252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A3127 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A3127  hypothetical protein  100 
 
 		 261 aa  532  1e-150  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3264  hypothetical protein  81.17 
 
 		 247 aa  410  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0926373  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2897  protein of unknown function DUF1568  67.37 
 
 		 250 aa  332  3e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0773075 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3244  protein of unknown function DUF1568  67.23 
 
 		 241 aa  330  1e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2966  hypothetical protein  68.09 
 
 		 241 aa  328  4e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3498  hypothetical protein  46.7 
 
 		 237 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.827202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2706  hypothetical protein  46.7 
 
 		 237 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0803898  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0401  hypothetical protein  46.7 
 
 		 237 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0380  hypothetical protein  46.7 
 
 		 237 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0304  hypothetical protein  46.7 
 
 		 237 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0320  hypothetical protein  46.26 
 
 		 237 aa  211  7e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.396962  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0329  hypothetical protein  46.26 
 
 		 237 aa  211  7e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0364  transposase-like protein  46.7 
 
 		 235 aa  211  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.72516  normal  0.431982 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3215  hypothetical protein  46.26 
 
 		 237 aa  209  3e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3749  hypothetical protein  46.26 
 
 		 237 aa  209  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2737  hypothetical protein  46.26 
 
 		 237 aa  209  3e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1766  hypothetical protein  46.26 
 
 		 237 aa  209  3e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3719  transposase  46.26 
 
 		 237 aa  209  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.719861  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3015  hypothetical protein  46.26 
 
 		 237 aa  209  3e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3691  hypothetical protein  46.26 
 
 		 237 aa  209  3e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2788  hypothetical protein  46.26 
 
 		 237 aa  209  3e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3592  protein of unknown function DUF1568  46.26 
 
 		 235 aa  209  4e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00165115  hitchhiker  0.000000708999 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1007  hypothetical protein  48.9 
 
 		 234 aa  207  1e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.849512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2789  hypothetical protein  45.37 
 
 		 235 aa  207  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.603101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0790  hypothetical protein  47.11 
 
 		 232 aa  205  6e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.513436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2932  hypothetical protein  45.78 
 
 		 234 aa  203  2e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.56667  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0708  protein of unknown function DUF1568  46.22 
 
 		 233 aa  203  3e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.615013  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0740  hypothetical protein  45.74 
 
 		 255 aa  202  5e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.345588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0682  hypothetical protein  44 
 
 		 232 aa  195  5.000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.349284  normal  0.584525 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5559  hypothetical protein  44.89 
 
 		 236 aa  194  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.316618  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4446  hypothetical protein  38.72 
 
 		 236 aa  187  2e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.885807  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2394  hypothetical protein  43.91 
 
 		 239 aa  185  6e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.419691  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1151  protein of unknown function DUF1568  43.56 
 
 		 231 aa  179  2.9999999999999997e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3670  transposase and inactivated derivatives  36.84 
 
 		 228 aa  178  1e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0093  hypothetical protein  40.53 
 
 		 234 aa  174  9.999999999999999e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150021  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3295  hypothetical protein  37 
 
 		 230 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1802  protein of unknown function DUF1568  40.79 
 
 		 240 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3104  hypothetical protein  40.17 
 
 		 233 aa  169  3e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.18817 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3397  hypothetical protein  42.67 
 
 		 237 aa  165  8e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0477  hypothetical protein  39.56 
 
 		 232 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1484  hypothetical protein  36.12 
 
 		 231 aa  163  3e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3122  transposase  37.78 
 
 		 231 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.299801  normal  0.623865 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5648  hypothetical protein  38.78 
 
 		 226 aa  149  6e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.299518  normal  0.988864 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0859  protein of unknown function DUF1568  36.44 
 
 		 238 aa  146  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.682505  normal  0.123586 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0033  hypothetical protein  37.55 
 
 		 235 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0996  protein of unknown function DUF1568  40.59 
 
 		 216 aa  138  1e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.976226  normal  0.164778 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2776  hypothetical protein  36.17 
 
 		 235 aa  125  5e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.721483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1552  protein of unknown function DUF1568  33.19 
 
 		 230 aa  125  6e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.268269 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1554  protein of unknown function DUF1568  33.48 
 
 		 230 aa  125  8.000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.335003 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1556  protein of unknown function DUF1568  33.48 
 
