151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4373 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4373  hypothetical protein  100 
 
 		 178 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.295832  normal  0.0449373 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3405  hypothetical protein  59.66 
 
 		 179 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0242544  normal  0.205029 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3130  transposase and inactivated derivatives  58.86 
 
 		 178 aa  211  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0127624  normal  0.415202 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1952  hypothetical protein  55.93 
 
 		 178 aa  197  5e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1855  hypothetical protein  53.14 
 
 		 175 aa  191  4e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1685  transposase, putative  52.54 
 
 		 184 aa  191  6e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.207714 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1689  hypothetical protein  50.87 
 
 		 184 aa  185  3e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.625848  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4226  hypothetical protein  49.13 
 
 		 177 aa  184  6e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.853067  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2421  hypothetical protein  55.13 
 
 		 161 aa  183  1.0000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4081  hypothetical protein  47.73 
 
 		 177 aa  177  8e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0580442  normal  0.342905 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1473  transposase, putative  51.11 
 
 		 179 aa  174  6e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33360  hypothetical protein  50.84 
 
 		 176 aa  173  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1962  hypothetical protein  50 
 
 		 164 aa  171  5e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0731  hypothetical protein  44.89 
 
 		 176 aa  169  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1384  hypothetical protein  46.99 
 
 		 180 aa  167  9e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.705846 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0768  hypothetical protein  50.3 
 
 		 175 aa  165  2.9999999999999998e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0333217  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4825  transposase and inactivated derivative  46.67 
 
 		 163 aa  164  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3392  hypothetical protein  45.35 
 
 		 165 aa  160  1e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00223  hypothetical protein  45.35 
 
 		 165 aa  159  2e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00227  hypothetical protein  45.35 
 
 		 165 aa  159  2e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0352  hypothetical protein  46.15 
 
 		 187 aa  159  3e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.642542  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2531  transposase  45.6 
 
 		 187 aa  157  7e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.719011  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3379  conserved hypothetical protein  44.85 
 
 		 165 aa  155  3e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0243  hypothetical protein  44.58 
 
 		 178 aa  154  5.0000000000000005e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.273479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1317  protein of unknown function DUF1568  45.45 
 
 		 179 aa  154  6e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.737296  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2835  hypothetical protein  43.96 
 
 		 191 aa  154  6e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0240  hypothetical protein  43.03 
 
 		 165 aa  152  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0796  hypothetical protein  45.12 
 
 		 159 aa  151  5e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2478  hypothetical protein  48.97 
 
 		 161 aa  146  1.0000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1888  hypothetical protein  43.64 
 
 		 171 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.17258  hitchhiker  0.00842787 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2530  hypothetical protein  41.44 
 
 		 179 aa  143  1e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2890  hypothetical protein  40.64 
 
 		 191 aa  144  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0721b  hypothetical protein  50.38 
 
 		 133 aa  143  2e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3135  hypothetical protein  42.46 
 
 		 176 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.464073  normal  0.01424 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0361  hypothetical protein  39.64 
 
 		 191 aa  132  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2532  hypothetical protein  33.33 
 
 		 157 aa  89  3e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709096 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2244  transposase  35.04 
 
 		 161 aa  65.9  0.0000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.196666  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4707  hypothetical protein  36.61 
 
 		 152 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4599  hypothetical protein  30.43 
 
 		 160 aa  60.1  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1975  hypothetical protein  26.95 
 
 		 163 aa  56.2  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121263 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3477  hypothetical protein  26.32 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.379705  normal  0.40189 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0311  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  27.42 
 
 		 1372 aa  54.3  0.0000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.220801 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1272  hypothetical protein  27.33 
 
 		 196 aa  54.3  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3976  protein of unknown function DUF1568  30.94 
 
 		 151 aa  53.1  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.183049  normal  0.223747 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2844  hypothetical protein  29.29 
 
 		 168 aa  52.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0682  hypothetical protein  32.08 
 
 		 232 aa  52.4  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.349284  normal  0.584525 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0337  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  28.72 
 
 		 1345 aa  52.4  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.038664  normal  0.920027 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3286  protein of unknown function DUF1568  33.33 
 
 		 214 aa  50.8  0.000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00118326  unclonable  0.0000000135739 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1676  hypothetical protein  26.95 
 
 		 157 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1552  hypothetical protein  28.89 
 
