227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0722 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0722  protein of unknown function DUF1568  100 
 
 		 321 aa  656    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.645218  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1425  hypothetical protein  77.57 
 
 		 321 aa  521  1e-147  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1427  hypothetical protein  78.19 
 
 		 321 aa  523  1e-147  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1506  protein of unknown function DUF1568  70.09 
 
 		 321 aa  482  1e-135  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2454  protein of unknown function DUF1568  72.59 
 
 		 321 aa  477  1e-133  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000257297  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2233  hypothetical protein  69.91 
 
 		 321 aa  468  1.0000000000000001e-131  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2246  hypothetical protein  69.91 
 
 		 321 aa  468  1.0000000000000001e-131  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1319  protein of unknown function DUF1568  71.16 
 
 		 319 aa  466  9.999999999999999e-131  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0490388  hitchhiker  0.00690567 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2213  hypothetical protein  69.16 
 
 		 321 aa  465  9.999999999999999e-131  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.809495  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2237  hypothetical protein  69.59 
 
 		 321 aa  464  9.999999999999999e-131  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1356  protein of unknown function DUF1568  69.47 
 
 		 321 aa  467  9.999999999999999e-131  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0875577  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2204  hypothetical protein  69.87 
 
 		 327 aa  456  1e-127  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1929  protein of unknown function DUF1568  66.46 
 
 		 321 aa  451  1.0000000000000001e-126  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1578  hypothetical protein  68.34 
 
 		 316 aa  437  1e-121  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000706252  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2333  protein of unknown function DUF1568  59.19 
 
 		 324 aa  396  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2336  protein of unknown function DUF1568  58.57 
 
 		 324 aa  390  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1256  protein of unknown function DUF1568  58.81 
 
 		 321 aa  385  1e-106  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0072967  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1423  protein of unknown function DUF1568  57.99 
 
 		 325 aa  375  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.892865 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1487  hypothetical protein  57.37 
 
 		 323 aa  373  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1782  protein of unknown function DUF1568  55.17 
 
 		 325 aa  368  1e-101  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0188832 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2218  hypothetical protein  56.11 
 
 		 327 aa  368  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00293328  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1104  methionine-R-sulfoxide reductase  55.8 
 
 		 506 aa  371  1e-101  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000471642  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0925  protein of unknown function DUF1568  55.03 
 
 		 336 aa  369  1e-101  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1386  protein of unknown function DUF1568  55.41 
 
 		 325 aa  358  5e-98  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1484  hypothetical protein  59.32 
 
 		 295 aa  357  9.999999999999999e-98  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1392  hypothetical protein  54.23 
 
 		 320 aa  356  2.9999999999999997e-97  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2131  hypothetical protein  54.23 
 
 		 333 aa  350  2e-95  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.132605  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0255  hypothetical protein  53.02 
 
 		 288 aa  297  2e-79  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0724188  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2643  transposase domain-containing protein  47.35 
 
 		 335 aa  273  3e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0793  hypothetical protein  44.79 
 
 		 335 aa  265  5e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000261863  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1084  transposase and inactivated derivatives  44.2 
 
 		 338 aa  265  1e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0844  hypothetical protein  43.57 
 
 		 340 aa  260  3e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2205  hypothetical protein  79.47 
 
 		 160 aa  259  4e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0845  hypothetical protein  41.07 
 
 		 334 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2207  protein of unknown function DUF1568  38.64 
 
 		 323 aa  211  2e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.45311e-16 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1791  transposase and inactivated derivatives  41.9 
 
 		 323 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0954  hypothetical protein  36.83 
 
 		 326 aa  189  7e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.729066  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1423  protein of unknown function DUF1568  53.49 
 
 		 180 aa  181  2e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.7985800000000005e-18 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2224  hypothetical protein  79.8 
 
 		 112 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00479916  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0770  protein of unknown function DUF1568  32.8 
 
 		 316 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.717082  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2771  hypothetical protein  34.22 
 
 		 318 aa  149  5e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0950  hypothetical protein  34.54 
 
 		 321 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000190963  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0793  hypothetical protein  32.92 
 
 		 314 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1356  hypothetical protein  32.81 
 
 		 319 aa  142  9.999999999999999e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.895893  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1620  hypothetical protein  35.47 
 
 		 313 aa  140  3e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0922  protein of unknown function DUF1568  40.94 
 
 		 176 aa  139  6e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3020  hypothetical protein  32.34 
 
 		 316 aa  136  6.0000000000000005e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3632  hypothetical protein  30.7 
 
