119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3702 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3702  hypothetical protein  100 
 
 		 208 aa  429  1e-119  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000809832 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3286  protein of unknown function DUF1568  94.15 
 
 		 214 aa  399  9.999999999999999e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00118326  unclonable  0.0000000135739 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4223  hypothetical protein  52.28 
 
 		 212 aa  202  3e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.228925 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5411  protein of unknown function DUF1568  42.16 
 
 		 218 aa  159  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000187281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5035  protein of unknown function DUF1568  41.05 
 
 		 214 aa  159  3e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.916294 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0311  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  35.64 
 
 		 1372 aa  106  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.220801 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0337  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  34.95 
 
 		 1345 aa  102  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.038664  normal  0.920027 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1966  hypothetical protein  30.39 
 
 		 231 aa  89.7  3e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.74185  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0943  protein of unknown function DUF1568  39.81 
 
 		 163 aa  71.2  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.74816  normal  0.454082 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3049  transposase and inactivated derivatives  38.37 
 
 		 226 aa  65.1  0.0000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1558  protein of unknown function DUF1568  35.58 
 
 		 230 aa  62  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.55731 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1556  protein of unknown function DUF1568  35.58 
 
 		 230 aa  62  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.444415 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1554  protein of unknown function DUF1568  35.58 
 
 		 230 aa  62  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.335003 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1552  protein of unknown function DUF1568  33.64 
 
 		 230 aa  59.7  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.268269 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2777  hypothetical protein  37.5 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.430133  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0788  hypothetical protein  27.97 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2793  transposase-like p;rotein  40.7 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4421  hypothetical protein  30.77 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.268203 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1272  hypothetical protein  32.03 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1512  hypothetical protein  35.24 
 
 		 222 aa  58.5  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.656335 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1685  hypothetical protein  30.17 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.365398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0315  hypothetical protein  30.08 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3465  hypothetical protein  30.91 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2474  protein of unknown function DUF1568  29.46 
 
 		 224 aa  55.1  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000403207  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0595  hypothetical protein  29.55 
 
 		 258 aa  54.7  0.0000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.217159  hitchhiker  2.03187e-17 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0033  hypothetical protein  35.16 
 
 		 235 aa  54.3  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1541  hypothetical protein  37.35 
 
 		 267 aa  53.1  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.463797  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1489  hypothetical protein  31.36 
 
 		 153 aa  52  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3976  protein of unknown function DUF1568  32.18 
 
 		 151 aa  52  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.183049  normal  0.223747 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5047  hypothetical protein  30.28 
 
 		 151 aa  51.6  0.000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0419469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1133  hypothetical protein  33.33 
 
 		 153 aa  51.6  0.000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000547954  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1724  hypothetical protein  28.57 
 
 		 248 aa  51.2  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1725  hypothetical protein  28.57 
 
 		 248 aa  51.2  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2451  hypothetical protein  28.57 
 
 		 201 aa  51.2  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.875999 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1024  hypothetical protein  36.14 
 
 		 163 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0275616 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2153  hypothetical protein  30.43 
 
 		 221 aa  50.8  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0207768  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0995  hypothetical protein  36.14 
 
 		 163 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2620  hypothetical protein  33.33 
 
 		 254 aa  50.1  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000852823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3485  hypothetical protein  33.71 
 
 		 260 aa  50.4  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.36702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3252  hypothetical protein  29.06 
 
 		 174 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5382  hypothetical protein  37.89 
 
 		 223 aa  50.4  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564815  normal  0.588654 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2844  hypothetical protein  31.46 
 
 		 168 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0472  protein of unknown function DUF1568  32.61 
 
 		 185 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.527235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4707  hypothetical protein  32.95 
 
 		 152 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0917  protein of unknown function DUF1568  33.33 
 
 		 221 aa  49.7  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0554  hypothetical protein  24.81 
 
 		 177 aa  49.3  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2771  hypothetical protein  35.71 
 
 		 318 aa  48.9  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1055  transposase  22.39 
 
 		 250 aa  48.9  0.00005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2887  hypothetical protein  36.14 
 
 		 242 aa  48.9  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0459  protein of unknown function DUF1568  31.87 
 
 		 219 aa  48.9  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0902  hypothetical protein  30 
 
