184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3397 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3397  hypothetical protein  100 
 
 		 237 aa  469  1.0000000000000001e-131  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1007  hypothetical protein  51.11 
 
 		 234 aa  216  2e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.849512  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1151  protein of unknown function DUF1568  47.37 
 
 		 231 aa  210  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0790  hypothetical protein  45.85 
 
 		 232 aa  207  2e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.513436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3104  hypothetical protein  49.12 
 
 		 233 aa  206  3e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.18817 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2737  hypothetical protein  47.11 
 
 		 237 aa  203  2e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3719  transposase  47.11 
 
 		 237 aa  203  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.719861  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3015  hypothetical protein  47.11 
 
 		 237 aa  203  2e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3215  hypothetical protein  47.11 
 
 		 237 aa  203  2e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2394  hypothetical protein  48.89 
 
 		 239 aa  203  2e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.419691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1766  hypothetical protein  47.11 
 
 		 237 aa  203  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3691  hypothetical protein  47.11 
 
 		 237 aa  203  2e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3749  hypothetical protein  47.11 
 
 		 237 aa  203  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2788  hypothetical protein  47.11 
 
 		 237 aa  203  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2932  hypothetical protein  43.78 
 
 		 234 aa  202  5e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.56667  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0708  protein of unknown function DUF1568  46.22 
 
 		 233 aa  202  5e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.615013  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2789  hypothetical protein  44.44 
 
 		 235 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.603101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0304  hypothetical protein  46.22 
 
 		 237 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0682  hypothetical protein  43.48 
 
 		 232 aa  199  3e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.349284  normal  0.584525 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0740  hypothetical protein  45.98 
 
 		 255 aa  199  3e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.345588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0364  transposase-like protein  44 
 
 		 235 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.72516  normal  0.431982 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5559  hypothetical protein  45.81 
 
 		 236 aa  199  3.9999999999999996e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.316618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3592  protein of unknown function DUF1568  44 
 
 		 235 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00165115  hitchhiker  0.000000708999 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3498  hypothetical protein  45.78 
 
 		 237 aa  198  5e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.827202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2706  hypothetical protein  45.78 
 
 		 237 aa  198  5e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0803898  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0329  hypothetical protein  45.78 
 
 		 237 aa  198  5e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0320  hypothetical protein  45.78 
 
 		 237 aa  198  5e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.396962  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0401  hypothetical protein  45.78 
 
 		 237 aa  198  5e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0380  hypothetical protein  45.78 
 
 		 237 aa  198  5e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3244  protein of unknown function DUF1568  44.98 
 
 		 241 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2897  protein of unknown function DUF1568  44.69 
 
 		 250 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0773075 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3264  hypothetical protein  44.44 
 
 		 247 aa  180  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0926373  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2966  hypothetical protein  44.1 
 
 		 241 aa  177  9e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3127  hypothetical protein  42.67 
 
 		 261 aa  172  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0093  hypothetical protein  37.33 
 
 		 234 aa  166  2.9999999999999998e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150021  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1484  hypothetical protein  37.04 
 
 		 231 aa  165  5e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1802  protein of unknown function DUF1568  38.94 
 
 		 240 aa  162  3e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4446  hypothetical protein  34.08 
 
 		 236 aa  152  2.9999999999999998e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.885807  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3871  protein of unknown function DUF1568  38.67 
 
 		 236 aa  152  4e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3122  transposase  34.65 
 
 		 231 aa  149  3e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.299801  normal  0.623865 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3670  transposase and inactivated derivatives  32.44 
 
 		 228 aa  149  4e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0859  protein of unknown function DUF1568  38.33 
 
 		 238 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.682505  normal  0.123586 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1708  hypothetical protein  29.78 
 
 		 461 aa  141  9e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3295  hypothetical protein  32.89 
 
 		 230 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0477  hypothetical protein  32.47 
 
 		 232 aa  137  1e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1512  hypothetical protein  37.07 
 
 		 222 aa  136  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.656335 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0996  protein of unknown function DUF1568  40.32 
 
 		 216 aa  135  4e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.976226  normal  0.164778 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5648  hypothetical protein  36.84 
 
 		 226 aa  135  5e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.299518  normal  0.988864 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0033  hypothetical protein  36.32 
 
 		 235 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1552  protein of unknown function DUF1568  34.06 
 
 		 230 aa  135  8e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.268269 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1554  protein of unknown function DUF1568  33.63 
 
