137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2216 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2218  hypothetical protein  100 
 
 
327 aa  153  6e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00293328  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2216  hypothetical protein  100 
 
 
72 aa  148  2e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.136455  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2247  hypothetical protein  97.18 
 
 
101 aa  146  9e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1423  protein of unknown function DUF1568  77.46 
 
 
325 aa  119  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.892865 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1484  hypothetical protein  76.06 
 
 
295 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1487  hypothetical protein  76.06 
 
 
323 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1256  protein of unknown function DUF1568  73.24 
 
 
321 aa  114  3e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0072967  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2333  protein of unknown function DUF1568  76.06 
 
 
324 aa  114  3.9999999999999997e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0722  protein of unknown function DUF1568  73.24 
 
 
321 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.645218  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1319  protein of unknown function DUF1568  73.24 
 
 
319 aa  108  2.0000000000000002e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0490388  hitchhiker  0.00690567 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1386  protein of unknown function DUF1568  64.79 
 
 
325 aa  108  2.0000000000000002e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2253  hypothetical protein  98.11 
 
 
53 aa  108  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.353665  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1104  methionine-R-sulfoxide reductase  70.42 
 
 
506 aa  108  3e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000471642  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1506  protein of unknown function DUF1568  70.42 
 
 
321 aa  106  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2336  protein of unknown function DUF1568  67.61 
 
 
324 aa  105  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1425  hypothetical protein  70.42 
 
 
321 aa  104  4e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1427  hypothetical protein  70.42 
 
 
321 aa  104  5e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2204  hypothetical protein  69.01 
 
 
327 aa  104  5e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2233  hypothetical protein  69.01 
 
 
321 aa  104  5e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2246  hypothetical protein  69.01 
 
 
321 aa  104  5e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2237  hypothetical protein  69.01 
 
 
321 aa  103  6e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2205  hypothetical protein  69.01 
 
 
160 aa  103  9e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2224  hypothetical protein  69.01 
 
 
112 aa  102  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00479916  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2223  hypothetical protein  98 
 
 
70 aa  102  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00126259  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0925  protein of unknown function DUF1568  64.79 
 
 
336 aa  102  2e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1392  hypothetical protein  63.38 
 
 
320 aa  102  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2213  hypothetical protein  67.61 
 
 
321 aa  101  4e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.809495  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1356  protein of unknown function DUF1568  67.61 
 
 
321 aa  100  5e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0875577  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2207  hypothetical protein  67.61 
 
 
81 aa  100  6e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1578  hypothetical protein  67.61 
 
 
316 aa  99.8  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000706252  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2131  hypothetical protein  63.38 
 
 
333 aa  98.6  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.132605  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2454  protein of unknown function DUF1568  69.01 
 
 
321 aa  99.4  2e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000257297  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0741  protein of unknown function DUF1568  63.38 
 
 
97 aa  97.1  7e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.117883  normal  0.0672697 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1929  protein of unknown function DUF1568  66.2 
 
 
321 aa  96.3  1e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1782  protein of unknown function DUF1568  61.97 
 
 
325 aa  94.4  5e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0188832 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0167  hypothetical protein  58.46 
 
 
101 aa  89.7  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2643  transposase domain-containing protein  53.62 
 
 
335 aa  89.4  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0793  hypothetical protein  57.75 
 
 
335 aa  89.4  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000261863  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0845  hypothetical protein  53.62 
 
 
334 aa  86.3  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1084  transposase and inactivated derivatives  52.17 
 
 
338 aa  85.9  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2215  hypothetical protein  84.78 
 
 
66 aa  85.5  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.29673  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0844  hypothetical protein  51.47 
 
 
340 aa  82  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1423  protein of unknown function DUF1568  50.72 
 
 
180 aa  81.3  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.7985800000000005e-18 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2207  protein of unknown function DUF1568  48.57 
 
 
323 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.45311e-16 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1785  hypothetical protein  47.89 
 
 
264 aa  72.8  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0954  hypothetical protein  46.97 
 
 
326 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.729066  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1791  transposase and inactivated derivatives  57.58 
 
 
323 aa  71.2  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1503  hypothetical protein  72.73 
 
 
112 aa  70.1  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0255  hypothetical protein  93.75 
 
 
288 aa  67  0.00000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0724188  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0033  hypothetical protein  38.81 
 
