57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0825 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0825  hypothetical protein  100 
 
 		 204 aa  422  1e-117  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2720  hypothetical protein  59.05 
 
 		 232 aa  251  6e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1068  hypothetical protein  49 
 
 		 179 aa  192  4e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0377724 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2451  hypothetical protein  45.05 
 
 		 201 aa  176  2e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.875999 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3252  hypothetical protein  44.22 
 
 		 174 aa  172  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2844  hypothetical protein  44.79 
 
 		 168 aa  171  7.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0508  hypothetical protein  42.57 
 
 		 197 aa  167  1e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1272  hypothetical protein  44.28 
 
 		 196 aa  166  2e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2335  hypothetical protein  45.75 
 
 		 198 aa  164  5.9999999999999996e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000417097  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0300  hypothetical protein  44.28 
 
 		 193 aa  164  6.9999999999999995e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.401229  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1450  hypothetical protein  46.39 
 
 		 203 aa  164  8e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1453  hypothetical protein  47.12 
 
 		 203 aa  163  1.0000000000000001e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2260  hypothetical protein  42.65 
 
 		 207 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000303912  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3321  hypothetical protein  43.14 
 
 		 197 aa  160  2e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.873195  hitchhiker  0.0000029094 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1527  hypothetical protein  44.06 
 
 		 199 aa  159  3e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0837  hypothetical protein  47 
 
 		 206 aa  158  5e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0544  hypothetical protein  42.6 
 
 		 221 aa  151  5.9999999999999996e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0995  hypothetical protein  39.8 
 
 		 163 aa  150  8e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0554  hypothetical protein  40.41 
 
 		 177 aa  151  8e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1024  hypothetical protein  39.8 
 
 		 163 aa  150  8.999999999999999e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0275616 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2688  hypothetical protein  42.47 
 
 		 239 aa  149  3e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.968577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0315  hypothetical protein  43.48 
 
 		 197 aa  147  7e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1136  hypothetical protein  40 
 
 		 192 aa  145  3e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1806  hypothetical protein  41.71 
 
 		 220 aa  144  1e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.929401  normal  0.508252 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1092  hypothetical protein  42.05 
 
 		 223 aa  143  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.462205  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0440  hypothetical protein  38.79 
 
 		 251 aa  141  6e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0284  hypothetical protein  40.41 
 
 		 187 aa  141  7e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0459  protein of unknown function DUF1568  38.07 
 
 		 219 aa  140  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1035  hypothetical protein  40.19 
 
 		 224 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0472  protein of unknown function DUF1568  38.46 
 
 		 185 aa  138  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.527235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1123  hypothetical protein  39.5 
 
 		 198 aa  137  7.999999999999999e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0181  hypothetical protein  37.19 
 
 		 200 aa  136  2e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1141  hypothetical protein  40.5 
 
 		 204 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343798  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2426  hypothetical protein  37.37 
 
 		 249 aa  125  3e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.763748  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2239  hypothetical protein  38.69 
 
 		 193 aa  125  4.0000000000000003e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.892224 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1423  hypothetical protein  36.22 
 
 		 190 aa  122  5e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0723696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1350  hypothetical protein  30.89 
 
 		 258 aa  115  3e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0718437  normal  0.104355 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1437  hypothetical protein  34.52 
 
 		 200 aa  101  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0555  hypothetical protein  38.46 
 
 		 127 aa  101  9e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0779  hypothetical protein  58.75 
 
 		 107 aa  99  4e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1529  hypothetical protein  30.85 
 
 		 192 aa  95.1  6e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4519  hypothetical protein  36.89 
 
 		 152 aa  71.2  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1133  hypothetical protein  23.53 
 
 		 153 aa  51.6  0.000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000547954  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2775  hypothetical protein  40.28 
 
 		 129 aa  51.2  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.963752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1352  hypothetical protein  37.5 
 
 		 172 aa  50.4  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0376314  normal  0.0977946 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1351  hypothetical protein  37.04 
 
 		 165 aa  49.7  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0430442  normal  0.0970629 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1685  hypothetical protein  21.89 
 
 		 149 aa  47  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.365398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4373  hypothetical protein  26.16 
 
 		 178 aa  46.2  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.295832  normal  0.0449373 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0243  hypothetical protein  21.26 
 
 		 178 aa  45.1  0.0008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.273479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1364  hypothetical protein  32.76 
 
 		 150 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0968684  normal  0.0104776 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3286  protein of unknown function DUF1568  29.75 
 
 		 214 aa  43.1  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00118326  unclonable  0.0000000135739 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1952  hypothetical protein  23.84 
 
 		 178 aa  43.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1685  transposase, putative  26.7 
 
 		 184 aa  42.4  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.207714 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1966  hypothetical protein  34.48 
 
 		 231 aa  42.4  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.74185  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0788  hypothetical protein  20.93 
 
 		 150 aa  42  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3702  hypothetical protein  28.57 
 
 		 208 aa  41.6  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000809832 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4707  hypothetical protein  22.41 
 
 		 152 aa  41.2  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>