53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2215 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2215  hypothetical protein  100 
 
 
66 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.29673  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2223  hypothetical protein  78.57 
 
 
70 aa  88.6  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00126259  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2218  hypothetical protein  84.78 
 
 
327 aa  87  7e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00293328  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2247  hypothetical protein  84.78 
 
 
101 aa  86.3  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2253  hypothetical protein  86.96 
 
 
53 aa  85.9  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.353665  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2216  hypothetical protein  84.78 
 
 
72 aa  85.5  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.136455  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1423  protein of unknown function DUF1568  69.39 
 
 
325 aa  75.1  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.892865 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1484  hypothetical protein  67.35 
 
 
295 aa  71.2  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1487  hypothetical protein  67.35 
 
 
323 aa  71.6  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2454  protein of unknown function DUF1568  68.75 
 
 
321 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000257297  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0722  protein of unknown function DUF1568  64.58 
 
 
321 aa  67.8  0.00000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.645218  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1578  hypothetical protein  66.67 
 
 
316 aa  66.6  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000706252  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2333  protein of unknown function DUF1568  72.5 
 
 
324 aa  64.3  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1506  protein of unknown function DUF1568  67.5 
 
 
321 aa  63.9  0.0000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1386  protein of unknown function DUF1568  59.18 
 
 
325 aa  63.2  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1427  hypothetical protein  62.22 
 
 
321 aa  62.8  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1425  hypothetical protein  62.22 
 
 
321 aa  62.8  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2336  protein of unknown function DUF1568  63.64 
 
 
324 aa  62.8  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1104  methionine-R-sulfoxide reductase  63.27 
 
 
506 aa  62.4  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000471642  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1256  protein of unknown function DUF1568  60 
 
 
321 aa  62  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0072967  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0925  protein of unknown function DUF1568  59.18 
 
 
336 aa  61.2  0.000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0741  protein of unknown function DUF1568  56.52 
 
 
97 aa  60.8  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.117883  normal  0.0672697 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1929  protein of unknown function DUF1568  61.36 
 
 
321 aa  60.5  0.000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2233  hypothetical protein  65 
 
 
321 aa  60.5  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2246  hypothetical protein  65 
 
 
321 aa  60.5  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2188  hypothetical protein  77.14 
 
 
65 aa  60.5  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1319  protein of unknown function DUF1568  64.58 
 
 
319 aa  60.5  0.000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0490388  hitchhiker  0.00690567 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2237  hypothetical protein  65 
 
 
321 aa  60.5  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1392  hypothetical protein  56 
 
 
320 aa  60.5  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2204  hypothetical protein  65 
 
 
327 aa  60.5  0.000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0719  protein of unknown function DUF1568  52.24 
 
 
81 aa  60.1  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.146738  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2224  hypothetical protein  65 
 
 
112 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00479916  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2205  hypothetical protein  65 
 
 
160 aa  60.1  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0167  hypothetical protein  55.1 
 
 
101 aa  59.7  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1356  protein of unknown function DUF1568  62.5 
 
 
321 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0875577  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2213  hypothetical protein  62.5 
 
 
321 aa  57.8  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.809495  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1782  protein of unknown function DUF1568  56.82 
 
 
325 aa  57.8  0.00000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0188832 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2643  transposase domain-containing protein  55.81 
 
 
335 aa  57.4  0.00000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2207  hypothetical protein  62.5 
 
 
81 aa  57  0.00000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0845  hypothetical protein  55.81 
 
 
334 aa  55.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2238  hypothetical protein  62.5 
 
 
70 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1423  protein of unknown function DUF1568  48 
 
 
180 aa  55.5  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.7985800000000005e-18 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0793  hypothetical protein  55.81 
 
 
335 aa  54.7  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000261863  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2131  hypothetical protein  50 
 
 
333 aa  54.7  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.132605  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1084  transposase and inactivated derivatives  48 
 
 
338 aa  55.1  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0844  hypothetical protein  52.5 
 
 
340 aa  52  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2207  protein of unknown function DUF1568  47.83 
 
 
323 aa  50.4  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.45311e-16 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0954  hypothetical protein  46.51 
 
 
326 aa  47.4  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.729066  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1791  transposase and inactivated derivatives  66.67 
 
 
323 aa  47  0.00009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0950  hypothetical protein  50 
 
 
321 aa  45.1  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000190963  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0770  protein of unknown function DUF1568  48.78 
 
 
316 aa  42  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.717082  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1785  hypothetical protein  44.19 
 
 
264 aa  41.6  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0033  hypothetical protein  41.3 
 
 
235 aa  41.2  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>