More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_2153 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_2153  hypothetical protein  100 
 
 
221 aa  461  1e-129  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0207768  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2474  protein of unknown function DUF1568  57.08 
 
 
224 aa  277  1e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000403207  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1151  protein of unknown function DUF1568  42.86 
 
 
231 aa  122  6e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2932  hypothetical protein  32.74 
 
 
234 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.56667  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3871  protein of unknown function DUF1568  32.46 
 
 
236 aa  119  3e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0093  hypothetical protein  32.02 
 
 
234 aa  118  7e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150021  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3016  hypothetical protein  39.33 
 
 
312 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2776  hypothetical protein  33.77 
 
 
235 aa  116  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.721483  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0793  hypothetical protein  31.6 
 
 
314 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3020  hypothetical protein  39.46 
 
 
316 aa  114  8.999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0682  hypothetical protein  31.86 
 
 
232 aa  113  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.349284  normal  0.584525 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1512  hypothetical protein  35.09 
 
 
222 aa  114  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.656335 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1552  protein of unknown function DUF1568  31.42 
 
 
230 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.268269 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1620  hypothetical protein  43.45 
 
 
313 aa  111  7.000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1556  protein of unknown function DUF1568  30.7 
 
 
230 aa  111  7.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.444415 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1554  protein of unknown function DUF1568  30.7 
 
 
230 aa  111  7.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.335003 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0790  hypothetical protein  30.43 
 
 
232 aa  111  7.000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.513436  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4446  hypothetical protein  31.31 
 
 
236 aa  111  8.000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.885807  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0595  hypothetical protein  27.75 
 
 
258 aa  111  8.000000000000001e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.217159  hitchhiker  2.03187e-17 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2793  transposase-like p;rotein  39.86 
 
 
165 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3049  transposase and inactivated derivatives  30.67 
 
 
226 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0708  protein of unknown function DUF1568  31.42 
 
 
233 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.615013  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2394  hypothetical protein  31.34 
 
 
239 aa  110  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.419691  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0207  hypothetical protein  32.98 
 
 
288 aa  110  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1406  protein of unknown function DUF1568  37.5 
 
 
289 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0740  hypothetical protein  31.48 
 
 
255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.345588  normal 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0033  hypothetical protein  33.48 
 
 
235 aa  109  3e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2207  protein of unknown function DUF1568  32.39 
 
 
323 aa  109  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.45311e-16 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1356  hypothetical protein  38.46 
 
 
319 aa  109  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.895893  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2396  hypothetical protein  34.4 
 
 
220 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0324  protein of unknown function DUF1568  34.39 
 
 
252 aa  108  8.000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.551772  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2264  transposase and inactivated derivatives  32.26 
 
 
323 aa  108  8.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.88974  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0203  hypothetical protein  37.06 
 
 
288 aa  108  9.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2878  protein of unknown function DUF1568  36.81 
 
 
289 aa  107  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000473385 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4538  protein of unknown function DUF1568  35.5 
 
 
251 aa  107  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0855967  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0201  hypothetical protein  37.06 
 
 
288 aa  107  1e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2192  hypothetical protein  37.09 
 
 
253 aa  107  1e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107555  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2966  hypothetical protein  33.02 
 
 
241 aa  107  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0996  protein of unknown function DUF1568  33.85 
 
 
216 aa  106  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.976226  normal  0.164778 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1967  hypothetical protein  33.83 
 
 
226 aa  107  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00827335  normal  0.496503 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1484  hypothetical protein  30.05 
 
 
231 aa  106  3e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0917  protein of unknown function DUF1568  33.04 
 
 
221 aa  106  3e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1007  hypothetical protein  29.82 
 
 
234 aa  106  3e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.849512  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3926  hypothetical protein  38.89 
 
 
322 aa  106  4e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2265  transposase and inactivated derivatives  36.91 
 
 
241 aa  105  5e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3244  protein of unknown function DUF1568  32.55 
 
 
241 aa  105  5e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2897  protein of unknown function DUF1568  32.55 
 
 
250 aa  105  5e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0773075 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1802  protein of unknown function DUF1568  29.2 
 
 
240 aa  105  6e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2198  transposase  37.16 
 
 
253 aa  105  6e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1724  hypothetical protein  30.57 
 
 
248 aa  105  8e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1725  hypothetical protein  30.57 
 
