249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2878 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2878  protein of unknown function DUF1568  100 
 
 		 289 aa  608  1e-173  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000473385 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1406  protein of unknown function DUF1568  94.12 
 
 		 289 aa  577  1.0000000000000001e-163  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2878  protein of unknown function DUF1568  66.9 
 
 		 287 aa  421  1e-117  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1966  hypothetical protein  48.01 
 
 		 305 aa  287  1e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.527692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1967  hypothetical protein  47.65 
 
 		 282 aa  286  2e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.969925  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0207  hypothetical protein  43.84 
 
 		 288 aa  262  6e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0203  hypothetical protein  43.54 
 
 		 288 aa  261  8.999999999999999e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0201  hypothetical protein  43.2 
 
 		 288 aa  259  3e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1813  protein of unknown function DUF1568  45.26 
 
 		 277 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00112655  hitchhiker  0.00000000103135 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0793  hypothetical protein  42.2 
 
 		 314 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3020  hypothetical protein  41.75 
 
 		 316 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3016  hypothetical protein  44.58 
 
 		 312 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1748  hypothetical protein  45.11 
 
 		 312 aa  197  1.0000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.994794  normal  0.0128416 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2264  transposase and inactivated derivatives  39.5 
 
 		 323 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.88974  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2265  transposase and inactivated derivatives  39.5 
 
 		 241 aa  181  2e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3926  hypothetical protein  42.93 
 
 		 322 aa  169  6e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3037  protein of unknown function DUF1568  43.24 
 
 		 315 aa  167  1e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2086  hypothetical protein  41.7 
 
 		 321 aa  166  5e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.464464  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0950  hypothetical protein  41.15 
 
 		 321 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000190963  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1620  hypothetical protein  42.79 
 
 		 313 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1032  protein of unknown function DUF1568  36.29 
 
 		 326 aa  159  7e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3632  hypothetical protein  42.03 
 
 		 316 aa  148  9e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.108416  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0770  protein of unknown function DUF1568  39.52 
 
 		 316 aa  144  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.717082  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0164  transposase  30 
 
 		 287 aa  143  3e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0743928  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2771  hypothetical protein  35.06 
 
 		 318 aa  140  3e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1356  hypothetical protein  41.11 
 
 		 319 aa  139  4.999999999999999e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.895893  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1811  protein of unknown function DUF1568  55.05 
 
 		 138 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00808567  hitchhiker  0.000000000975496 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0489  hypothetical protein  34.86 
 
 		 310 aa  134  1.9999999999999998e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.448467 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0845  hypothetical protein  30.84 
 
 		 334 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2643  transposase domain-containing protein  38.38 
 
 		 335 aa  129  6e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1392  hypothetical protein  37.63 
 
 		 320 aa  128  9.000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0844  hypothetical protein  29.79 
 
 		 340 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1872  hypothetical protein  37.5 
 
 		 277 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0996  protein of unknown function DUF1568  36.45 
 
 		 216 aa  126  4.0000000000000003e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.976226  normal  0.164778 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1084  transposase and inactivated derivatives  30.82 
 
 		 338 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0324  protein of unknown function DUF1568  30.69 
 
 		 252 aa  125  6e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.551772  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2131  hypothetical protein  37.16 
 
 		 333 aa  124  3e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.132605  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4538  protein of unknown function DUF1568  34.46 
 
 		 251 aa  123  4e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0855967  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2207  protein of unknown function DUF1568  35.5 
 
 		 323 aa  122  7e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.45311e-16 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1423  protein of unknown function DUF1568  42.47 
 
 		 180 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.7985800000000005e-18 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0954  hypothetical protein  34.22 
 
 		 326 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.729066  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0033  hypothetical protein  34.43 
 
 		 235 aa  119  7e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3078  protein of unknown function DUF1568  34.44 
 
 		 190 aa  119  7.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12790  transposase  43.07 
 
 		 241 aa  118  9e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3105  protein of unknown function DUF1568  34.44 
 
 		 192 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000625853  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1356  protein of unknown function DUF1568  31.82 
 
 		 321 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0875577  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3248  protein of unknown function DUF1568  34.44 
 
 		 181 aa  117  3e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00178625  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2213  hypothetical protein  31.75 
 
 		 321 aa  117  3e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.809495  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2204  hypothetical protein  31.75 
 
 		 327 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2233  hypothetical protein  31.75 
 
 		 321 aa  116  5e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2246  hypothetical protein  31.75 
 
 		 321 aa  116  5e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2237  hypothetical protein  31.75 
 
