231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1708 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1708  hypothetical protein  100 
 
 		 461 aa  942    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3592  protein of unknown function DUF1568  33.19 
 
 		 235 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00165115  hitchhiker  0.000000708999 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0364  transposase-like protein  33.19 
 
 		 235 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.72516  normal  0.431982 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2789  hypothetical protein  33.48 
 
 		 235 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.603101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3691  hypothetical protein  32.17 
 
 		 237 aa  145  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2737  hypothetical protein  32.17 
 
 		 237 aa  145  2e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3719  transposase  32.17 
 
 		 237 aa  145  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.719861  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0329  hypothetical protein  31.74 
 
 		 237 aa  145  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3498  hypothetical protein  31.74 
 
 		 237 aa  145  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.827202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3015  hypothetical protein  32.17 
 
 		 237 aa  145  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1766  hypothetical protein  32.17 
 
 		 237 aa  145  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3749  hypothetical protein  32.17 
 
 		 237 aa  145  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2706  hypothetical protein  31.74 
 
 		 237 aa  145  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0803898  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0380  hypothetical protein  31.74 
 
 		 237 aa  145  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0320  hypothetical protein  31.74 
 
 		 237 aa  145  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.396962  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0401  hypothetical protein  31.74 
 
 		 237 aa  145  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2788  hypothetical protein  32.17 
 
 		 237 aa  145  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3215  hypothetical protein  32.17 
 
 		 237 aa  145  2e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4446  hypothetical protein  34.8 
 
 		 236 aa  144  3e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.885807  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0304  hypothetical protein  31.74 
 
 		 237 aa  144  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2932  hypothetical protein  33.78 
 
 		 234 aa  143  6e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.56667  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1802  protein of unknown function DUF1568  32.02 
 
 		 240 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1007  hypothetical protein  31.14 
 
 		 234 aa  139  7.999999999999999e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.849512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0790  hypothetical protein  33.19 
 
 		 232 aa  138  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.513436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5559  hypothetical protein  29.31 
 
 		 236 aa  137  3.0000000000000003e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.316618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3670  transposase and inactivated derivatives  31.58 
 
 		 228 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3295  hypothetical protein  32.6 
 
 		 230 aa  136  8e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3397  hypothetical protein  29.66 
 
 		 237 aa  134  3e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0477  hypothetical protein  30.6 
 
 		 232 aa  133  7.999999999999999e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1151  protein of unknown function DUF1568  29.57 
 
 		 231 aa  131  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0093  hypothetical protein  32.89 
 
 		 234 aa  131  3e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150021  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0682  hypothetical protein  30.67 
 
 		 232 aa  129  1.0000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.349284  normal  0.584525 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0708  protein of unknown function DUF1568  29.33 
 
 		 233 aa  127  3e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.615013  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3871  protein of unknown function DUF1568  29.07 
 
 		 236 aa  127  5e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3244  protein of unknown function DUF1568  27.27 
 
 		 241 aa  124  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1484  hypothetical protein  27.31 
 
 		 231 aa  124  4e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0740  hypothetical protein  28.7 
 
 		 255 aa  124  4e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.345588  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2966  hypothetical protein  27.27 
 
 		 241 aa  124  5e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2394  hypothetical protein  29.2 
 
 		 239 aa  123  7e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.419691  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2897  protein of unknown function DUF1568  28.51 
 
 		 250 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0773075 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3122  transposase  30.3 
 
 		 231 aa  121  3e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.299801  normal  0.623865 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3264  hypothetical protein  28.39 
 
 		 247 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0926373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0026  SapC  29.36 
 
 		 264 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3104  hypothetical protein  28.32 
 
 		 233 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.18817 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0655  SapC family protein  31.44 
 
 		 237 aa  118  3e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1552  protein of unknown function DUF1568  27.43 
 
 		 230 aa  117  3e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.268269 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1554  protein of unknown function DUF1568  26.87 
 
 		 230 aa  116  6.9999999999999995e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.335003 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1556  protein of unknown function DUF1568  26.87 
 
 		 230 aa  116  6.9999999999999995e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.444415 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1558  protein of unknown function DUF1568  27.52 
 
 		 230 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.55731 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0033  hypothetical protein  29.61 
 
 		 235 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3127  hypothetical protein  28.82 
 
 		 261 aa  114  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0613  SapC-related protein  30.17 
 