 		 230 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.335003 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1556  protein of unknown function DUF1568  33.63 
 
 		 230 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.444415 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1558  protein of unknown function DUF1568  35.27 
 
 		 230 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.55731 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2776  hypothetical protein  35.56 
 
 		 235 aa  120  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.721483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3049  transposase and inactivated derivatives  30.67 
 
 		 226 aa  118  9e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1701  hypothetical protein  40.26 
 
 		 174 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0917  protein of unknown function DUF1568  33.04 
 
 		 221 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2396  hypothetical protein  33.63 
 
 		 220 aa  113  3e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5382  hypothetical protein  35.32 
 
 		 223 aa  107  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564815  normal  0.588654 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3037  protein of unknown function DUF1568  29.36 
 
 		 315 aa  104  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2793  transposase-like p;rotein  38.73 
 
 		 165 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2153  hypothetical protein  31.02 
 
 		 221 aa  101  9e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0207768  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1620  hypothetical protein  36.59 
 
 		 313 aa  100  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2474  protein of unknown function DUF1568  27.39 
 
 		 224 aa  98.6  8e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000403207  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0950  hypothetical protein  34.42 
 
 		 321 aa  95.1  9e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000190963  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2086  hypothetical protein  36.73 
 
 		 321 aa  92.8  5e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.464464  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1032  protein of unknown function DUF1568  34.04 
 
 		 326 aa  92  8e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1967  hypothetical protein  34.75 
 
 		 282 aa  91.7  9e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.969925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1966  hypothetical protein  33.55 
 
 		 305 aa  90.5  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.527692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2264  transposase and inactivated derivatives  29.68 
 
 		 323 aa  90.5  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.88974  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0793  hypothetical protein  32.24 
 
 		 314 aa  90.5  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3016  hypothetical protein  31.58 
 
 		 312 aa  90.9  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2878  protein of unknown function DUF1568  31.05 
 
 		 289 aa  89.7  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000473385 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3020  hypothetical protein  32.65 
 
 		 316 aa  89.7  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1356  hypothetical protein  33.11 
 
 		 319 aa  89.4  5e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.895893  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0203  hypothetical protein  28.04 
 
 		 288 aa  89  6e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0207  hypothetical protein  28.04 
 
 		 288 aa  89  6e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2265  transposase and inactivated derivatives  29.03 
 
 		 241 aa  89  6e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1748  hypothetical protein  32.89 
 
 		 312 aa  89  6e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.994794  normal  0.0128416 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0397  protein of unknown function DUF1568  31.95 
 
 		 304 aa  88.6  7e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000164254  normal  0.853679 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1813  protein of unknown function DUF1568  30.96 
 
 		 277 aa  87.8  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00112655  hitchhiker  0.00000000103135 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0201  hypothetical protein  27.57 
 
 		 288 aa  87  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2192  hypothetical protein  28.48 
 
 		 253 aa  87  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107555  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2198  transposase  28.08 
 
 		 253 aa  86.7  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3926  hypothetical protein  31.76 
 
 		 322 aa  85.5  7e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1967  hypothetical protein  28.28 
 
 		 226 aa  85.1  9e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00827335  normal  0.496503 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12790  transposase  34.81 
 
 		 241 aa  84.3  0.000000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1406  protein of unknown function DUF1568  31.91 
 
 		 289 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0845  hypothetical protein  27.32 
 
 		 334 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0136  transposase  32.58 
 
 		 236 aa  82.4  0.000000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1423  protein of unknown function DUF1568  32.88 
 
 		 325 aa  82.4  0.000000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.892865 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0148  transposase  31.06 
 
 		 236 aa  82.4  0.000000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0526667  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0493  transposase  31.16 
 
 		 222 aa  81.6  0.000000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0487  transposase  31.66 
 
 		 222 aa  81.3  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0770  protein of unknown function DUF1568  25.96 
 
 		 316 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.717082  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0164  transposase  31.97 
 
 		 287 aa  80.1  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0743928  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4538  protein of unknown function DUF1568  29.05 
 
 		 251 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0855967  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0595  hypothetical protein  29.1 
 
 		 258 aa  79.7  0.00000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.217159  hitchhiker  2.03187e-17 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2333  protein of unknown function DUF1568  32.68 
 
 		 324 aa  79  0.00000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01210  transposase  30.82 
 
 		 245 aa  78.6  0.00000000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>