209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0943 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_0943  protein of unknown function DUF1568  100 
 
 		 163 aa  340  2.9999999999999997e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.74816  normal  0.454082 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3465  hypothetical protein  49.66 
 
 		 150 aa  152  1e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3976  protein of unknown function DUF1568  46.98 
 
 		 151 aa  150  1e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.183049  normal  0.223747 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4421  hypothetical protein  53.28 
 
 		 152 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.268203 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1133  hypothetical protein  47.83 
 
 		 153 aa  128  4.0000000000000003e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000547954  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0262  hypothetical protein  44.53 
 
 		 152 aa  127  7.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2777  hypothetical protein  45.95 
 
 		 149 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.430133  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4707  hypothetical protein  43.38 
 
 		 152 aa  124  6e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0613  hypothetical protein  42.66 
 
 		 151 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.018198 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3919  hypothetical protein  43.8 
 
 		 151 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0968412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5083  hypothetical protein  44.93 
 
 		 151 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.268045  normal  0.309651 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5236  hypothetical protein  43.8 
 
 		 151 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5047  hypothetical protein  44.2 
 
 		 151 aa  114  5e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0419469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4597  hypothetical protein  41.26 
 
 		 151 aa  112  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0971888 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1364  hypothetical protein  41.3 
 
 		 150 aa  110  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0968684  normal  0.0104776 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5176  hypothetical protein  42.31 
 
 		 184 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00299086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1574  hypothetical protein  41.3 
 
 		 150 aa  105  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.620864  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0568  hypothetical protein  43.36 
 
 		 151 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.853287  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1489  hypothetical protein  39.01 
 
 		 153 aa  97.8  5e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0607  hypothetical protein  42.66 
 
 		 151 aa  97.4  7e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0788  hypothetical protein  34.01 
 
 		 150 aa  88.6  4e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1685  hypothetical protein  34.97 
 
 		 149 aa  85.5  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.365398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3286  protein of unknown function DUF1568  37.5 
 
 		 214 aa  77.8  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00118326  unclonable  0.0000000135739 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0311  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  42.57 
 
 		 1372 aa  73.6  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.220801 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16060  hypothetical protein  43.21 
 
 		 86 aa  71.6  0.000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00113675  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3702  hypothetical protein  39.81 
 
 		 208 aa  71.2  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000809832 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5411  protein of unknown function DUF1568  33.04 
 
 		 218 aa  71.2  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000187281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0337  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  42.27 
 
 		 1345 aa  70.5  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.038664  normal  0.920027 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1552  hypothetical protein  28.24 
 
 		 205 aa  64.7  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0339239 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2264  transposase and inactivated derivatives  35.24 
 
 		 323 aa  63.2  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.88974  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2265  transposase and inactivated derivatives  31.51 
 
 		 241 aa  62.4  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1966  hypothetical protein  36.63 
 
 		 231 aa  62.4  0.000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.74185  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1317  protein of unknown function DUF1568  28.26 
 
 		 179 aa  62  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.737296  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3135  hypothetical protein  28.67 
 
 		 176 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.464073  normal  0.01424 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4223  hypothetical protein  27.94 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.228925 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1888  hypothetical protein  29.32 
 
 		 171 aa  59.3  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.17258  hitchhiker  0.00842787 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1975  hypothetical protein  28.68 
 
 		 163 aa  58.9  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121263 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2468  hypothetical protein  27.97 
 
 		 181 aa  57.4  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.321631  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0996  protein of unknown function DUF1568  30.19 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.976226  normal  0.164778 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0352  hypothetical protein  25.17 
 
 		 187 aa  55.8  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.642542  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0324  protein of unknown function DUF1568  28.45 
 
 		 252 aa  55.5  0.0000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.551772  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2835  hypothetical protein  25 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4462  hypothetical protein  23.57 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1024  hypothetical protein  27.13 
 
 		 163 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0275616 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1724  hypothetical protein  28.97 
 
 		 248 aa  54.7  0.0000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1725  hypothetical protein  28.97 
 
 		 248 aa  54.3  0.0000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0995  hypothetical protein  27.13 
 
 		 163 aa  54.3  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4599  hypothetical protein  37.78 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3477  hypothetical protein  26.81 
 
 		 188 aa  53.9  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.379705  normal  0.40189 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1084  transposase and inactivated derivatives  25.83 
 
 		 338 aa  53.5  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0554  hypothetical protein  27.27 
 
 		 177 aa  53.1  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2531  transposase  24.48 
 