 		 244 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.397522  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0859  protein of unknown function DUF1568  28.38 
 
 		 238 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.682505  normal  0.123586 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0996  protein of unknown function DUF1568  28.43 
 
 		 216 aa  109  9.000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.976226  normal  0.164778 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1048  SapC  30.57 
 
 		 259 aa  109  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0951508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2386  SapC family protein  30.29 
 
 		 264 aa  108  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1947  SapC family protein  33.04 
 
 		 251 aa  105  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.257156  normal  0.0836073 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3347  SapC family protein  28.19 
 
 		 255 aa  103  7e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.652681 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2877  SapC family protein  29.74 
 
 		 233 aa  102  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.193841  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0305  SapC family protein  28.02 
 
 		 255 aa  100  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785352 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0940  hypothetical protein  29.78 
 
 		 230 aa  100  4e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00274123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1114  SapC family protein  28.32 
 
 		 239 aa  100  7e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2367  SapC family protein  26.81 
 
 		 266 aa  99.8  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0460  SapC  31.78 
 
 		 380 aa  98.6  2e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0614463  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0595  hypothetical protein  37.4 
 
 		 258 aa  98.2  3e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.217159  hitchhiker  2.03187e-17 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2202  SapC family protein  26.64 
 
 		 264 aa  98.2  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.504396  normal  0.230762 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1289  SapC  28.14 
 
 		 259 aa  97.4  4e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.369266  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2181  SapC family protein  28.76 
 
 		 240 aa  97.1  6e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000117047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2701  SapC  29.39 
 
 		 236 aa  96.3  9e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0135847  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1512  hypothetical protein  26.67 
 
 		 222 aa  95.9  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.656335 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2408  SapC family protein  27.78 
 
 		 266 aa  94.4  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0084  SapC family protein  28.82 
 
 		 273 aa  94.4  4e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4693  SapC family protein  29.05 
 
 		 264 aa  93.6  8e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0659  SapC protein, putative  28.63 
 
 		 239 aa  92.4  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0131187  normal  0.604941 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5648  hypothetical protein  26.13 
 
 		 226 aa  92.8  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.299518  normal  0.988864 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0137  SapC family protein  27.59 
 
 		 258 aa  92.4  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.459538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1307  SapC family protein  29.9 
 
 		 238 aa  90.1  7e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.537479 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3049  transposase and inactivated derivatives  25.96 
 
 		 226 aa  90.1  8e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1173  SapC family protein  25.56 
 
 		 228 aa  89.7  9e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282711  normal  0.903795 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3037  protein of unknown function DUF1568  30.77 
 
 		 315 aa  88.6  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0770  protein of unknown function DUF1568  26.44 
 
 		 316 aa  88.6  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.717082  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0580  SapC family protein  23.97 
 
 		 283 aa  89  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.132466 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1210  SapC family protein  29.49 
 
 		 239 aa  88.6  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.007094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0596  SapC family protein  24.79 
 
 		 261 aa  88.6  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00347217 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3218  SapC family protein  29.69 
 
 		 234 aa  87.4  4e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2474  protein of unknown function DUF1568  27.31 
 
 		 224 aa  87.8  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000403207  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3926  hypothetical protein  29.69 
 
 		 322 aa  87.4  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1137  SapC family protein  29.69 
 
 		 234 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.134042  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0151  hypothetical protein  28.7 
 
 		 259 aa  85.1  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.681081  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1077  SapC family protein  29.26 
 
 		 234 aa  85.1  0.000000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03269  SapC  27.78 
 
 		 256 aa  84.7  0.000000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0954  hypothetical protein  29.12 
 
 		 326 aa  84  0.000000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.729066  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1724  hypothetical protein  34.96 
 
 		 248 aa  83.6  0.000000000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1725  hypothetical protein  34.96 
 
 		 248 aa  83.6  0.000000000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3512  hypothetical protein  25.66 
 
 		 229 aa  82  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0917  protein of unknown function DUF1568  24.02 
 
 		 221 aa  81.3  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2392  SapC related protein  25.54 
 
 		 241 aa  80.9  0.00000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00276727 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1024  hypothetical protein  26.09 
 
 		 233 aa  80.5  0.00000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2545  SapC  27.16 
 
 		 238 aa  80.5  0.00000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1620  hypothetical protein  28.38 
 
 		 313 aa  80.5  0.00000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>