169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0859 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0859  protein of unknown function DUF1568  100 
 
 		 238 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.682505  normal  0.123586 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5648  hypothetical protein  87.08 
 
 		 226 aa  384  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.299518  normal  0.988864 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0304  hypothetical protein  64.78 
 
 		 237 aa  289  2e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3015  hypothetical protein  64.22 
 
 		 237 aa  288  4e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2737  hypothetical protein  64.78 
 
 		 237 aa  288  5.0000000000000004e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3719  transposase  64.78 
 
 		 237 aa  288  5.0000000000000004e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.719861  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3215  hypothetical protein  64.78 
 
 		 237 aa  288  5.0000000000000004e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1766  hypothetical protein  64.78 
 
 		 237 aa  288  5.0000000000000004e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3691  hypothetical protein  64.78 
 
 		 237 aa  288  5.0000000000000004e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3749  hypothetical protein  64.78 
 
 		 237 aa  288  5.0000000000000004e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2788  hypothetical protein  64.78 
 
 		 237 aa  288  5.0000000000000004e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3498  hypothetical protein  63.36 
 
 		 237 aa  286  2e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.827202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2706  hypothetical protein  63.36 
 
 		 237 aa  286  2e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0803898  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0320  hypothetical protein  63.36 
 
 		 237 aa  286  2e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.396962  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0401  hypothetical protein  63.36 
 
 		 237 aa  286  2e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0380  hypothetical protein  63.36 
 
 		 237 aa  286  2e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0329  hypothetical protein  63.36 
 
 		 237 aa  286  2e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3592  protein of unknown function DUF1568  62.5 
 
 		 235 aa  285  2.9999999999999996e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00165115  hitchhiker  0.000000708999 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0364  transposase-like protein  62.5 
 
 		 235 aa  285  5e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.72516  normal  0.431982 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2789  hypothetical protein  62.07 
 
 		 235 aa  284  7e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.603101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1007  hypothetical protein  45.61 
 
 		 234 aa  184  8e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.849512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0682  hypothetical protein  44.34 
 
 		 232 aa  176  3e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.349284  normal  0.584525 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2932  hypothetical protein  40.87 
 
 		 234 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.56667  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1151  protein of unknown function DUF1568  41.47 
 
 		 231 aa  164  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5559  hypothetical protein  41.01 
 
 		 236 aa  163  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.316618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0790  hypothetical protein  41.01 
 
 		 232 aa  161  7e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.513436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0740  hypothetical protein  41.2 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.345588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0708  protein of unknown function DUF1568  40.55 
 
 		 233 aa  158  7e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.615013  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2394  hypothetical protein  41.38 
 
 		 239 aa  156  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.419691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3264  hypothetical protein  38.16 
 
 		 247 aa  150  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0926373  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2966  hypothetical protein  38.33 
 
 		 241 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3127  hypothetical protein  36.44 
 
 		 261 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4446  hypothetical protein  34.83 
 
 		 236 aa  144  1e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.885807  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2897  protein of unknown function DUF1568  35.9 
 
 		 250 aa  142  7e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0773075 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3244  protein of unknown function DUF1568  36.4 
 
 		 241 aa  141  8e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1802  protein of unknown function DUF1568  34.31 
 
 		 240 aa  135  5e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1484  hypothetical protein  34.15 
 
 		 231 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0093  hypothetical protein  35.56 
 
 		 234 aa  134  9.999999999999999e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150021  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3397  hypothetical protein  38.36 
 
 		 237 aa  131  1.0000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3295  hypothetical protein  31.58 
 
 		 230 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0477  hypothetical protein  31.19 
 
 		 232 aa  122  5e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3122  transposase  31.34 
 
 		 231 aa  121  9e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.299801  normal  0.623865 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3670  transposase and inactivated derivatives  30.24 
 
 		 228 aa  119  3e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3871  protein of unknown function DUF1568  32.63 
 
 		 236 aa  117  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3104  hypothetical protein  32.62 
 
 		 233 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.18817 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0996  protein of unknown function DUF1568  33.33 
 
 		 216 aa  110  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.976226  normal  0.164778 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1708  hypothetical protein  28.38 
 
 		 461 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0033  hypothetical protein  31.62 
 
 		 235 aa  105  5e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1552  protein of unknown function DUF1568  28.09 
 
 		 230 aa  105  6e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.268269 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1558  protein of unknown function DUF1568  28.44 
 
 		 230 aa  101  9e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.55731 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1554  protein of unknown function DUF1568  28.09 
 
