More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3122 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_3122  transposase  100 
 
 		 231 aa  487  1e-137  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.299801  normal  0.623865 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1484  hypothetical protein  68.44 
 
 		 231 aa  330  8e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1802  protein of unknown function DUF1568  57.33 
 
 		 240 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0477  hypothetical protein  47.79 
 
 		 232 aa  233  1.0000000000000001e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3295  hypothetical protein  49.78 
 
 		 230 aa  228  5e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4446  hypothetical protein  48.36 
 
 		 236 aa  223  1e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.885807  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3670  transposase and inactivated derivatives  49.78 
 
 		 228 aa  223  2e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2932  hypothetical protein  42.22 
 
 		 234 aa  199  3e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.56667  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1151  protein of unknown function DUF1568  42.22 
 
 		 231 aa  196  3e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0790  hypothetical protein  43.67 
 
 		 232 aa  195  4.0000000000000005e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.513436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0682  hypothetical protein  42.67 
 
 		 232 aa  193  2e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.349284  normal  0.584525 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1007  hypothetical protein  40.44 
 
 		 234 aa  192  5e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.849512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0996  protein of unknown function DUF1568  45.28 
 
 		 216 aa  187  1e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.976226  normal  0.164778 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3592  protein of unknown function DUF1568  39.56 
 
 		 235 aa  180  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00165115  hitchhiker  0.000000708999 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0304  hypothetical protein  39.56 
 
 		 237 aa  180  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1552  protein of unknown function DUF1568  38.94 
 
 		 230 aa  179  2e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.268269 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0364  transposase-like protein  39.11 
 
 		 235 aa  179  4e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.72516  normal  0.431982 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0380  hypothetical protein  38.67 
 
 		 237 aa  178  7e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3498  hypothetical protein  38.67 
 
 		 237 aa  178  7e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.827202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0401  hypothetical protein  38.67 
 
 		 237 aa  178  7e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0320  hypothetical protein  38.67 
 
 		 237 aa  178  7e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.396962  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0329  hypothetical protein  38.67 
 
 		 237 aa  178  7e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2706  hypothetical protein  38.67 
 
 		 237 aa  178  7e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0803898  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3749  hypothetical protein  38.67 
 
 		 237 aa  176  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3215  hypothetical protein  38.67 
 
 		 237 aa  176  2e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2737  hypothetical protein  38.67 
 
 		 237 aa  176  2e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3719  transposase  38.67 
 
 		 237 aa  176  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.719861  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3015  hypothetical protein  38.67 
 
 		 237 aa  176  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3691  hypothetical protein  38.67 
 
 		 237 aa  176  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2788  hypothetical protein  38.67 
 
 		 237 aa  176  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1766  hypothetical protein  38.67 
 
 		 237 aa  176  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1556  protein of unknown function DUF1568  37.61 
 
 		 230 aa  176  3e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.444415 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1554  protein of unknown function DUF1568  37.61 
 
 		 230 aa  176  3e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.335003 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0708  protein of unknown function DUF1568  39.82 
 
 		 233 aa  175  4e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.615013  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2789  hypothetical protein  38.67 
 
 		 235 aa  174  8e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.603101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0740  hypothetical protein  39.73 
 
 		 255 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.345588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3244  protein of unknown function DUF1568  37.78 
 
 		 241 aa  171  6.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0033  hypothetical protein  42.04 
 
 		 235 aa  170  1e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2897  protein of unknown function DUF1568  37.78 
 
 		 250 aa  170  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0773075 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2966  hypothetical protein  38.1 
 
 		 241 aa  169  4e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2394  hypothetical protein  38.22 
 
 		 239 aa  169  5e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.419691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1558  protein of unknown function DUF1568  38.39 
 
 		 230 aa  166  4e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.55731 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3871  protein of unknown function DUF1568  39.11 
 
 		 236 aa  163  2.0000000000000002e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0093  hypothetical protein  45.61 
 
 		 234 aa  158  7e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150021  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3127  hypothetical protein  37.78 
 
 		 261 aa  155  4e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5559  hypothetical protein  33.48 
 
 		 236 aa  155  5.0000000000000005e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.316618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3264  hypothetical protein  36.89 
 
 		 247 aa  148  8e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0926373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2793  transposase-like p;rotein  48.95 
 
 		 165 aa  143  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1512  hypothetical protein  36 
 
 		 222 aa  140  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.656335 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3397  hypothetical protein  34.65 
 