 		 230 aa  125  8.000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.444415 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3049  transposase and inactivated derivatives  30.87 
 
 		 226 aa  124  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3871  protein of unknown function DUF1568  32.62 
 
 		 236 aa  120  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1558  protein of unknown function DUF1568  32.88 
 
 		 230 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.55731 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2396  hypothetical protein  36.56 
 
 		 220 aa  113  3e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1701  hypothetical protein  39.35 
 
 		 174 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1708  hypothetical protein  28.32 
 
 		 461 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1967  hypothetical protein  33.49 
 
 		 226 aa  107  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00827335  normal  0.496503 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0917  protein of unknown function DUF1568  33.05 
 
 		 221 aa  106  4e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5382  hypothetical protein  34.07 
 
 		 223 aa  105  7e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564815  normal  0.588654 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1512  hypothetical protein  34.67 
 
 		 222 aa  104  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.656335 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2153  hypothetical protein  30.28 
 
 		 221 aa  98.6  8e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0207768  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2474  protein of unknown function DUF1568  28.19 
 
 		 224 aa  97.4  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000403207  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1620  hypothetical protein  30.62 
 
 		 313 aa  92  9e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2793  transposase-like p;rotein  39.31 
 
 		 165 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3037  protein of unknown function DUF1568  30.29 
 
 		 315 aa  90.5  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1725  hypothetical protein  35.16 
 
 		 248 aa  90.1  3e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3020  hypothetical protein  30.97 
 
 		 316 aa  90.1  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1724  hypothetical protein  37.61 
 
 		 248 aa  89.7  4e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3016  hypothetical protein  35.81 
 
 		 312 aa  88.2  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0595  hypothetical protein  34.13 
 
 		 258 aa  87  2e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.217159  hitchhiker  2.03187e-17 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1748  hypothetical protein  39.35 
 
 		 312 aa  87.4  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.994794  normal  0.0128416 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0397  protein of unknown function DUF1568  35.88 
 
 		 304 aa  87  3e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000164254  normal  0.853679 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2265  transposase and inactivated derivatives  28.1 
 
 		 241 aa  85.1  9e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3632  hypothetical protein  31.07 
 
 		 316 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.108416  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2264  transposase and inactivated derivatives  27.62 
 
 		 323 aa  83.6  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.88974  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0950  hypothetical protein  32.67 
 
 		 321 aa  83.2  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000190963  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0793  hypothetical protein  33.78 
 
 		 314 aa  82.8  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0164  transposase  33.57 
 
 		 287 aa  81.6  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0743928  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0487  transposase  31.73 
 
 		 222 aa  80.9  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3926  hypothetical protein  28.7 
 
 		 322 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0493  transposase  33.33 
 
 		 222 aa  80.1  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2771  hypothetical protein  34.9 
 
 		 318 aa  79.3  0.00000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1406  protein of unknown function DUF1568  28.37 
 
 		 289 aa  79.3  0.00000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12790  transposase  35.34 
 
 		 241 aa  79  0.00000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2878  protein of unknown function DUF1568  27.83 
 
 		 287 aa  78.6  0.00000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0459  transposase  30.77 
 
 		 222 aa  77.4  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2878  protein of unknown function DUF1568  27.91 
 
 		 289 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000473385 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0770  protein of unknown function DUF1568  27.62 
 
 		 316 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.717082  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1032  protein of unknown function DUF1568  31.78 
 
 		 326 aa  76.6  0.0000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4538  protein of unknown function DUF1568  33.11 
 
 		 251 aa  76.3  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0855967  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1356  hypothetical protein  31.82 
 
 		 319 aa  75.5  0.0000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.895893  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3105  protein of unknown function DUF1568  34.65 
 
 		 192 aa  74.7  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000625853  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3078  protein of unknown function DUF1568  34.65 
 
 		 190 aa  74.3  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2198  transposase  28.07 
 
 		 253 aa  72  0.000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0207  hypothetical protein  28.17 
 
 		 288 aa  71.6  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0136  transposase  29.23 
 
 		 236 aa  71.2  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0203  hypothetical protein  27.19 
 
 		 288 aa  70.5  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3248  protein of unknown function DUF1568  33.07 
 
 		 181 aa  70.9  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00178625  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0148  transposase  31.06 
 
 		 236 aa  70.9  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0526667  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2192  hypothetical protein  28.07 
 
 		 253 aa  71.2  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107555  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>