45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3026 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3026  hypothetical protein  100 
 
 		 76 aa  162  1.0000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.247877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4373  hypothetical protein  47.83 
 
 		 178 aa  49.7  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.295832  normal  0.0449373 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2478  hypothetical protein  48.84 
 
 		 161 aa  48.5  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3286  protein of unknown function DUF1568  40 
 
 		 214 aa  48.5  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00118326  unclonable  0.0000000135739 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1784  hypothetical protein  46.94 
 
 		 197 aa  48.9  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0731  hypothetical protein  41.07 
 
 		 176 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5411  protein of unknown function DUF1568  44.19 
 
 		 218 aa  47.4  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000187281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1685  transposase, putative  48.84 
 
 		 184 aa  47  0.00008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.207714 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2830  hypothetical protein  50 
 
 		 77 aa  46.6  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.322225  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3135  hypothetical protein  44.44 
 
 		 176 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.464073  normal  0.01424 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3130  transposase and inactivated derivatives  44.44 
 
 		 178 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0127624  normal  0.415202 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4226  hypothetical protein  44.44 
 
 		 177 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.853067  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0721b  hypothetical protein  42.22 
 
 		 133 aa  45.8  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1689  hypothetical protein  42.22 
 
 		 184 aa  45.4  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.625848  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1962  hypothetical protein  34.29 
 
 		 164 aa  45.4  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1855  hypothetical protein  42.22 
 
 		 175 aa  45.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0352  hypothetical protein  35.21 
 
 		 187 aa  45.1  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.642542  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4223  hypothetical protein  37.29 
 
 		 212 aa  45.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.228925 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0361  hypothetical protein  41.86 
 
 		 191 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3477  hypothetical protein  36.73 
 
 		 188 aa  44.3  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.379705  normal  0.40189 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0311  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  51.52 
 
 		 1372 aa  43.9  0.0007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.220801 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0337  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  51.52 
 
 		 1345 aa  43.9  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.038664  normal  0.920027 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1453  hypothetical protein  29.58 
 
 		 203 aa  43.9  0.0008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0768  hypothetical protein  48.84 
 
 		 175 aa  43.5  0.0009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0333217  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1473  transposase, putative  42.22 
 
 		 179 aa  43.5  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4599  hypothetical protein  40.48 
 
 		 160 aa  42.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2531  transposase  33.8 
 
 		 187 aa  42.4  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.719011  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3405  hypothetical protein  44.44 
 
 		 179 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0242544  normal  0.205029 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2421  hypothetical protein  40.91 
 
 		 161 aa  42.4  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1384  hypothetical protein  40 
 
 		 180 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.705846 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1888  hypothetical protein  42.22 
 
 		 171 aa  42  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.17258  hitchhiker  0.00842787 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1092  hypothetical protein  47.22 
 
 		 223 aa  42  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.462205  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5035  protein of unknown function DUF1568  35.85 
 
 		 214 aa  42  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.916294 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2530  hypothetical protein  37.78 
 
 		 179 aa  42  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1450  hypothetical protein  29.58 
 
 		 203 aa  42  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4707  hypothetical protein  37.5 
 
 		 152 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1952  hypothetical protein  45.45 
 
 		 178 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1317  protein of unknown function DUF1568  46.51 
 
 		 179 aa  41.2  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.737296  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4825  transposase and inactivated derivative  36 
 
 		 163 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33360  hypothetical protein  39.29 
 
 		 176 aa  41.2  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2890  hypothetical protein  41.86 
 
 		 191 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2835  hypothetical protein  40.91 
 
 		 191 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0796  hypothetical protein  37.78 
 
 		 159 aa  40.8  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0885  protein of unknown function DUF1568  39.13 
 
 		 169 aa  40.8  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0243  hypothetical protein  37.78 
 
 		 178 aa  40.8  0.007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.273479  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>