 
248 aa  105  8e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1813  protein of unknown function DUF1568  37.5 
 
 
277 aa  104  9e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00112655  hitchhiker  0.00000000103135 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1558  protein of unknown function DUF1568  30.7 
 
 
230 aa  104  9e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.55731 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1701  hypothetical protein  37.84 
 
 
174 aa  103  3e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3295  hypothetical protein  27.63 
 
 
230 aa  102  3e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0489  hypothetical protein  31.78 
 
 
310 aa  102  3e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.448467 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2878  protein of unknown function DUF1568  35.42 
 
 
287 aa  102  4e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1032  protein of unknown function DUF1568  31.94 
 
 
326 aa  101  7e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1748  hypothetical protein  36.11 
 
 
312 aa  101  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.994794  normal  0.0128416 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01210  transposase  30.64 
 
 
245 aa  100  2e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3592  protein of unknown function DUF1568  28.97 
 
 
235 aa  99  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00165115  hitchhiker  0.000000708999 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2771  hypothetical protein  38.06 
 
 
318 aa  99  5e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3122  transposase  33.54 
 
 
231 aa  99  5e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.299801  normal  0.623865 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0397  protein of unknown function DUF1568  38.64 
 
 
304 aa  99  5e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000164254  normal  0.853679 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0364  transposase-like protein  28.97 
 
 
235 aa  99  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.72516  normal  0.431982 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3127  hypothetical protein  30.28 
 
 
261 aa  98.6  6e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3264  hypothetical protein  31.14 
 
 
247 aa  98.6  7e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0926373  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0148  transposase  38.69 
 
 
236 aa  98.6  7e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0526667  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3670  transposase and inactivated derivatives  26.75 
 
 
228 aa  98.2  8e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1967  hypothetical protein  32.87 
 
 
282 aa  98.2  9e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.969925  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0136  transposase  38.3 
 
 
236 aa  97.8  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1423  protein of unknown function DUF1568  36.3 
 
 
325 aa  97.1  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.892865 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3037  protein of unknown function DUF1568  38.81 
 
 
315 aa  96.7  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0477  hypothetical protein  34.9 
 
 
232 aa  96.3  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0845  hypothetical protein  35.33 
 
 
334 aa  95.9  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1966  hypothetical protein  32.17 
 
 
305 aa  95.5  5e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.527692  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3749  hypothetical protein  28.5 
 
 
237 aa  95.1  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3215  hypothetical protein  28.5 
 
 
237 aa  95.1  7e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2737  hypothetical protein  28.5 
 
 
237 aa  95.1  7e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3719  transposase  28.5 
 
 
237 aa  95.1  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.719861  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3015  hypothetical protein  28.5 
 
 
237 aa  95.1  7e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3691  hypothetical protein  28.5 
 
 
237 aa  95.1  7e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1766  hypothetical protein  28.5 
 
 
237 aa  95.1  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0950  hypothetical protein  36.11 
 
 
321 aa  95.1  7e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000190963  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2788  hypothetical protein  28.5 
 
 
237 aa  95.1  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12790  transposase  32.86 
 
 
241 aa  95.1  8e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5382  hypothetical protein  34.9 
 
 
223 aa  94.7  9e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564815  normal  0.588654 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2789  hypothetical protein  28.04 
 
 
235 aa  94.7  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.603101  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0770  protein of unknown function DUF1568  38.46 
 
 
316 aa  93.6  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.717082  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2643  transposase domain-containing protein  37.5 
 
 
335 aa  94  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0164  transposase  34.72 
 
 
287 aa  93.6  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0743928  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1055  transposase  27.96 
 
 
250 aa  93.6  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2086  hypothetical protein  32.65 
 
 
321 aa  93.2  3e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.464464  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0304  hypothetical protein  28.04 
 
 
237 aa  92.8  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3498  hypothetical protein  28.04 
 
 
237 aa  92.4  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.827202  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0380  hypothetical protein  28.04 
 
 
237 aa  92.4  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2218  hypothetical protein  35.62 
 
 
327 aa  92.8  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00293328  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1872  hypothetical protein  42.11 
 
 
277 aa  92.4  4e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2706  hypothetical protein  28.04 
 
 
237 aa  92.4  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0803898  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0401  hypothetical protein  28.04 
 
 
237 aa  92.4  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>