 		 237 aa  134  8e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0917  protein of unknown function DUF1568  33.48 
 
 		 221 aa  126  3e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3037  protein of unknown function DUF1568  40 
 
 		 315 aa  125  6e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0770  protein of unknown function DUF1568  40.85 
 
 		 316 aa  124  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.717082  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3049  transposase and inactivated derivatives  32.89 
 
 		 226 aa  122  4e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0859  protein of unknown function DUF1568  31.34 
 
 		 238 aa  121  8e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.682505  normal  0.123586 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1708  hypothetical protein  30.67 
 
 		 461 aa  121  9.999999999999999e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1620  hypothetical protein  33.64 
 
 		 313 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5382  hypothetical protein  31.22 
 
 		 223 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564815  normal  0.588654 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5648  hypothetical protein  30.73 
 
 		 226 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.299518  normal  0.988864 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1701  hypothetical protein  40 
 
 		 174 aa  115  7.999999999999999e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0950  hypothetical protein  40.28 
 
 		 321 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000190963  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3926  hypothetical protein  34.1 
 
 		 322 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1967  hypothetical protein  40.74 
 
 		 226 aa  113  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00827335  normal  0.496503 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2396  hypothetical protein  32.33 
 
 		 220 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3104  hypothetical protein  30.13 
 
 		 233 aa  112  5e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.18817 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2265  transposase and inactivated derivatives  32.88 
 
 		 241 aa  111  9e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3632  hypothetical protein  33.01 
 
 		 316 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.108416  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2474  protein of unknown function DUF1568  29.76 
 
 		 224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000403207  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2264  transposase and inactivated derivatives  32.88 
 
 		 323 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.88974  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1748  hypothetical protein  31.78 
 
 		 312 aa  109  3e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.994794  normal  0.0128416 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3020  hypothetical protein  32.05 
 
 		 316 aa  108  5e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1724  hypothetical protein  36.62 
 
 		 248 aa  108  7.000000000000001e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1725  hypothetical protein  36.62 
 
 		 248 aa  108  7.000000000000001e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0793  hypothetical protein  38.62 
 
 		 314 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2878  protein of unknown function DUF1568  33.5 
 
 		 289 aa  107  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000473385 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2878  protein of unknown function DUF1568  31.55 
 
 		 287 aa  106  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3016  hypothetical protein  35.29 
 
 		 312 aa  106  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1406  protein of unknown function DUF1568  32.52 
 
 		 289 aa  104  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1813  protein of unknown function DUF1568  34.51 
 
 		 277 aa  104  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00112655  hitchhiker  0.00000000103135 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0203  hypothetical protein  32.26 
 
 		 288 aa  101  9e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0164  transposase  39.35 
 
 		 287 aa  101  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0743928  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0201  hypothetical protein  31.8 
 
 		 288 aa  100  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0207  hypothetical protein  31.39 
 
 		 288 aa  99.8  3e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1356  hypothetical protein  32.96 
 
 		 319 aa  99.4  4e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.895893  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3248  protein of unknown function DUF1568  34.64 
 
 		 181 aa  99.4  4e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00178625  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2086  hypothetical protein  30 
 
 		 321 aa  99.4  4e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.464464  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2153  hypothetical protein  33.54 
 
 		 221 aa  99  5e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0207768  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1032  protein of unknown function DUF1568  35.86 
 
 		 326 aa  97.4  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2776  hypothetical protein  29.07 
 
 		 235 aa  98.2  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.721483  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2771  hypothetical protein  32.22 
 
 		 318 aa  95.1  8e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3078  protein of unknown function DUF1568  38.03 
 
 		 190 aa  94.7  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3105  protein of unknown function DUF1568  38.03 
 
 		 192 aa  94.7  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000625853  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2192  hypothetical protein  33.14 
 
 		 253 aa  94  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107555  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2198  transposase  34.51 
 
 		 253 aa  92.4  5e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1967  hypothetical protein  29.49 
 
 		 282 aa  92  6e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.969925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4538  protein of unknown function DUF1568  33.8 
 
 		 251 aa  91.7  9e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0855967  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0267  transposase and inactivated derivatives  47.06 
 
 		 104 aa  90.9  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0595  hypothetical protein  36.88 
 
 		 258 aa  90.9  1e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.217159  hitchhiker  2.03187e-17 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2620  hypothetical protein  32.77 
 
 		 254 aa  91.3  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000852823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1966  hypothetical protein  29.49 
 
 		 305 aa  89.4  4e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.527692  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>