58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_3320 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_3320  transposase  100 
 
 		 77 aa  161  3e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3321  hypothetical protein  98.08 
 
 		 69 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2878  protein of unknown function DUF1568  61.54 
 
 		 287 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2878  protein of unknown function DUF1568  61.54 
 
 		 289 aa  72.8  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000473385 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0201  hypothetical protein  55.77 
 
 		 288 aa  71.2  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0203  hypothetical protein  55.77 
 
 		 288 aa  71.6  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0207  hypothetical protein  55.77 
 
 		 288 aa  71.2  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1406  protein of unknown function DUF1568  55.77 
 
 		 289 aa  67  0.00000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3020  hypothetical protein  55.32 
 
 		 316 aa  61.6  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1748  hypothetical protein  59.57 
 
 		 312 aa  61.2  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.994794  normal  0.0128416 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0793  hypothetical protein  55.32 
 
 		 314 aa  60.8  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1967  hypothetical protein  44.23 
 
 		 282 aa  60.5  0.000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.969925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1966  hypothetical protein  44.23 
 
 		 305 aa  60.1  0.000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.527692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3016  hypothetical protein  51.06 
 
 		 312 aa  58.2  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2050  protein of unknown function DUF1568  51.02 
 
 		 336 aa  58.2  0.00000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.633564  normal  0.705399 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0950  hypothetical protein  54.17 
 
 		 321 aa  58.2  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000190963  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1812  protein of unknown function DUF1568  44 
 
 		 111 aa  55.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.001052  hitchhiker  0.000000000744567 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1813  protein of unknown function DUF1568  44 
 
 		 277 aa  55.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00112655  hitchhiker  0.00000000103135 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1811  protein of unknown function DUF1568  43.14 
 
 		 138 aa  55.5  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00808567  hitchhiker  0.000000000975496 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1356  hypothetical protein  50 
 
 		 319 aa  53.9  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.895893  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2264  transposase and inactivated derivatives  48 
 
 		 323 aa  51.2  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.88974  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2086  hypothetical protein  51.16 
 
 		 321 aa  51.2  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.464464  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2265  transposase and inactivated derivatives  48 
 
 		 241 aa  50.4  0.000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1032  protein of unknown function DUF1568  53.49 
 
 		 326 aa  49.7  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3037  protein of unknown function DUF1568  46.81 
 
 		 315 aa  50.1  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2771  hypothetical protein  57.5 
 
 		 318 aa  50.1  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0844  hypothetical protein  43.14 
 
 		 340 aa  48.1  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0489  hypothetical protein  38.78 
 
 		 310 aa  47.4  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.448467 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3632  hypothetical protein  48.94 
 
 		 316 aa  46.2  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.108416  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3926  hypothetical protein  40.38 
 
 		 322 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2932  hypothetical protein  42.55 
 
 		 234 aa  45.4  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.56667  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2643  transposase domain-containing protein  45.45 
 
 		 335 aa  45.4  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0925  protein of unknown function DUF1568  43.48 
 
 		 336 aa  44.7  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0164  transposase  42.22 
 
 		 287 aa  44.3  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0743928  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1423  protein of unknown function DUF1568  50 
 
 		 180 aa  44.7  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.7985800000000005e-18 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1392  hypothetical protein  40.74 
 
 		 320 aa  44.3  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1007  hypothetical protein  42.55 
 
 		 234 aa  43.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.849512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1084  transposase and inactivated derivatives  37.25 
 
 		 338 aa  43.5  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0324  protein of unknown function DUF1568  38.78 
 
 		 252 aa  43.5  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.551772  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3049  transposase and inactivated derivatives  50 
 
 		 226 aa  43.5  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0770  protein of unknown function DUF1568  38.78 
 
 		 316 aa  42.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.717082  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0996  protein of unknown function DUF1568  47.5 
 
 		 216 aa  42.4  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.976226  normal  0.164778 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1701  hypothetical protein  42.86 
 
 		 174 aa  42.7  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0845  hypothetical protein  44.74 
 
 		 334 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1151  protein of unknown function DUF1568  40.43 
 
 		 231 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2247  hypothetical protein  38.89 
 
 		 101 aa  41.6  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2333  protein of unknown function DUF1568  41.86 
 
 		 324 aa  41.2  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2216  hypothetical protein  37.04 
 
 		 72 aa  41.2  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.136455  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2336  protein of unknown function DUF1568  40 
 
 		 324 aa  41.2  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0682  hypothetical protein  40.43 
 
 		 232 aa  40.8  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.349284  normal  0.584525 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2218  hypothetical protein  37.04 
 
 		 327 aa  40.8  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00293328  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3871  protein of unknown function DUF1568  47.5 
 
 		 236 aa  40.4  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2223  hypothetical protein  39.13 
 
 		 70 aa  40.4  0.008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00126259  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1512  hypothetical protein  42.22 
 
 		 222 aa  40.4  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.656335 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2253  hypothetical protein  39.13 
 
 		 53 aa  40.4  0.008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.353665  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2396  hypothetical protein  43.48 
 
 		 220 aa  40.4  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1620  hypothetical protein  47.5 
 
 		 313 aa  40.4  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0741  protein of unknown function DUF1568  41.3 
 
 		 97 aa  40  0.01  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.117883  normal  0.0672697 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>