183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_2789 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_2789  hypothetical protein  100 
 
 		 235 aa  483  1e-135  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.603101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0364  transposase-like protein  94.47 
 
 		 235 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.72516  normal  0.431982 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3592  protein of unknown function DUF1568  94.04 
 
 		 235 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00165115  hitchhiker  0.000000708999 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3498  hypothetical protein  87.71 
 
 		 237 aa  431  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.827202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2706  hypothetical protein  87.71 
 
 		 237 aa  431  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0803898  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0401  hypothetical protein  87.71 
 
 		 237 aa  431  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0304  hypothetical protein  88.14 
 
 		 237 aa  432  1e-120  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0380  hypothetical protein  87.71 
 
 		 237 aa  431  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2737  hypothetical protein  86.86 
 
 		 237 aa  428  1e-119  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3719  transposase  86.86 
 
 		 237 aa  428  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.719861  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3015  hypothetical protein  86.86 
 
 		 237 aa  428  1e-119  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0320  hypothetical protein  87.29 
 
 		 237 aa  430  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.396962  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3215  hypothetical protein  86.86 
 
 		 237 aa  428  1e-119  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0329  hypothetical protein  87.29 
 
 		 237 aa  430  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1766  hypothetical protein  86.86 
 
 		 237 aa  428  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3691  hypothetical protein  86.86 
 
 		 237 aa  428  1e-119  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3749  hypothetical protein  86.86 
 
 		 237 aa  428  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2788  hypothetical protein  86.86 
 
 		 237 aa  428  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0859  protein of unknown function DUF1568  62.07 
 
 		 238 aa  284  7e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.682505  normal  0.123586 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5648  hypothetical protein  59.52 
 
 		 226 aa  248  7e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.299518  normal  0.988864 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3264  hypothetical protein  47.62 
 
 		 247 aa  217  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0926373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3244  protein of unknown function DUF1568  46.67 
 
 		 241 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2897  protein of unknown function DUF1568  46.22 
 
 		 250 aa  212  4.9999999999999996e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0773075 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2966  hypothetical protein  46.22 
 
 		 241 aa  211  7e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1007  hypothetical protein  47.58 
 
 		 234 aa  209  2e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.849512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3127  hypothetical protein  45.37 
 
 		 261 aa  207  9e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0708  protein of unknown function DUF1568  46.49 
 
 		 233 aa  206  2e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.615013  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2932  hypothetical protein  43.16 
 
 		 234 aa  203  2e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.56667  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0740  hypothetical protein  46.02 
 
 		 255 aa  203  2e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.345588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0682  hypothetical protein  42.42 
 
 		 232 aa  201  7e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.349284  normal  0.584525 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0790  hypothetical protein  44 
 
 		 232 aa  198  6e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.513436  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1151  protein of unknown function DUF1568  44.44 
 
 		 231 aa  198  7e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4446  hypothetical protein  40.25 
 
 		 236 aa  196  3e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.885807  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2394  hypothetical protein  44.59 
 
 		 239 aa  195  4.0000000000000005e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.419691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5559  hypothetical protein  44.44 
 
 		 236 aa  190  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.316618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3397  hypothetical protein  44.44 
 
 		 237 aa  189  4e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0093  hypothetical protein  40.87 
 
 		 234 aa  182  5.0000000000000004e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150021  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1802  protein of unknown function DUF1568  40 
 
 		 240 aa  177  9e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1484  hypothetical protein  37.66 
 
 		 231 aa  176  4e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0477  hypothetical protein  40.09 
 
 		 232 aa  175  7e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3122  transposase  38.67 
 
 		 231 aa  174  8e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.299801  normal  0.623865 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3670  transposase and inactivated derivatives  36.15 
 
 		 228 aa  170  2e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3295  hypothetical protein  36.12 
 
 		 230 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3104  hypothetical protein  39.32 
 
 		 233 aa  161  9e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.18817 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0033  hypothetical protein  40.35 
 
 		 235 aa  155  6e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1708  hypothetical protein  33.33 
 
 		 461 aa  144  1e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0996  protein of unknown function DUF1568  37.74 
 
 		 216 aa  144  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.976226  normal  0.164778 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3871  protein of unknown function DUF1568  34.21 
 
 		 236 aa  143  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1552  protein of unknown function DUF1568  34.35 
 
 		 230 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.268269 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1556  protein of unknown function DUF1568  34.35 
 
 		 230 aa  137  1e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.444415 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1554  protein of unknown function DUF1568  34.35 
 
