58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2238 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2238  hypothetical protein  100 
 
 
70 aa  143  9e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2205  hypothetical protein  90.2 
 
 
160 aa  95.1  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2246  hypothetical protein  90.2 
 
 
321 aa  95.1  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2237  hypothetical protein  90.2 
 
 
321 aa  95.1  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2233  hypothetical protein  90.2 
 
 
321 aa  95.1  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2204  hypothetical protein  90.2 
 
 
327 aa  94.7  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2224  hypothetical protein  90.2 
 
 
112 aa  94  6e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00479916  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1356  protein of unknown function DUF1568  86.27 
 
 
321 aa  92.4  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0875577  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2213  hypothetical protein  88.24 
 
 
321 aa  91.7  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.809495  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2207  hypothetical protein  88.24 
 
 
81 aa  91.3  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1506  protein of unknown function DUF1568  82.35 
 
 
321 aa  89  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2454  protein of unknown function DUF1568  72.55 
 
 
321 aa  80.9  0.000000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000257297  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1427  hypothetical protein  72.55 
 
 
321 aa  78.6  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1425  hypothetical protein  72.55 
 
 
321 aa  78.6  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0741  protein of unknown function DUF1568  66.67 
 
 
97 aa  74.7  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.117883  normal  0.0672697 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1319  protein of unknown function DUF1568  68.63 
 
 
319 aa  74.7  0.0000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0490388  hitchhiker  0.00690567 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1578  hypothetical protein  68.63 
 
 
316 aa  74.3  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000706252  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0722  protein of unknown function DUF1568  68.63 
 
 
321 aa  73.2  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.645218  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1256  protein of unknown function DUF1568  66.67 
 
 
321 aa  72  0.000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0072967  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1929  protein of unknown function DUF1568  68.09 
 
 
321 aa  71.6  0.000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1487  hypothetical protein  64.71 
 
 
323 aa  69.3  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1104  methionine-R-sulfoxide reductase  70.21 
 
 
506 aa  68.6  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000471642  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2336  protein of unknown function DUF1568  58.33 
 
 
324 aa  67.8  0.00000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1484  hypothetical protein  68.09 
 
 
295 aa  67  0.00000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1782  protein of unknown function DUF1568  63.83 
 
 
325 aa  66.6  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0188832 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1392  hypothetical protein  61.7 
 
 
320 aa  66.6  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1423  protein of unknown function DUF1568  65.96 
 
 
325 aa  66.6  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.892865 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2333  protein of unknown function DUF1568  63.83 
 
 
324 aa  66.6  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0925  protein of unknown function DUF1568  52.63 
 
 
336 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0844  hypothetical protein  59.57 
 
 
340 aa  65.9  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2247  hypothetical protein  65.91 
 
 
101 aa  61.2  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2218  hypothetical protein  63.64 
 
 
327 aa  60.5  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00293328  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2223  hypothetical protein  63.64 
 
 
70 aa  60.5  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00126259  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1386  protein of unknown function DUF1568  59.09 
 
 
325 aa  60.5  0.000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2216  hypothetical protein  63.64 
 
 
72 aa  60.1  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.136455  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2253  hypothetical protein  63.64 
 
 
53 aa  59.7  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.353665  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2131  hypothetical protein  57.45 
 
 
333 aa  58.9  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.132605  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0719  protein of unknown function DUF1568  67.57 
 
 
81 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.146738  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1084  transposase and inactivated derivatives  54.17 
 
 
338 aa  57.8  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0845  hypothetical protein  62.79 
 
 
334 aa  57.4  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2643  transposase domain-containing protein  54.17 
 
 
335 aa  57  0.00000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2215  hypothetical protein  62.5 
 
 
66 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.29673  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1423  protein of unknown function DUF1568  55.32 
 
 
180 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.7985800000000005e-18 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2207  protein of unknown function DUF1568  53.06 
 
 
323 aa  55.5  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.45311e-16 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0793  hypothetical protein  49.02 
 
 
335 aa  55.1  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000261863  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0167  hypothetical protein  55.32 
 
 
101 aa  55.1  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1785  hypothetical protein  60.47 
 
 
264 aa  53.5  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0954  hypothetical protein  57.5 
 
 
326 aa  51.2  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.729066  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2180  hypothetical protein  76.67 
 
 
91 aa  49.7  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1791  transposase and inactivated derivatives  70 
 
 
323 aa  47  0.00009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2878  protein of unknown function DUF1568  48.65 
 
 
287 aa  44.3  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0324  protein of unknown function DUF1568  40 
 
 
252 aa  43.1  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.551772  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2188  hypothetical protein  60 
 
 
65 aa  41.6  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3871  protein of unknown function DUF1568  54.05 
 
 
236 aa  41.6  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3049  transposase and inactivated derivatives  45 
 
 
226 aa  41.6  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2878  protein of unknown function DUF1568  44.44 
 
 
289 aa  41.6  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000473385 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0033  hypothetical protein  43.9 
 
 
235 aa  41.2  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0996  protein of unknown function DUF1568  47.37 
 
 
216 aa  40  0.01  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.976226  normal  0.164778 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>