 		 321 aa  115  6e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1724  hypothetical protein  27.65 
 
 		 248 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1725  hypothetical protein  27.65 
 
 		 248 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3871  protein of unknown function DUF1568  31.14 
 
 		 236 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1791  transposase and inactivated derivatives  36.41 
 
 		 323 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2050  protein of unknown function DUF1568  41.98 
 
 		 336 aa  114  2.0000000000000002e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.633564  normal  0.705399 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2192  hypothetical protein  27.76 
 
 		 253 aa  112  5e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107555  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2198  transposase  31.46 
 
 		 253 aa  112  6e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1319  protein of unknown function DUF1568  33.33 
 
 		 319 aa  112  9e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0490388  hitchhiker  0.00690567 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1151  protein of unknown function DUF1568  34.95 
 
 		 231 aa  112  9e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1506  protein of unknown function DUF1568  35.14 
 
 		 321 aa  112  9e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0477  hypothetical protein  32.41 
 
 		 232 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2474  protein of unknown function DUF1568  29.77 
 
 		 224 aa  110  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000403207  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1007  hypothetical protein  33.7 
 
 		 234 aa  109  5e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.849512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0595  hypothetical protein  37.86 
 
 		 258 aa  109  5e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.217159  hitchhiker  2.03187e-17 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0136  transposase  33.96 
 
 		 236 aa  109  6e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0148  transposase  35.22 
 
 		 236 aa  109  6e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0526667  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1484  hypothetical protein  33.15 
 
 		 231 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1782  protein of unknown function DUF1568  34.41 
 
 		 325 aa  108  7.000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0188832 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0722  protein of unknown function DUF1568  28.4 
 
 		 321 aa  108  8.000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.645218  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1427  hypothetical protein  34.07 
 
 		 321 aa  108  8.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1425  hypothetical protein  34.07 
 
 		 321 aa  108  9.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1929  protein of unknown function DUF1568  30.14 
 
 		 321 aa  108  1e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0682  hypothetical protein  32.86 
 
 		 232 aa  108  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.349284  normal  0.584525 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2776  hypothetical protein  36.71 
 
 		 235 aa  108  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.721483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0708  protein of unknown function DUF1568  31.65 
 
 		 233 aa  108  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.615013  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2153  hypothetical protein  36.81 
 
 		 221 aa  107  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0207768  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0397  protein of unknown function DUF1568  27.27 
 
 		 304 aa  107  3e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000164254  normal  0.853679 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3295  hypothetical protein  37.76 
 
 		 230 aa  107  3e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1423  protein of unknown function DUF1568  32.78 
 
 		 325 aa  107  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.892865 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3122  transposase  33.5 
 
 		 231 aa  107  3e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.299801  normal  0.623865 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2789  hypothetical protein  30.64 
 
 		 235 aa  107  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.603101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3592  protein of unknown function DUF1568  31.49 
 
 		 235 aa  106  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00165115  hitchhiker  0.000000708999 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0790  hypothetical protein  30.67 
 
 		 232 aa  106  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.513436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1558  protein of unknown function DUF1568  30.84 
 
 		 230 aa  106  5e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.55731 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2218  hypothetical protein  32.09 
 
 		 327 aa  105  6e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00293328  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0093  hypothetical protein  34.72 
 
 		 234 aa  105  7e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150021  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1552  protein of unknown function DUF1568  31.16 
 
 		 230 aa  105  7e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.268269 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0740  hypothetical protein  30.99 
 
 		 255 aa  105  7e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.345588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0793  hypothetical protein  32.45 
 
 		 335 aa  105  7e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000261863  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2932  hypothetical protein  30.99 
 
 		 234 aa  105  8e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.56667  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2396  hypothetical protein  39.16 
 
 		 220 aa  105  9e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0364  transposase-like protein  31.06 
 
 		 235 aa  105  9e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.72516  normal  0.431982 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0925  protein of unknown function DUF1568  32.26 
 
 		 336 aa  104  1e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1701  hypothetical protein  35.46 
 
 		 174 aa  104  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5382  hypothetical protein  38.89 
 
 		 223 aa  104  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564815  normal  0.588654 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1554  protein of unknown function DUF1568  31.36 
 
 		 230 aa  104  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.335003 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1812  protein of unknown function DUF1568  52.33 
 
 		 111 aa  104  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.001052  hitchhiker  0.000000000744567 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1556  protein of unknown function DUF1568  31.36 
 
 		 230 aa  104  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.444415 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>