 		 230 aa  137  1e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.335003 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1558  protein of unknown function DUF1568  35.44 
 
 		 230 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.55731 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3049  transposase and inactivated derivatives  31.28 
 
 		 226 aa  123  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1512  hypothetical protein  36 
 
 		 222 aa  117  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.656335 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3020  hypothetical protein  35 
 
 		 316 aa  116  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1748  hypothetical protein  34.47 
 
 		 312 aa  110  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.994794  normal  0.0128416 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1701  hypothetical protein  37.01 
 
 		 174 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3016  hypothetical protein  33.49 
 
 		 312 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3037  protein of unknown function DUF1568  33.49 
 
 		 315 aa  108  6e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5382  hypothetical protein  33.93 
 
 		 223 aa  108  7.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564815  normal  0.588654 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0917  protein of unknown function DUF1568  32.47 
 
 		 221 aa  108  9.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2878  protein of unknown function DUF1568  30.64 
 
 		 289 aa  107  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000473385 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2396  hypothetical protein  31.56 
 
 		 220 aa  105  6e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1725  hypothetical protein  32.88 
 
 		 248 aa  105  8e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1724  hypothetical protein  32.88 
 
 		 248 aa  104  9e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2793  transposase-like p;rotein  37.06 
 
 		 165 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1032  protein of unknown function DUF1568  37.41 
 
 		 326 aa  103  3e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2264  transposase and inactivated derivatives  30.24 
 
 		 323 aa  102  5e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.88974  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0950  hypothetical protein  35.37 
 
 		 321 aa  102  5e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000190963  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2265  transposase and inactivated derivatives  30.73 
 
 		 241 aa  102  6e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2878  protein of unknown function DUF1568  32.26 
 
 		 287 aa  101  9e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1406  protein of unknown function DUF1568  30.08 
 
 		 289 aa  99.8  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1620  hypothetical protein  29.47 
 
 		 313 aa  99  6e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3632  hypothetical protein  31.02 
 
 		 316 aa  98.6  7e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.108416  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0793  hypothetical protein  29.61 
 
 		 314 aa  98.6  7e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2776  hypothetical protein  31.72 
 
 		 235 aa  98.2  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.721483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3926  hypothetical protein  30.2 
 
 		 322 aa  97.8  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0397  protein of unknown function DUF1568  31.96 
 
 		 304 aa  96.7  3e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000164254  normal  0.853679 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2474  protein of unknown function DUF1568  25.88 
 
 		 224 aa  95.9  5e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000403207  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0136  transposase  36.64 
 
 		 236 aa  95.1  7e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0770  protein of unknown function DUF1568  27.23 
 
 		 316 aa  94.7  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.717082  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2153  hypothetical protein  28.04 
 
 		 221 aa  94.7  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0207768  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1813  protein of unknown function DUF1568  32.21 
 
 		 277 aa  92.8  4e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00112655  hitchhiker  0.00000000103135 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0148  transposase  34.35 
 
 		 236 aa  91.7  8e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0526667  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0595  hypothetical protein  33.07 
 
 		 258 aa  90.5  2e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.217159  hitchhiker  2.03187e-17 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2198  transposase  30.17 
 
 		 253 aa  90.1  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3078  protein of unknown function DUF1568  33.1 
 
 		 190 aa  89.4  4e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3105  protein of unknown function DUF1568  33.1 
 
 		 192 aa  89.4  4e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000625853  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12790  transposase  32.1 
 
 		 241 aa  89.4  4e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1967  hypothetical protein  30.05 
 
 		 226 aa  89  6e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00827335  normal  0.496503 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2192  hypothetical protein  30.17 
 
 		 253 aa  88.6  8e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107555  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1782  protein of unknown function DUF1568  29.61 
 
 		 325 aa  88.2  9e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0188832 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1356  hypothetical protein  30.61 
 
 		 319 aa  87.8  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.895893  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4538  protein of unknown function DUF1568  31.29 
 
 		 251 aa  87.8  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0855967  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3248  protein of unknown function DUF1568  29.57 
 
 		 181 aa  87.4  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00178625  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1386  protein of unknown function DUF1568  33.1 
 
 		 325 aa  85.1  8e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1055  transposase  31.29 
 
 		 250 aa  85.1  8e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2131  hypothetical protein  30.88 
 
 		 333 aa  85.1  9e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.132605  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2086  hypothetical protein  30.93 
 
 		 321 aa  82.4  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.464464  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0493  transposase  31.91 
 
 		 222 aa  82  0.000000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>