157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1812 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_1812  protein of unknown function DUF1568  100 
 
 
111 aa  230  6e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.001052  hitchhiker  0.000000000744567 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1811  protein of unknown function DUF1568  80.43 
 
 
138 aa  216  6e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00808567  hitchhiker  0.000000000975496 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1813  protein of unknown function DUF1568  100 
 
 
277 aa  182  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00112655  hitchhiker  0.00000000103135 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2878  protein of unknown function DUF1568  56.98 
 
 
287 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0203  hypothetical protein  55.81 
 
 
288 aa  111  3e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0207  hypothetical protein  55.81 
 
 
288 aa  111  3e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0201  hypothetical protein  54.65 
 
 
288 aa  110  9e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0793  hypothetical protein  55.95 
 
 
314 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1406  protein of unknown function DUF1568  55.81 
 
 
289 aa  107  5e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1966  hypothetical protein  58.82 
 
 
305 aa  106  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.527692  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1967  hypothetical protein  58.82 
 
 
282 aa  106  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.969925  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3020  hypothetical protein  53.57 
 
 
316 aa  106  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3016  hypothetical protein  54.76 
 
 
312 aa  105  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2878  protein of unknown function DUF1568  52.33 
 
 
289 aa  104  4e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000473385 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3926  hypothetical protein  52.38 
 
 
322 aa  101  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1748  hypothetical protein  55.95 
 
 
312 aa  98.6  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.994794  normal  0.0128416 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2264  transposase and inactivated derivatives  51.19 
 
 
323 aa  97.4  5e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.88974  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2265  transposase and inactivated derivatives  51.19 
 
 
241 aa  95.1  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2050  protein of unknown function DUF1568  51.16 
 
 
336 aa  93.2  1e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.633564  normal  0.705399 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2086  hypothetical protein  52.94 
 
 
321 aa  91.3  4e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.464464  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1032  protein of unknown function DUF1568  50.59 
 
 
326 aa  90.9  5e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0489  hypothetical protein  45.35 
 
 
310 aa  84  7e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.448467 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1724  hypothetical protein  42.35 
 
 
248 aa  76.3  0.0000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1725  hypothetical protein  42.35 
 
 
248 aa  76.3  0.0000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1356  hypothetical protein  41.18 
 
 
319 aa  72  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.895893  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0950  hypothetical protein  41.18 
 
 
321 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000190963  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0324  protein of unknown function DUF1568  36.47 
 
 
252 aa  69.7  0.00000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.551772  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2771  hypothetical protein  42.35 
 
 
318 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3037  protein of unknown function DUF1568  40.48 
 
 
315 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0595  hypothetical protein  39.76 
 
 
258 aa  63.5  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.217159  hitchhiker  2.03187e-17 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0770  protein of unknown function DUF1568  37.65 
 
 
316 aa  62.8  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.717082  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1872  hypothetical protein  69.44 
 
 
277 aa  62  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3632  hypothetical protein  37.65 
 
 
316 aa  62  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.108416  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3049  transposase and inactivated derivatives  43.68 
 
 
226 aa  61.2  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12790  transposase  39.73 
 
 
241 aa  61.2  0.000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1151  protein of unknown function DUF1568  41.38 
 
 
231 aa  60.8  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3078  protein of unknown function DUF1568  34.12 
 
 
190 aa  60.5  0.000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3248  protein of unknown function DUF1568  34.12 
 
 
181 aa  60.1  0.000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00178625  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3105  protein of unknown function DUF1568  34.12 
 
 
192 aa  60.1  0.000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000625853  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2474  protein of unknown function DUF1568  36 
 
 
224 aa  60.1  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000403207  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0164  transposase  36.47 
 
 
287 aa  58.9  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0743928  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1620  hypothetical protein  36.47 
 
 
313 aa  59.3  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4538  protein of unknown function DUF1568  34.52 
 
 
251 aa  58.5  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0855967  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2153  hypothetical protein  35.96 
 
 
221 aa  58.5  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0207768  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0844  hypothetical protein  37.97 
 
 
340 aa  57  0.00000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0682  hypothetical protein  36.05 
 
 
232 aa  57  0.00000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.349284  normal  0.584525 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2885  hypothetical protein  35.29 
 
 
98 aa  57  0.00000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0722  protein of unknown function DUF1568  36.47 
 
 
321 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.645218  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3871  protein of unknown function DUF1568  41.38 
 
