136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0267 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0267  transposase and inactivated derivatives  100 
 
 
104 aa  218  1.9999999999999999e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1484  hypothetical protein  52.94 
 
 
231 aa  106  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1802  protein of unknown function DUF1568  47.73 
 
 
240 aa  98.2  4e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3122  transposase  47.06 
 
 
231 aa  90.9  5e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.299801  normal  0.623865 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3295  hypothetical protein  49.43 
 
 
230 aa  89  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0477  hypothetical protein  42.05 
 
 
232 aa  86.7  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0033  hypothetical protein  40.91 
 
 
235 aa  85.5  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4446  hypothetical protein  45.45 
 
 
236 aa  84.7  4e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.885807  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3670  transposase and inactivated derivatives  48.28 
 
 
228 aa  84.7  4e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1151  protein of unknown function DUF1568  42.53 
 
 
231 aa  82  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0093  hypothetical protein  41.38 
 
 
234 aa  78.2  0.00000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150021  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2932  hypothetical protein  41.38 
 
 
234 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.56667  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2394  hypothetical protein  42.53 
 
 
239 aa  75.9  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.419691  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2793  transposase-like p;rotein  41.46 
 
 
165 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0682  hypothetical protein  37.93 
 
 
232 aa  71.2  0.000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.349284  normal  0.584525 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0790  hypothetical protein  39.08 
 
 
232 aa  69.7  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.513436  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0996  protein of unknown function DUF1568  41.18 
 
 
216 aa  68.9  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.976226  normal  0.164778 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3244  protein of unknown function DUF1568  33.65 
 
 
241 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2966  hypothetical protein  35.58 
 
 
241 aa  68.2  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0770  protein of unknown function DUF1568  36.36 
 
 
316 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.717082  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2897  protein of unknown function DUF1568  33.65 
 
 
250 aa  67  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0773075 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1007  hypothetical protein  38.82 
 
 
234 aa  66.6  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.849512  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2737  hypothetical protein  35.29 
 
 
237 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3719  transposase  35.29 
 
 
237 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.719861  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3015  hypothetical protein  35.29 
 
 
237 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3215  hypothetical protein  35.29 
 
 
237 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1766  hypothetical protein  35.29 
 
 
237 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3691  hypothetical protein  35.29 
 
 
237 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3749  hypothetical protein  35.29 
 
 
237 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2788  hypothetical protein  35.29 
 
 
237 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3264  hypothetical protein  33.65 
 
 
247 aa  65.1  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0926373  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0708  protein of unknown function DUF1568  38.82 
 
 
233 aa  65.1  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.615013  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3397  hypothetical protein  43.53 
 
 
237 aa  65.1  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3871  protein of unknown function DUF1568  36.47 
 
 
236 aa  64.7  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3498  hypothetical protein  34.12 
 
 
237 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.827202  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2706  hypothetical protein  34.12 
 
 
237 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0803898  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0320  hypothetical protein  34.12 
 
 
237 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.396962  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0401  hypothetical protein  34.12 
 
 
237 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0304  hypothetical protein  34.12 
 
 
237 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0380  hypothetical protein  34.12 
 
 
237 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0329  hypothetical protein  34.12 
 
 
237 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3127  hypothetical protein  31.73 
 
 
261 aa  63.5  0.0000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0364  transposase-like protein  32.94 
 
 
235 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.72516  normal  0.431982 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0740  hypothetical protein  38.55 
 
 
255 aa  63.5  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.345588  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2789  hypothetical protein  32.94 
 
 
235 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.603101  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3592  protein of unknown function DUF1568  32.94 
 
 
235 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00165115  hitchhiker  0.000000708999 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3037  protein of unknown function DUF1568  32.95 
 
 
315 aa  60.8  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1554  protein of unknown function DUF1568  43.08 
 
 
230 aa  60.8  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.335003 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1556  protein of unknown function DUF1568  43.08 
 
 
230 aa  60.8  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.444415 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1552  protein of unknown function DUF1568  43.08 
 
 
230 aa  60.8  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.268269 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1558  protein of unknown function DUF1568  43.08 
 
 
230 aa  60.5  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.55731 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1724  hypothetical protein  34.48 
 
