e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1319  protein of unknown function DUF1568  34.36 
 
 		 319 aa  105  4e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0490388  hitchhiker  0.00690567 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1552  protein of unknown function DUF1568  40.46 
 
 		 230 aa  105  6e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.268269 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1427  hypothetical protein  32.4 
 
 		 321 aa  105  7e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1425  hypothetical protein  32.4 
 
 		 321 aa  105  8e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2394  hypothetical protein  38.17 
 
 		 239 aa  104  9e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.419691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0790  hypothetical protein  38.76 
 
 		 232 aa  104  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.513436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1929  protein of unknown function DUF1568  36.36 
 
 		 321 aa  104  1e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4446  hypothetical protein  41.41 
 
 		 236 aa  103  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.885807  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2264  transposase and inactivated derivatives  40.65 
 
 		 323 aa  103  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.88974  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3871  protein of unknown function DUF1568  42.28 
 
 		 236 aa  102  6e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2878  protein of unknown function DUF1568  32.7 
 
 		 287 aa  102  7e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1104  methionine-R-sulfoxide reductase  28.85 
 
 		 506 aa  101  9e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000471642  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2265  transposase and inactivated derivatives  34.18 
 
 		 241 aa  100  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0033  hypothetical protein  38.71 
 
 		 235 aa  100  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1084  transposase and inactivated derivatives  35.07 
 
 		 338 aa  99.4  4e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3248  protein of unknown function DUF1568  33.12 
 
 		 181 aa  99.8  4e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00178625  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1813  protein of unknown function DUF1568  28.82 
 
 		 277 aa  99.4  5e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00112655  hitchhiker  0.00000000103135 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0364  transposase-like protein  36.64 
 
 		 235 aa  98.6  7e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.72516  normal  0.431982 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3592  protein of unknown function DUF1568  36.64 
 
 		 235 aa  98.6  7e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00165115  hitchhiker  0.000000708999 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1484  hypothetical protein  37.1 
 
 		 231 aa  98.6  8e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3078  protein of unknown function DUF1568  33.12 
 
 		 190 aa  97.8  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3632  hypothetical protein  32.5 
 
 		 316 aa  98.2  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.108416  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2153  hypothetical protein  38.3 
 
 		 221 aa  97.8  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0207768  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1872  hypothetical protein  36.3 
 
 		 277 aa  97.4  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1791  transposase and inactivated derivatives  34.97 
 
 		 323 aa  97.1  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2643  transposase domain-containing protein  34.59 
 
 		 335 aa  97.4  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3105  protein of unknown function DUF1568  33.12 
 
 		 192 aa  97.1  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000625853  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0164  transposase  34.5 
 
 		 287 aa  97.4  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0743928  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1007  hypothetical protein  36.43 
 
 		 234 aa  97.1  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.849512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0844  hypothetical protein  34.76 
 
 		 340 aa  96.7  3e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1724  hypothetical protein  35.71 
 
 		 248 aa  95.5  7e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1725  hypothetical protein  35.71 
 
 		 248 aa  95.5  7e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2789  hypothetical protein  36.64 
 
 		 235 aa  95.1  7e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.603101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2474  protein of unknown function DUF1568  36.36 
 
 		 224 aa  95.5  7e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000403207  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1578  hypothetical protein  33.74 
 
 		 316 aa  95.1  8e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000706252  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2050  protein of unknown function DUF1568  34.23 
 
 		 336 aa  95.1  8e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.633564  normal  0.705399 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2737  hypothetical protein  36.64 
 
 		 237 aa  94.4  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3498  hypothetical protein  36.64 
 
 		 237 aa  94.7  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.827202  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>