 		 250 aa  48.5  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1574  hypothetical protein  27.19 
 
 		 150 aa  48.5  0.00007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.620864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1527  hypothetical protein  36.92 
 
 		 199 aa  48.1  0.00008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12790  transposase  33.72 
 
 		 241 aa  48.1  0.00009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0324  protein of unknown function DUF1568  28.26 
 
 		 252 aa  48.1  0.00009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.551772  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2396  hypothetical protein  34.69 
 
 		 220 aa  47.4  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0220  hypothetical protein  33.67 
 
 		 298 aa  47.8  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1975  hypothetical protein  29.82 
 
 		 163 aa  47.8  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121263 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3277  protein of unknown function DUF1568  38.1 
 
 		 197 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1423  hypothetical protein  30.1 
 
 		 190 aa  48.1  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0723696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1123  hypothetical protein  22.03 
 
 		 198 aa  47  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0242  protein of unknown function DUF1568  32.99 
 
 		 298 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0717597  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16060  hypothetical protein  32.26 
 
 		 86 aa  47  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00113675  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27031  hypothetical protein  34.88 
 
 		 260 aa  46.6  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0231  protein of unknown function DUF1568  31.96 
 
 		 298 aa  45.8  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0477  hypothetical protein  32.95 
 
 		 232 aa  45.4  0.0006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1802  protein of unknown function DUF1568  32.22 
 
 		 240 aa  45.4  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2966  hypothetical protein  36.36 
 
 		 241 aa  45.4  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4538  protein of unknown function DUF1568  28.26 
 
 		 251 aa  45.1  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0855967  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0284  hypothetical protein  29.6 
 
 		 187 aa  45.1  0.0007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27481  hypothetical protein  34.88 
 
 		 260 aa  45.1  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.581269 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0613  hypothetical protein  25 
 
 		 151 aa  45.1  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.018198 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0440  hypothetical protein  54.55 
 
 		 251 aa  45.1  0.0008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2426  hypothetical protein  28.57 
 
 		 249 aa  45.1  0.0008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.763748  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2776  hypothetical protein  34.41 
 
 		 235 aa  44.3  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.721483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0179  hypothetical protein  31.58 
 
 		 254 aa  44.3  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0565655  normal  0.576766 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1141  hypothetical protein  35.59 
 
 		 204 aa  44.3  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343798  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3670  transposase and inactivated derivatives  32.14 
 
 		 228 aa  44.3  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0508  hypothetical protein  25.22 
 
 		 197 aa  44.7  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0568  hypothetical protein  25 
 
 		 151 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.853287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3477  hypothetical protein  34.09 
 
 		 188 aa  43.9  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.379705  normal  0.40189 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2360  hypothetical protein  38.33 
 
 		 106 aa  43.5  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.185844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26971  hypothetical protein  33.72 
 
 		 260 aa  43.5  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29611  hypothetical protein  31.03 
 
 		 124 aa  43.9  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3295  hypothetical protein  30.77 
 
 		 230 aa  43.5  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1701  hypothetical protein  28.78 
 
 		 174 aa  43.5  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1450  hypothetical protein  25 
 
 		 203 aa  43.5  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0996  protein of unknown function DUF1568  30.21 
 
 		 216 aa  43.9  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.976226  normal  0.164778 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2897  protein of unknown function DUF1568  35.96 
 
 		 250 aa  43.9  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0773075 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2932  hypothetical protein  30.63 
 
 		 234 aa  43.1  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.56667  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1552  hypothetical protein  25.4 
 
 		 205 aa  43.1  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0339239 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0682  hypothetical protein  33.33 
 
 		 232 aa  43.1  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.349284  normal  0.584525 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0093  hypothetical protein  34.52 
 
 		 234 aa  43.1  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150021  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3244  protein of unknown function DUF1568  35.96 
 
 		 241 aa  43.1  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1453  hypothetical protein  25.89 
 
 		 203 aa  43.1  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0968  hypothetical protein  30.48 
 
 		 242 aa  43.1  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0262  hypothetical protein  27.01 
 
 		 152 aa  42.7  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0181  hypothetical protein  26.61 
 
 		 200 aa  42.7  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2198  transposase  27.78 
 
 		 253 aa  42.7  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1620  hypothetical protein  30.68 
 
 		 313 aa  42.7  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>