222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0925 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0925  protein of unknown function DUF1568  100 
 
 		 336 aa  689    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1487  hypothetical protein  75.94 
 
 		 323 aa  503  1e-141  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1423  protein of unknown function DUF1568  74.06 
 
 		 325 aa  492  9.999999999999999e-139  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.892865 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1256  protein of unknown function DUF1568  71.88 
 
 		 321 aa  485  1e-136  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0072967  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1484  hypothetical protein  75.93 
 
 		 295 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1386  protein of unknown function DUF1568  66.36 
 
 		 325 aa  452  1.0000000000000001e-126  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1104  methionine-R-sulfoxide reductase  65 
 
 		 506 aa  440  9.999999999999999e-123  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000471642  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1392  hypothetical protein  61.88 
 
 		 320 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2218  hypothetical protein  60.06 
 
 		 327 aa  400  9.999999999999999e-111  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00293328  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2131  hypothetical protein  59.06 
 
 		 333 aa  384  1e-105  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.132605  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0722  protein of unknown function DUF1568  55.03 
 
 		 321 aa  369  1e-101  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.645218  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2336  protein of unknown function DUF1568  52.16 
 
 		 324 aa  366  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1506  protein of unknown function DUF1568  53.77 
 
 		 321 aa  359  4e-98  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2333  protein of unknown function DUF1568  53.09 
 
 		 324 aa  358  9.999999999999999e-98  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2454  protein of unknown function DUF1568  54.4 
 
 		 321 aa  356  2.9999999999999997e-97  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000257297  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1427  hypothetical protein  52.52 
 
 		 321 aa  355  5.999999999999999e-97  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1425  hypothetical protein  52.2 
 
 		 321 aa  353  2e-96  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1929  protein of unknown function DUF1568  52.17 
 
 		 321 aa  351  1e-95  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1319  protein of unknown function DUF1568  51.89 
 
 		 319 aa  347  2e-94  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0490388  hitchhiker  0.00690567 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2233  hypothetical protein  52.52 
 
 		 321 aa  345  4e-94  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2246  hypothetical protein  52.52 
 
 		 321 aa  345  4e-94  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1356  protein of unknown function DUF1568  52.2 
 
 		 321 aa  344  2e-93  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0875577  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2204  hypothetical protein  53.21 
 
 		 327 aa  343  4e-93  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2237  hypothetical protein  52.2 
 
 		 321 aa  342  4e-93  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2213  hypothetical protein  52.17 
 
 		 321 aa  342  5.999999999999999e-93  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.809495  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0255  hypothetical protein  59.14 
 
 		 288 aa  337  9.999999999999999e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0724188  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1782  protein of unknown function DUF1568  48.3 
 
 		 325 aa  317  2e-85  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0188832 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1578  hypothetical protein  49.53 
 
 		 316 aa  311  1e-83  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000706252  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0922  protein of unknown function DUF1568  87.5 
 
 		 176 aa  311  1e-83  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1084  transposase and inactivated derivatives  45.31 
 
 		 338 aa  290  2e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0844  hypothetical protein  44.94 
 
 		 340 aa  280  4e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2643  transposase domain-containing protein  44.89 
 
 		 335 aa  279  4e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0793  hypothetical protein  42.19 
 
 		 335 aa  253  3e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000261863  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0845  hypothetical protein  45.22 
 
 		 334 aa  246  3e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2207  protein of unknown function DUF1568  42.67 
 
 		 323 aa  239  5e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.45311e-16 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1791  transposase and inactivated derivatives  43.98 
 
 		 323 aa  223  4e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2205  hypothetical protein  64.9 
 
 		 160 aa  220  3e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0954  hypothetical protein  42.04 
 
 		 326 aa  218  1e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.729066  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1423  protein of unknown function DUF1568  50.89 
 
 		 180 aa  177  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.7985800000000005e-18 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0770  protein of unknown function DUF1568  29.63 
 
 		 316 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.717082  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1356  hypothetical protein  33.1 
 
 		 319 aa  145  8.000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.895893  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3016  hypothetical protein  34.26 
 
 		 312 aa  144  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2771  hypothetical protein  34.34 
 
 		 318 aa  144  3e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0793  hypothetical protein  34.78 
 
 		 314 aa  142  6e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2224  hypothetical protein  60.95 
 
 		 112 aa  142  9.999999999999999e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00479916  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3020  hypothetical protein  31.17 
 
 		 316 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1620  hypothetical protein  31.93 
 
 		 313 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0950  hypothetical protein  31.7 
 
 		 321 aa  133  5e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000190963  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2247  hypothetical protein  65.93 
 