 		 205 aa  50.4  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0339239 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2563  hypothetical protein  28.87 
 
 		 176 aa  50.8  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000213064  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3252  hypothetical protein  23.61 
 
 		 174 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1888b  hypothetical protein  46.67 
 
 		 101 aa  50.4  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0301  hypothetical protein  46.67 
 
 		 91 aa  50.8  0.00001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1512  hypothetical protein  28.3 
 
 		 222 aa  50.8  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.656335 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0554  hypothetical protein  24.38 
 
 		 177 aa  50.1  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2932  hypothetical protein  30.08 
 
 		 234 aa  50.1  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.56667  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0995  hypothetical protein  31.4 
 
 		 163 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1784  hypothetical protein  39.71 
 
 		 197 aa  49.7  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1024  hypothetical protein  31.4 
 
 		 163 aa  49.3  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0275616 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4462  hypothetical protein  27.5 
 
 		 152 aa  49.3  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3026  hypothetical protein  47.83 
 
 		 76 aa  49.7  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.247877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2451  hypothetical protein  25.15 
 
 		 201 aa  49.3  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.875999 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3712  hypothetical protein  26.95 
 
 		 177 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013542 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1802  protein of unknown function DUF1568  25.44 
 
 		 240 aa  48.9  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0885  protein of unknown function DUF1568  31.78 
 
 		 169 aa  48.9  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0708  protein of unknown function DUF1568  28.44 
 
 		 233 aa  48.5  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.615013  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0304  hypothetical protein  28.1 
 
 		 237 aa  48.5  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3498  hypothetical protein  28.1 
 
 		 237 aa  48.1  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.827202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1136  hypothetical protein  23.6 
 
 		 192 aa  48.1  0.00006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2706  hypothetical protein  28.1 
 
 		 237 aa  48.1  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0803898  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0320  hypothetical protein  28.1 
 
 		 237 aa  48.5  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.396962  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0401  hypothetical protein  28.1 
 
 		 237 aa  48.1  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0380  hypothetical protein  28.1 
 
 		 237 aa  48.1  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0329  hypothetical protein  28.1 
 
 		 237 aa  48.5  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2563  protein of unknown function DUF1568  22.52 
 
 		 248 aa  47.8  0.00007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2239  hypothetical protein  28.83 
 
 		 193 aa  47.8  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.892224 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3353  protein of unknown function DUF1568  25 
 
 		 181 aa  47.8  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.231762 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1450  hypothetical protein  25.15 
 
 		 203 aa  47.8  0.00008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1364  hypothetical protein  25.87 
 
 		 150 aa  47.8  0.00008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0968684  normal  0.0104776 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0284  hypothetical protein  22.73 
 
 		 187 aa  47.8  0.00009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0347  hypothetical protein  29.91 
 
 		 158 aa  47  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.119312  normal  0.0189577 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2265  transposase and inactivated derivatives  26.79 
 
 		 241 aa  47  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0740  hypothetical protein  25.62 
 
 		 255 aa  47.4  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.345588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1133  hypothetical protein  31.19 
 
 		 153 aa  47  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000547954  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3020  hypothetical protein  28.32 
 
 		 316 aa  47  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4223  hypothetical protein  29.25 
 
 		 212 aa  47.4  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.228925 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2426  hypothetical protein  23.49 
 
 		 249 aa  47  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.763748  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1489  hypothetical protein  29.47 
 
 		 153 aa  46.2  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0262  hypothetical protein  30.36 
 
 		 152 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1574  hypothetical protein  30.53 
 
 		 150 aa  46.2  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.620864  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1151  protein of unknown function DUF1568  30 
 
 		 231 aa  46.2  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3122  transposase  25.81 
 
 		 231 aa  46.6  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.299801  normal  0.623865 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1007  hypothetical protein  31 
 
 		 234 aa  46.6  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.849512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0825  hypothetical protein  26.16 
 
 		 204 aa  46.2  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0459  protein of unknown function DUF1568  27.45 
 
 		 219 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0943  protein of unknown function DUF1568  25.15 
 
 		 163 aa  46.2  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.74816  normal  0.454082 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0472  protein of unknown function DUF1568  27.18 
 
 		 185 aa  46.2  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.527235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1068  hypothetical protein  22.78 
 
 		 179 aa  45.4  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0377724 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1766  hypothetical protein  27.27 
 
 		 237 aa  45.4  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>