 		 316 aa  134  3e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.108416  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2247  hypothetical protein  70.33 
 
 		 101 aa  133  3e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3037  protein of unknown function DUF1568  31.41 
 
 		 315 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0741  protein of unknown function DUF1568  73.81 
 
 		 97 aa  132  5e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.117883  normal  0.0672697 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1967  hypothetical protein  30.75 
 
 		 282 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.969925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4538  protein of unknown function DUF1568  39.56 
 
 		 251 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0855967  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3016  hypothetical protein  37.1 
 
 		 312 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1966  hypothetical protein  30.12 
 
 		 305 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.527692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0324  protein of unknown function DUF1568  37.87 
 
 		 252 aa  123  5e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.551772  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2207  hypothetical protein  74.36 
 
 		 81 aa  122  6e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1748  hypothetical protein  32.26 
 
 		 312 aa  119  4.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.994794  normal  0.0128416 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1032  protein of unknown function DUF1568  33.64 
 
 		 326 aa  119  7.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2050  protein of unknown function DUF1568  36.92 
 
 		 336 aa  119  9e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.633564  normal  0.705399 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0167  hypothetical protein  57.43 
 
 		 101 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1055  transposase  42.76 
 
 		 250 aa  118  9.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1813  protein of unknown function DUF1568  38.17 
 
 		 277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00112655  hitchhiker  0.00000000103135 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2086  hypothetical protein  29.25 
 
 		 321 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.464464  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2192  hypothetical protein  30.22 
 
 		 253 aa  113  4.0000000000000004e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107555  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0207  hypothetical protein  35.14 
 
 		 288 aa  112  8.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0203  hypothetical protein  35.14 
 
 		 288 aa  112  9e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2198  transposase  29.67 
 
 		 253 aa  112  9e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1007  hypothetical protein  41.78 
 
 		 234 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.849512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3926  hypothetical protein  30.17 
 
 		 322 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0201  hypothetical protein  34.59 
 
 		 288 aa  110  3e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2394  hypothetical protein  34.3 
 
 		 239 aa  110  3e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.419691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2265  transposase and inactivated derivatives  31.36 
 
 		 241 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0148  transposase  34.83 
 
 		 236 aa  109  5e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0526667  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2216  hypothetical protein  73.24 
 
 		 72 aa  109  7.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.136455  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12790  transposase  40.15 
 
 		 241 aa  108  8.000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2878  protein of unknown function DUF1568  28.4 
 
 		 289 aa  108  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000473385 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2264  transposase and inactivated derivatives  30.91 
 
 		 323 aa  107  3e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.88974  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1406  protein of unknown function DUF1568  30.35 
 
 		 289 aa  107  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0136  transposase  34.97 
 
 		 236 aa  107  4e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0682  hypothetical protein  31.4 
 
 		 232 aa  107  4e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.349284  normal  0.584525 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0033  hypothetical protein  39.31 
 
 		 235 aa  106  5e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2878  protein of unknown function DUF1568  32.79 
 
 		 287 aa  106  6e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0164  transposase  32.14 
 
 		 287 aa  106  6e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0743928  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1724  hypothetical protein  40.46 
 
 		 248 aa  105  1e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1725  hypothetical protein  40.46 
 
 		 248 aa  105  1e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0477  hypothetical protein  32.42 
 
 		 232 aa  105  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0595  hypothetical protein  32.1 
 
 		 258 aa  105  1e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.217159  hitchhiker  2.03187e-17 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1151  protein of unknown function DUF1568  39.31 
 
 		 231 aa  104  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2932  hypothetical protein  32.66 
 
 		 234 aa  103  6e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.56667  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3871  protein of unknown function DUF1568  37.5 
 
 		 236 aa  99.8  6e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01210  transposase  32.8 
 
 		 245 aa  99.8  6e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2793  transposase-like p;rotein  34.57 
 
 		 165 aa  99.4  7e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1484  hypothetical protein  36.62 
 
 		 231 aa  98.6  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0790  hypothetical protein  30.45 
 
 		 232 aa  97.4  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.513436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1552  protein of unknown function DUF1568  33.33 
 
 		 230 aa  96.7  5e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.268269 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0489  hypothetical protein  32.85 
 
 		 310 aa  96.7  5e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.448467 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4446  hypothetical protein  28.57 
 
 		 236 aa  96.3  7e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.885807  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1802  protein of unknown function DUF1568  37.25 
 
 		 240 aa  95.5  9e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1872  hypothetical protein  35.42 
 
 		 277 aa  95.1  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>