 		 101 aa  132  6.999999999999999e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3037  protein of unknown function DUF1568  29.79 
 
 		 315 aa  132  7.999999999999999e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1785  hypothetical protein  33.33 
 
 		 264 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1748  hypothetical protein  32.96 
 
 		 312 aa  129  7.000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.994794  normal  0.0128416 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3632  hypothetical protein  30 
 
 		 316 aa  122  7e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.108416  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1967  hypothetical protein  37.02 
 
 		 282 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.969925  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0207  hypothetical protein  37.88 
 
 		 288 aa  120  3e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2265  transposase and inactivated derivatives  34.55 
 
 		 241 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1966  hypothetical protein  37.02 
 
 		 305 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.527692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2264  transposase and inactivated derivatives  29.75 
 
 		 323 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.88974  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0595  hypothetical protein  27.94 
 
 		 258 aa  119  6e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.217159  hitchhiker  2.03187e-17 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1032  protein of unknown function DUF1568  33.64 
 
 		 326 aa  119  7e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2192  hypothetical protein  31.15 
 
 		 253 aa  119  7.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107555  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0203  hypothetical protein  36.79 
 
 		 288 aa  118  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2198  transposase  31.15 
 
 		 253 aa  118  1.9999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2050  protein of unknown function DUF1568  38.82 
 
 		 336 aa  117  3e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.633564  normal  0.705399 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4538  protein of unknown function DUF1568  33.15 
 
 		 251 aa  117  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0855967  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0167  hypothetical protein  55.45 
 
 		 101 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0201  hypothetical protein  36.27 
 
 		 288 aa  116  5e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1055  transposase  37.04 
 
 		 250 aa  115  6.9999999999999995e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0741  protein of unknown function DUF1568  61.9 
 
 		 97 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.117883  normal  0.0672697 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0148  transposase  32.82 
 
 		 236 aa  111  1.0000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0526667  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0136  transposase  35.12 
 
 		 236 aa  111  2.0000000000000002e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0164  transposase  32.98 
 
 		 287 aa  110  4.0000000000000004e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0743928  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1813  protein of unknown function DUF1568  36.32 
 
 		 277 aa  110  5e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00112655  hitchhiker  0.00000000103135 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3926  hypothetical protein  29.02 
 
 		 322 aa  109  5e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12790  transposase  37.88 
 
 		 241 aa  108  1e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2086  hypothetical protein  35.48 
 
 		 321 aa  107  3e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.464464  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1406  protein of unknown function DUF1568  33.33 
 
 		 289 aa  106  5e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2207  hypothetical protein  62.82 
 
 		 81 aa  105  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2878  protein of unknown function DUF1568  27.58 
 
 		 287 aa  104  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2878  protein of unknown function DUF1568  32.26 
 
 		 289 aa  104  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000473385 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0033  hypothetical protein  39.73 
 
 		 235 aa  103  3e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2394  hypothetical protein  32.03 
 
 		 239 aa  102  9e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.419691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2216  hypothetical protein  64.79 
 
 		 72 aa  102  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.136455  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1872  hypothetical protein  31.22 
 
 		 277 aa  99.8  5e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0324  protein of unknown function DUF1568  35.56 
 
 		 252 aa  99.8  6e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.551772  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1151  protein of unknown function DUF1568  36.13 
 
 		 231 aa  99.4  8e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0682  hypothetical protein  30.86 
 
 		 232 aa  97.1  4e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.349284  normal  0.584525 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01210  transposase  34.51 
 
 		 245 aa  97.1  4e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3049  transposase and inactivated derivatives  36.99 
 
 		 226 aa  95.9  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1007  hypothetical protein  38.26 
 
 		 234 aa  95.1  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.849512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2793  transposase-like p;rotein  35.03 
 
 		 165 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3871  protein of unknown function DUF1568  28.81 
 
 		 236 aa  94  3e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0397  protein of unknown function DUF1568  32.21 
 
 		 304 aa  93.6  4e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000164254  normal  0.853679 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1484  hypothetical protein  33.1 
 
 		 231 aa  90.5  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0477  hypothetical protein  31.52 
 
 		 232 aa  90.9  3e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0489  hypothetical protein  30.56 
 
 		 310 aa  90.5  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.448467 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3248  protein of unknown function DUF1568  29.67 
 
 		 181 aa  88.6  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00178625  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1725  hypothetical protein  26.89 
 
 		 248 aa  88.2  2e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3078  protein of unknown function DUF1568  30.22 
 
 		 190 aa  87.8  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0996  protein of unknown function DUF1568  34.48 
 
 		 216 aa  88.2  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.976226  normal  0.164778 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>