104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1685 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1685  transposase, putative  100 
 
 		 184 aa  372  1e-102  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.207714 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1952  hypothetical protein  62.92 
 
 		 178 aa  223  1e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1473  transposase, putative  63.91 
 
 		 179 aa  223  2e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1855  hypothetical protein  58.86 
 
 		 175 aa  217  7.999999999999999e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33360  hypothetical protein  58.76 
 
 		 176 aa  205  3e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0768  hypothetical protein  59.88 
 
 		 175 aa  204  5e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0333217  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1689  hypothetical protein  56.21 
 
 		 184 aa  202  2e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.625848  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1962  hypothetical protein  56.44 
 
 		 164 aa  201  5e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4081  hypothetical protein  56.14 
 
 		 177 aa  200  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0580442  normal  0.342905 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4226  hypothetical protein  57.31 
 
 		 177 aa  199  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.853067  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1384  hypothetical protein  52.63 
 
 		 180 aa  191  5e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.705846 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4373  hypothetical protein  52.54 
 
 		 178 aa  191  6e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.295832  normal  0.0449373 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1317  protein of unknown function DUF1568  57.58 
 
 		 179 aa  191  6e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.737296  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4825  transposase and inactivated derivative  54.24 
 
 		 163 aa  184  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3405  hypothetical protein  52.81 
 
 		 179 aa  184  8e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0242544  normal  0.205029 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2421  hypothetical protein  55.77 
 
 		 161 aa  184  9e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3135  hypothetical protein  53.22 
 
 		 176 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.464073  normal  0.01424 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3392  hypothetical protein  52.81 
 
 		 165 aa  182  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00223  hypothetical protein  52.81 
 
 		 165 aa  182  3e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3379  conserved hypothetical protein  52.81 
 
 		 165 aa  182  3e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3130  transposase and inactivated derivatives  51.98 
 
 		 178 aa  182  3e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0127624  normal  0.415202 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00227  hypothetical protein  52.81 
 
 		 165 aa  182  3e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0240  hypothetical protein  51.69 
 
 		 165 aa  179  2e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2530  hypothetical protein  49.71 
 
 		 179 aa  171  3.9999999999999995e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0352  hypothetical protein  54.97 
 
 		 187 aa  167  8e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.642542  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2531  transposase  53.93 
 
 		 187 aa  167  1e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.719011  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0243  hypothetical protein  48.48 
 
 		 178 aa  165  2.9999999999999998e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.273479  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2478  hypothetical protein  53.74 
 
 		 161 aa  164  5e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0721b  hypothetical protein  57.25 
 
 		 133 aa  160  6e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1888  hypothetical protein  46.3 
 
 		 171 aa  160  1e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.17258  hitchhiker  0.00842787 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0731  hypothetical protein  47.22 
 
 		 176 aa  157  6e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0796  hypothetical protein  49.04 
 
 		 159 aa  155  3e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2835  hypothetical protein  44.38 
 
 		 191 aa  150  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2890  hypothetical protein  43.1 
 
 		 191 aa  149  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0361  hypothetical protein  39.77 
 
 		 191 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2532  hypothetical protein  37.65 
 
 		 157 aa  101  5e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709096 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2244  transposase  34.73 
 
 		 161 aa  72.4  0.000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.196666  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1888b  hypothetical protein  58.7 
 
 		 101 aa  59.7  0.00000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0301  hypothetical protein  58.7 
 
 		 91 aa  59.3  0.00000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1552  hypothetical protein  28.47 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0339239 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3277  protein of unknown function DUF1568  33.96 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1784  hypothetical protein  33.86 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4707  hypothetical protein  33.33 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3477  hypothetical protein  24.84 
 
 		 188 aa  53.1  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.379705  normal  0.40189 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3612  hypothetical protein  24.68 
 
 		 201 aa  52.4  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0368765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0347  hypothetical protein  30.83 
 
 		 158 aa  51.6  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.119312  normal  0.0189577 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1136  hypothetical protein  23.46 
 
 		 192 aa  49.7  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1068  hypothetical protein  30.67 
 
 		 179 aa  49.7  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0377724 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3154  hypothetical protein  43.75 
 
 		 58 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0787684 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2264  transposase and inactivated derivatives  22.03 
 
 		 323 aa  49.3  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.88974  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0489  hypothetical protein  26.63 
 