 
248 aa  59.3  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1725  hypothetical protein  34.48 
 
 
248 aa  59.3  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5559  hypothetical protein  32.18 
 
 
236 aa  58.9  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.316618  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1708  hypothetical protein  31.03 
 
 
461 aa  58.5  0.00000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2771  hypothetical protein  36.25 
 
 
318 aa  58.2  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2474  protein of unknown function DUF1568  34.12 
 
 
224 aa  56.6  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000403207  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1620  hypothetical protein  38.81 
 
 
313 aa  56.6  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3632  hypothetical protein  32.58 
 
 
316 aa  56.6  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.108416  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2396  hypothetical protein  35.71 
 
 
220 aa  56.2  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0950  hypothetical protein  33.33 
 
 
321 aa  56.2  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000190963  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2885  hypothetical protein  38.81 
 
 
98 aa  55.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3926  hypothetical protein  30.68 
 
 
322 aa  55.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3049  transposase and inactivated derivatives  29.55 
 
 
226 aa  55.1  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0722  protein of unknown function DUF1568  35.63 
 
 
321 aa  54.3  0.0000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.645218  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2247  hypothetical protein  35.9 
 
 
101 aa  53.5  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1032  protein of unknown function DUF1568  29.76 
 
 
326 aa  52.8  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3020  hypothetical protein  30.61 
 
 
316 aa  52.4  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5382  hypothetical protein  30.68 
 
 
223 aa  52.8  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564815  normal  0.588654 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2218  hypothetical protein  35.9 
 
 
327 aa  52  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00293328  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0793  hypothetical protein  30.61 
 
 
314 aa  51.6  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2336  protein of unknown function DUF1568  31.03 
 
 
324 aa  51.2  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2216  hypothetical protein  35.82 
 
 
72 aa  51.2  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.136455  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2086  hypothetical protein  30.68 
 
 
321 aa  50.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.464464  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1319  protein of unknown function DUF1568  33.33 
 
 
319 aa  50.1  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0490388  hitchhiker  0.00690567 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1484  hypothetical protein  32.5 
 
 
295 aa  49.7  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2131  hypothetical protein  33.75 
 
 
333 aa  49.7  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.132605  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0397  protein of unknown function DUF1568  37.5 
 
 
304 aa  49.7  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000164254  normal  0.853679 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3016  hypothetical protein  30.3 
 
 
312 aa  49.7  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0167  hypothetical protein  35.38 
 
 
101 aa  49.3  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1748  hypothetical protein  29.29 
 
 
312 aa  49.3  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.994794  normal  0.0128416 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1392  hypothetical protein  33.75 
 
 
320 aa  48.9  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2205  hypothetical protein  31.03 
 
 
160 aa  48.9  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2224  hypothetical protein  31.03 
 
 
112 aa  48.9  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00479916  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1701  hypothetical protein  34.38 
 
 
174 aa  49.3  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0859  protein of unknown function DUF1568  32.94 
 
 
238 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.682505  normal  0.123586 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0741  protein of unknown function DUF1568  33.77 
 
 
97 aa  48.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.117883  normal  0.0672697 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1423  protein of unknown function DUF1568  32.5 
 
 
325 aa  47.4  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.892865 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2264  transposase and inactivated derivatives  27.27 
 
 
323 aa  47.8  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.88974  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1487  hypothetical protein  32.5 
 
 
323 aa  47.8  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1578  hypothetical protein  32.18 
 
 
316 aa  47.4  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000706252  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0845  hypothetical protein  31.51 
 
 
334 aa  47.4  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1782  protein of unknown function DUF1568  31.87 
 
 
325 aa  47  0.00008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0188832 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0954  hypothetical protein  33.85 
 
 
326 aa  46.2  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.729066  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1506  protein of unknown function DUF1568  31.03 
 
 
321 aa  46.6  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0595  hypothetical protein  32.18 
 
 
258 aa  46.6  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.217159  hitchhiker  2.03187e-17 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2204  hypothetical protein  31.03 
 
 
327 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2454  protein of unknown function DUF1568  32.18 
 
 
321 aa  46.2  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000257297  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2233  hypothetical protein  31.03 
 
 
321 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2237  hypothetical protein  31.03 
 
 
321 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>