 
236 aa  56.6  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0996  protein of unknown function DUF1568  38 
 
 
216 aa  56.2  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.976226  normal  0.164778 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3320  transposase  44 
 
 
77 aa  55.8  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1929  protein of unknown function DUF1568  36.47 
 
 
321 aa  55.5  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1319  protein of unknown function DUF1568  35.29 
 
 
319 aa  55.8  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0490388  hitchhiker  0.00690567 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2932  hypothetical protein  33.33 
 
 
234 aa  55.1  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.56667  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3321  hypothetical protein  41.07 
 
 
69 aa  54.3  0.0000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01210  transposase  31.76 
 
 
245 aa  53.9  0.0000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1802  protein of unknown function DUF1568  37.21 
 
 
240 aa  53.9  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1423  protein of unknown function DUF1568  36.9 
 
 
180 aa  53.5  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.7985800000000005e-18 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2323  hypothetical protein  34.94 
 
 
129 aa  53.5  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0887847  normal  0.0112234 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2321  hypothetical protein  35.06 
 
 
297 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0102584 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1506  protein of unknown function DUF1568  34.12 
 
 
321 aa  52.8  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2198  transposase  32.14 
 
 
253 aa  52  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2643  transposase domain-containing protein  33.33 
 
 
335 aa  52  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2192  hypothetical protein  36.92 
 
 
253 aa  52  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107555  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1392  hypothetical protein  37.5 
 
 
320 aa  51.6  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2131  hypothetical protein  40.28 
 
 
333 aa  51.6  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.132605  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0397  protein of unknown function DUF1568  31.11 
 
 
304 aa  51.6  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000164254  normal  0.853679 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2224  hypothetical protein  34.12 
 
 
112 aa  51.2  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00479916  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3257  hypothetical protein  35.06 
 
 
314 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2989  hypothetical protein  63.89 
 
 
49 aa  50.8  0.000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.969643  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1084  transposase and inactivated derivatives  31.4 
 
 
338 aa  50.4  0.000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2204  hypothetical protein  34.12 
 
 
327 aa  50.8  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2205  hypothetical protein  34.12 
 
 
160 aa  50.4  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2233  hypothetical protein  34.12 
 
 
321 aa  50.8  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2237  hypothetical protein  34.12 
 
 
321 aa  50.8  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2246  hypothetical protein  34.12 
 
 
321 aa  50.8  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0033  hypothetical protein  40.7 
 
 
235 aa  50.4  0.000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0136  transposase  31.82 
 
 
236 aa  50.4  0.000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0167  hypothetical protein  34.83 
 
 
101 aa  50.4  0.000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0741  protein of unknown function DUF1568  36.99 
 
 
97 aa  50.4  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.117883  normal  0.0672697 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0793  hypothetical protein  37.97 
 
 
335 aa  50.4  0.000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000261863  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1356  protein of unknown function DUF1568  34.12 
 
 
321 aa  50.1  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0875577  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0220  hypothetical protein  35.06 
 
 
298 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1055  transposase  31.91 
 
 
250 aa  49.7  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0320  protein of unknown function DUF1568  34.25 
 
 
297 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.726603  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0331  protein of unknown function DUF1568  34.25 
 
 
297 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.214506  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2360  hypothetical protein  33.82 
 
 
106 aa  49.7  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.185844  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1425  hypothetical protein  34.12 
 
 
321 aa  48.9  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1427  hypothetical protein  34.12 
 
 
321 aa  48.9  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0242  protein of unknown function DUF1568  35.06 
 
 
298 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0717597  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1007  hypothetical protein  36.92 
 
 
234 aa  48.9  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.849512  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0231  protein of unknown function DUF1568  35.06 
 
 
298 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2966  hypothetical protein  35.63 
 
 
241 aa  48.5  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2620  hypothetical protein  35.8 
 
 
254 aa  48.5  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000852823  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2336  protein of unknown function DUF1568  35.29 
 
 
324 aa  48.5  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1512  hypothetical protein  40 
 
 
222 aa  48.5  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.656335 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2207  protein of unknown function DUF1568  36.25 
 
 
323 aa  48.1  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.45311e-16 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0309  hypothetical protein  32.88 
 
 
297 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.359735  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0790  hypothetical protein  32.56 
 
 
232 aa  48.1  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.513436  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3122  transposase  31.87 
 
 
231 aa  48.1  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.299801  normal  0.623865 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>