 		 310 aa  49.3  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.448467 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3286  protein of unknown function DUF1568  32.08 
 
 		 214 aa  49.3  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00118326  unclonable  0.0000000135739 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1802  protein of unknown function DUF1568  25.85 
 
 		 240 aa  49.3  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1489  hypothetical protein  31.18 
 
 		 153 aa  48.5  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4462  hypothetical protein  24.11 
 
 		 152 aa  48.5  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2607  protein of unknown function DUF1568  28.8 
 
 		 186 aa  48.5  0.00006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.407993  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1032  protein of unknown function DUF1568  24.62 
 
 		 326 aa  48.5  0.00006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1574  hypothetical protein  28.47 
 
 		 150 aa  48.1  0.00006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.620864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3712  hypothetical protein  27.56 
 
 		 177 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013542 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2563  hypothetical protein  29.71 
 
 		 176 aa  47  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000213064  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3026  hypothetical protein  48.84 
 
 		 76 aa  47  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.247877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1364  hypothetical protein  24.14 
 
 		 150 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0968684  normal  0.0104776 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3976  protein of unknown function DUF1568  26.27 
 
 		 151 aa  47  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.183049  normal  0.223747 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2265  transposase and inactivated derivatives  22.37 
 
 		 241 aa  46.2  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0885  protein of unknown function DUF1568  26.17 
 
 		 169 aa  47  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1676  hypothetical protein  27.56 
 
 		 157 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1272  hypothetical protein  27.59 
 
 		 196 aa  46.2  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0311  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  29.06 
 
 		 1372 aa  46.2  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.220801 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1975  hypothetical protein  22.76 
 
 		 163 aa  45.4  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121263 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4599  hypothetical protein  25.71 
 
 		 160 aa  45.4  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1620  hypothetical protein  25 
 
 		 313 aa  45.4  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2086  hypothetical protein  25 
 
 		 321 aa  45.4  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.464464  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3078  protein of unknown function DUF1568  21.14 
 
 		 190 aa  45.4  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3248  protein of unknown function DUF1568  20.9 
 
 		 181 aa  45.1  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00178625  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2932  hypothetical protein  22.95 
 
 		 234 aa  44.7  0.0009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.56667  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0337  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  28.89 
 
 		 1345 aa  44.3  0.0009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.038664  normal  0.920027 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1450  hypothetical protein  24.53 
 
 		 203 aa  43.9  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3465  hypothetical protein  30.25 
 
 		 150 aa  43.9  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3105  protein of unknown function DUF1568  20.57 
 
 		 192 aa  44.3  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000625853  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1966  hypothetical protein  28.95 
 
 		 231 aa  43.5  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.74185  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0793  hypothetical protein  22.78 
 
 		 314 aa  43.5  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3919  hypothetical protein  27.89 
 
 		 151 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0968412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0595  hypothetical protein  21.43 
 
 		 258 aa  43.5  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.217159  hitchhiker  2.03187e-17 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0568  hypothetical protein  31.25 
 
 		 151 aa  42.7  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.853287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0682  hypothetical protein  23.72 
 
 		 232 aa  42.7  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.349284  normal  0.584525 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0825  hypothetical protein  26.7 
 
 		 204 aa  42.4  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0607  hypothetical protein  31.25 
 
 		 151 aa  42.7  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5176  hypothetical protein  27.66 
 
 		 184 aa  42.4  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00299086  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0262  hypothetical protein  25.81 
 
 		 152 aa  42.4  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0995  hypothetical protein  30.59 
 
 		 163 aa  42.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1024  hypothetical protein  30.59 
 
 		 163 aa  42.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0275616 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1725  hypothetical protein  22.3 
 
 		 248 aa  42  0.005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4223  hypothetical protein  26.67 
 
 		 212 aa  42  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.228925 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0613  hypothetical protein  28.12 
 
 		 151 aa  42  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.018198 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1724  hypothetical protein  22.3 
 
 		 248 aa  42  0.006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5083  hypothetical protein  27.66 
 
 		 151 aa  41.6  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.268045  normal  0.309651 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0788  hypothetical protein  23.4 
 
 		 150 aa  41.6  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1453  hypothetical protein  23.27 
 
 		 203 aa  41.6  0.006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0136  transposase  23.93 
 
 		 236 aa  41.6  0.007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1685  hypothetical protein  24.11 
 
 		 149 aa  41.6  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.365398  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>