 
235 aa  64.7  0.0000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0324  protein of unknown function DUF1568  43.28 
 
 
252 aa  62  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.551772  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0719  protein of unknown function DUF1568  73.68 
 
 
81 aa  61.2  0.000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.146738  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4538  protein of unknown function DUF1568  36.23 
 
 
251 aa  59.7  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0855967  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2238  hypothetical protein  63.64 
 
 
70 aa  60.1  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0950  hypothetical protein  42.86 
 
 
321 aa  60.1  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000190963  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0770  protein of unknown function DUF1568  42.03 
 
 
316 aa  58.9  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.717082  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2188  hypothetical protein  83.87 
 
 
65 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1055  transposase  39.13 
 
 
250 aa  58.5  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2771  hypothetical protein  40.58 
 
 
318 aa  57.4  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0793  hypothetical protein  37.31 
 
 
314 aa  57.4  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2050  protein of unknown function DUF1568  37.68 
 
 
336 aa  57  0.00000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.633564  normal  0.705399 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1748  hypothetical protein  35.82 
 
 
312 aa  56.6  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.994794  normal  0.0128416 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3020  hypothetical protein  37.31 
 
 
316 aa  55.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3016  hypothetical protein  34.33 
 
 
312 aa  55.1  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3037  protein of unknown function DUF1568  36.76 
 
 
315 aa  55.1  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3049  transposase and inactivated derivatives  35.38 
 
 
226 aa  52  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1620  hypothetical protein  38.24 
 
 
313 aa  52  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0996  protein of unknown function DUF1568  35.21 
 
 
216 aa  52  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.976226  normal  0.164778 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0267  transposase and inactivated derivatives  35.82 
 
 
104 aa  51.2  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0203  hypothetical protein  38.81 
 
 
288 aa  51.2  0.000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0207  hypothetical protein  38.81 
 
 
288 aa  51.2  0.000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3871  protein of unknown function DUF1568  40.62 
 
 
236 aa  50.4  0.000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0093  hypothetical protein  36.92 
 
 
234 aa  50.4  0.000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150021  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2885  hypothetical protein  36.76 
 
 
98 aa  50.8  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2793  transposase-like p;rotein  35.29 
 
 
165 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0201  hypothetical protein  37.31 
 
 
288 aa  49.7  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1558  protein of unknown function DUF1568  33.33 
 
 
230 aa  50.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.55731 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0477  hypothetical protein  37.31 
 
 
232 aa  50.1  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2192  hypothetical protein  32.35 
 
 
253 aa  49.7  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107555  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2198  transposase  32.35 
 
 
253 aa  49.7  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1552  protein of unknown function DUF1568  33.33 
 
 
230 aa  50.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.268269 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1484  hypothetical protein  30.77 
 
 
231 aa  49.7  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1151  protein of unknown function DUF1568  40.62 
 
 
231 aa  49.7  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1554  protein of unknown function DUF1568  33.33 
 
 
230 aa  49.7  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.335003 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2878  protein of unknown function DUF1568  33.33 
 
 
287 aa  48.9  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1556  protein of unknown function DUF1568  33.33 
 
 
230 aa  49.7  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.444415 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1007  hypothetical protein  37.5 
 
 
234 aa  48.9  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.849512  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0682  hypothetical protein  37.5 
 
 
232 aa  49.3  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.349284  normal  0.584525 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2394  hypothetical protein  38.24 
 
 
239 aa  49.3  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.419691  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2086  hypothetical protein  32.84 
 
 
321 aa  48.9  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.464464  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1724  hypothetical protein  36.23 
 
 
248 aa  48.5  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1725  hypothetical protein  36.23 
 
 
248 aa  48.5  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0595  hypothetical protein  31.82 
 
 
258 aa  48.1  0.00004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.217159  hitchhiker  2.03187e-17 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1356  hypothetical protein  33.33 
 
 
319 aa  47.8  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.895893  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0136  transposase  40 
 
 
236 aa  47.4  0.00006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3508  hypothetical protein  35.94 
 
 
75 aa  47.4  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01210  transposase  31.88 
 
 
245 aa  47.4  0.00007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1032  protein of unknown function DUF1568  34.33 
 
 
326 aa  47.4  0.00007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2932  hypothetical protein  37.5 
 
 
234 aa  47  0.00009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.56667  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1406  protein of unknown function DUF1568  31.34 
 
 
289 aa  46.2  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>