 		 187 aa  53.5  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.719011  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0708  protein of unknown function DUF1568  31.63 
 
 		 233 aa  52.4  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.615013  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0902  hypothetical protein  26.92 
 
 		 250 aa  52.4  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1484  hypothetical protein  32.29 
 
 		 231 aa  52  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1554  protein of unknown function DUF1568  25.55 
 
 		 230 aa  52  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.335003 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4226  hypothetical protein  27.97 
 
 		 177 aa  52  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.853067  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1356  hypothetical protein  30.08 
 
 		 319 aa  51.6  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.895893  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1092  hypothetical protein  28.67 
 
 		 223 aa  52  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.462205  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1556  protein of unknown function DUF1568  25.55 
 
 		 230 aa  52  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.444415 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0300  hypothetical protein  28.67 
 
 		 193 aa  51.6  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.401229  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1558  protein of unknown function DUF1568  25.55 
 
 		 230 aa  51.6  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.55731 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2451  hypothetical protein  26.06 
 
 		 201 aa  51.6  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.875999 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0740  hypothetical protein  31.63 
 
 		 255 aa  51.2  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.345588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3321  hypothetical protein  43.33 
 
 		 197 aa  51.2  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.873195  hitchhiker  0.0000029094 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1552  protein of unknown function DUF1568  27.59 
 
 		 230 aa  51.2  0.000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.268269 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0477  hypothetical protein  30.21 
 
 		 232 aa  51.2  0.000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2887  hypothetical protein  32.08 
 
 		 242 aa  50.8  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02732  hypothetical protein  33.33 
 
 		 91 aa  50.8  0.000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.979452  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4538  protein of unknown function DUF1568  26.32 
 
 		 251 aa  50.8  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0855967  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0361  hypothetical protein  23.08 
 
 		 191 aa  50.8  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0793  hypothetical protein  27.5 
 
 		 335 aa  50.8  0.000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000261863  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2890  hypothetical protein  24.31 
 
 		 191 aa  50.8  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5035  protein of unknown function DUF1568  26.21 
 
 		 214 aa  50.8  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.916294 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2643  transposase domain-containing protein  26.67 
 
 		 335 aa  50.1  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3485  hypothetical protein  26.15 
 
 		 260 aa  50.1  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.36702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1007  hypothetical protein  34.09 
 
 		 234 aa  50.1  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.849512  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1541  hypothetical protein  29.25 
 
 		 267 aa  49.3  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.463797  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1473  transposase, putative  27.34 
 
 		 179 aa  49.7  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2932  hypothetical protein  27.74 
 
 		 234 aa  49.7  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.56667  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3130  transposase and inactivated derivatives  26.57 
 
 		 178 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0127624  normal  0.415202 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2793  transposase-like p;rotein  32.22 
 
 		 165 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3122  transposase  30.69 
 
 		 231 aa  49.3  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.299801  normal  0.623865 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2530  hypothetical protein  24.48 
 
 		 179 aa  49.7  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3926  hypothetical protein  27.4 
 
 		 322 aa  49.7  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0837  hypothetical protein  28.12 
 
 		 206 aa  48.9  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0397  protein of unknown function DUF1568  30.85 
 
 		 304 aa  48.9  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000164254  normal  0.853679 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0284  hypothetical protein  31.31 
 
 		 187 aa  48.9  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2474  protein of unknown function DUF1568  28.87 
 
 		 224 aa  48.9  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000403207  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3871  protein of unknown function DUF1568  28.85 
 
 		 236 aa  48.5  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0595  hypothetical protein  27.07 
 
 		 258 aa  48.5  0.00004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.217159  hitchhiker  2.03187e-17 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2321  hypothetical protein  29.5 
 
 		 297 aa  48.5  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0102584 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1802  protein of unknown function DUF1568  29.25 
 
 		 240 aa  48.1  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0790  hypothetical protein  31.68 
 
 		 232 aa  47.8  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.513436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0731  hypothetical protein  28.37 
 
 		 176 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3405  hypothetical protein  25.85 
 
 		 179 aa  47.8  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0242544  normal  0.205029 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4825  transposase and inactivated derivative  23.88 
 
 		 163 aa  47.4  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2906  hypothetical protein  27.78 
 
 		 329 aa  47.4  0.00009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.881072 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2394  hypothetical protein  30.68 
 
 		 239 aa  47.4  0.00009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.419691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1748  hypothetical protein  24.6 
 
 		 312 aa  46.6  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.994794  normal  0.0128416 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>