 		 230 aa  100  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.335003 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1556  protein of unknown function DUF1568  28.09 
 
 		 230 aa  100  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.444415 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2793  transposase-like p;rotein  34.87 
 
 		 165 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0397  protein of unknown function DUF1568  35.75 
 
 		 304 aa  86.7  3e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000164254  normal  0.853679 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0917  protein of unknown function DUF1568  26.94 
 
 		 221 aa  86.7  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2396  hypothetical protein  27.05 
 
 		 220 aa  86.3  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5382  hypothetical protein  35 
 
 		 223 aa  83.6  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564815  normal  0.588654 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1512  hypothetical protein  33.33 
 
 		 222 aa  83.2  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.656335 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1701  hypothetical protein  28.93 
 
 		 174 aa  83.2  0.000000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2265  transposase and inactivated derivatives  25.81 
 
 		 241 aa  79  0.00000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1032  protein of unknown function DUF1568  30.53 
 
 		 326 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3016  hypothetical protein  28.71 
 
 		 312 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0770  protein of unknown function DUF1568  26.17 
 
 		 316 aa  76.6  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.717082  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2131  hypothetical protein  31.29 
 
 		 333 aa  76.3  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.132605  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3926  hypothetical protein  26.29 
 
 		 322 aa  75.9  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1386  protein of unknown function DUF1568  31.72 
 
 		 325 aa  75.5  0.0000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3020  hypothetical protein  28.23 
 
 		 316 aa  75.5  0.0000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2264  transposase and inactivated derivatives  26.04 
 
 		 323 aa  74.3  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.88974  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3037  protein of unknown function DUF1568  25.7 
 
 		 315 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1724  hypothetical protein  26.56 
 
 		 248 aa  73.6  0.000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1725  hypothetical protein  26.56 
 
 		 248 aa  73.2  0.000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0950  hypothetical protein  31.29 
 
 		 321 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000190963  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3632  hypothetical protein  26.05 
 
 		 316 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.108416  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1748  hypothetical protein  29.07 
 
 		 312 aa  73.2  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.994794  normal  0.0128416 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12790  transposase  30 
 
 		 241 aa  72.4  0.000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1055  transposase  26.71 
 
 		 250 aa  72.8  0.000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1620  hypothetical protein  28.11 
 
 		 313 aa  72.4  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0793  hypothetical protein  26.32 
 
 		 314 aa  72.4  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0136  transposase  29.75 
 
 		 236 aa  71.6  0.000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0148  transposase  28.93 
 
 		 236 aa  70.9  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0526667  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1813  protein of unknown function DUF1568  30.48 
 
 		 277 aa  71.6  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00112655  hitchhiker  0.00000000103135 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2878  protein of unknown function DUF1568  30.33 
 
 		 289 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000473385 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2474  protein of unknown function DUF1568  23.73 
 
 		 224 aa  70.1  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000403207  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0595  hypothetical protein  27.66 
 
 		 258 aa  70.1  0.00000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.217159  hitchhiker  2.03187e-17 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4538  protein of unknown function DUF1568  28.57 
 
 		 251 aa  69.7  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0855967  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3049  transposase and inactivated derivatives  25.37 
 
 		 226 aa  69.3  0.00000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1406  protein of unknown function DUF1568  29.51 
 
 		 289 aa  68.9  0.00000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0845  hypothetical protein  26.63 
 
 		 334 aa  68.9  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1319  protein of unknown function DUF1568  31.03 
 
 		 319 aa  68.6  0.00000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0490388  hitchhiker  0.00690567 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2878  protein of unknown function DUF1568  24.88 
 
 		 287 aa  67  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1782  protein of unknown function DUF1568  28.09 
 
 		 325 aa  67  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0188832 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1423  protein of unknown function DUF1568  28.97 
 
 		 325 aa  66.6  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.892865 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1256  protein of unknown function DUF1568  28.97 
 
 		 321 aa  67  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0072967  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0954  hypothetical protein  28.11 
 
 		 326 aa  65.9  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.729066  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2198  transposase  24.71 
 
 		 253 aa  66.2  0.0000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2192  hypothetical protein  24.66 
 
 		 253 aa  65.9  0.0000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107555  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2218  hypothetical protein  29.33 
 
 		 327 aa  65.5  0.0000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00293328  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1392  hypothetical protein  24.6 
 
 		 320 aa  65.1  0.0000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2086  hypothetical protein  32.21 
 
 		 321 aa  65.1  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.464464  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1356  hypothetical protein  22.6 
 
 		 319 aa  63.5  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.895893  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>