76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2451 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_2451  hypothetical protein  100 
 
 
201 aa  416  9.999999999999999e-116  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.875999 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0837  hypothetical protein  61.14 
 
 
206 aa  228  3e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0300  hypothetical protein  58.55 
 
 
193 aa  226  2e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.401229  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3321  hypothetical protein  56.85 
 
 
197 aa  219  3e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.873195  hitchhiker  0.0000029094 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1141  hypothetical protein  55.05 
 
 
204 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343798  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1092  hypothetical protein  57.87 
 
 
223 aa  208  4e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.462205  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1272  hypothetical protein  53.89 
 
 
196 aa  197  6e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1806  hypothetical protein  52.68 
 
 
220 aa  196  2.0000000000000003e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.929401  normal  0.508252 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2260  hypothetical protein  46.57 
 
 
207 aa  194  1e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000303912  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0554  hypothetical protein  45.74 
 
 
177 aa  178  4.999999999999999e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3252  hypothetical protein  47.67 
 
 
174 aa  177  9e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2720  hypothetical protein  44.68 
 
 
232 aa  176  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0825  hypothetical protein  45.05 
 
 
204 aa  176  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2844  hypothetical protein  47.87 
 
 
168 aa  174  5e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1068  hypothetical protein  45.36 
 
 
179 aa  175  5e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0377724 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0995  hypothetical protein  43.68 
 
 
163 aa  171  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1024  hypothetical protein  43.68 
 
 
163 aa  171  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0275616 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0508  hypothetical protein  45.31 
 
 
197 aa  167  1e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1123  hypothetical protein  45.45 
 
 
198 aa  164  8e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0284  hypothetical protein  43.92 
 
 
187 aa  162  4.0000000000000004e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2688  hypothetical protein  40.85 
 
 
239 aa  160  9e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.968577  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0544  hypothetical protein  41.2 
 
 
221 aa  159  2e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0459  protein of unknown function DUF1568  39.79 
 
 
219 aa  158  4e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0472  protein of unknown function DUF1568  40.21 
 
 
185 aa  157  8e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.527235  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2426  hypothetical protein  44.79 
 
 
249 aa  157  1e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.763748  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2239  hypothetical protein  43.08 
 
 
193 aa  154  7e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.892224 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1423  hypothetical protein  43.55 
 
 
190 aa  153  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0723696  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1450  hypothetical protein  43.78 
 
 
203 aa  153  2e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1453  hypothetical protein  42.78 
 
 
203 aa  149  2e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1035  hypothetical protein  41.43 
 
 
224 aa  149  3e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0181  hypothetical protein  41.05 
 
 
200 aa  148  5e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2335  hypothetical protein  41.15 
 
 
198 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000417097  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0315  hypothetical protein  42.08 
 
 
197 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0440  hypothetical protein  36.17 
 
 
251 aa  146  3e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1136  hypothetical protein  40.5 
 
 
192 aa  145  3e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1527  hypothetical protein  41.95 
 
 
199 aa  144  1e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1529  hypothetical protein  38.1 
 
 
192 aa  126  2.0000000000000002e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0555  hypothetical protein  57.14 
 
 
127 aa  118  7e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1437  hypothetical protein  36.22 
 
 
200 aa  106  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0779  hypothetical protein  43.14 
 
 
107 aa  94.7  8e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1350  hypothetical protein  44.32 
 
 
258 aa  91.7  7e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0718437  normal  0.104355 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4519  hypothetical protein  37.78 
 
 
152 aa  73.9  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2775  hypothetical protein  43.02 
 
 
129 aa  66.6  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.963752  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1489  hypothetical protein  22.41 
 
 
153 aa  56.6  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1133  hypothetical protein  24.19 
 
 
153 aa  55.8  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000547954  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3286  protein of unknown function DUF1568  30.43 
 
 
214 aa  55.1  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00118326  unclonable  0.0000000135739 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0243  hypothetical protein  26.55 
 
 
178 aa  52.4  0.000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.273479  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0943  protein of unknown function DUF1568  26.06 
 
 
163 aa  51.6  0.000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.74816  normal  0.454082 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3702  hypothetical protein  28.57 
 
 
208 aa  51.2  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000809832 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0262  hypothetical protein  22.53 
 
 
152 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1888  hypothetical protein  29.65 
 
 
171 aa  50.4  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.17258  hitchhiker  0.00842787 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1975  hypothetical protein  23.26 
 
 
163 aa  49.7  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.121263 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4223  hypothetical protein  29.17 
 
 
212 aa  49.7  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.228925 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1952  hypothetical protein  28.92 
 
 
178 aa  49.3  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4373  hypothetical protein  25.15 
 
 
178 aa  49.3  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.295832  normal  0.0449373 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1351  hypothetical protein  44.83 
 
 
165 aa  49.3  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0430442  normal  0.0970629 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1855  hypothetical protein  26.14 
 
 
175 aa  49.3  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1352  hypothetical protein  44.83 
 
 
172 aa  48.9  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0376314  normal  0.0977946 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1685  hypothetical protein  21.74 
 
 
149 aa  47.8  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.365398  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1966  hypothetical protein  28.19 
 
 
231 aa  46.2  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.74185  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0311  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  25.64 
 
 
1372 aa  44.3  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.220801 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3465  hypothetical protein  24.86 
 
 
150 aa  44.3  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1473  transposase, putative  26.9 
 
 
179 aa  44.3  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0337  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  24.79 
 
 
1345 aa  44.3  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.038664  normal  0.920027 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4421  hypothetical protein  23.6 
 
 
152 aa  43.5  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.268203 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1574  hypothetical protein  33.87 
 
 
150 aa  43.9  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.620864  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5083  hypothetical protein  25.27 
 
 
151 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.268045  normal  0.309651 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0788  hypothetical protein  23.17 
 
 
150 aa  42.7  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1552  hypothetical protein  26.89 
 
 
205 aa  43.1  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0339239 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4226  hypothetical protein  24.86 
 
 
177 aa  43.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.853067  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2777  hypothetical protein  21.84 
 
 
149 aa  42.4  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.430133  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1364  hypothetical protein  23.48 
 
 
150 aa  42.4  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0968684  normal  0.0104776 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3919  hypothetical protein  21.95 
 
 
151 aa  42.4  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0968412  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3976  protein of unknown function DUF1568  23.46 
 
 
151 aa  42.4  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.183049  normal  0.223747 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2890  hypothetical protein  23.53 
 
 
191 aa  42  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4081  hypothetical protein  24.4 
 
 
177 aa  41.6  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0580442  normal  0.342905 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>